MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010001	TTA	2	6	22097	22102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010001	TCT	2	6	22168	22173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010001	GAAAT	2	10	22190	22199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010001	AATTT	2	10	22215	22224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010001	GAT	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010001	AAC	2	6	22353	22358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878174
507	NC_010001	TAA	2	6	22381	22386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878174
508	NC_010001	TGG	2	6	22399	22404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878174
509	NC_010001	TA	3	6	22458	22463	50 %	50 %	0 %	0 %	160878174
510	NC_010001	A	7	7	22477	22483	100 %	0 %	0 %	0 %	160878174
511	NC_010001	ATT	2	6	22498	22503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878174
512	NC_010001	T	7	7	22513	22519	0 %	100 %	0 %	0 %	160878174
513	NC_010001	T	7	7	22537	22543	0 %	100 %	0 %	0 %	160878174
514	NC_010001	TAT	2	6	22547	22552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878174
515	NC_010001	AAG	2	6	22572	22577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878174
516	NC_010001	AGCTA	2	10	22606	22615	40 %	20 %	20 %	20 %	160878174
517	NC_010001	GAG	2	6	22616	22621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878174
518	NC_010001	CAG	2	6	22635	22640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878174
519	NC_010001	TTA	2	6	22641	22646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878174
520	NC_010001	ATAG	2	8	22655	22662	50 %	25 %	25 %	0 %	160878174
521	NC_010001	TTC	2	6	22708	22713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878174
522	NC_010001	AAT	2	6	22762	22767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878174
523	NC_010001	GGT	2	6	22802	22807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878174
524	NC_010001	TGT	2	6	22822	22827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878174
525	NC_010001	CT	3	6	22915	22920	0 %	50 %	0 %	50 %	160878174
526	NC_010001	TGT	2	6	22921	22926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878174
527	NC_010001	TAAT	2	8	22977	22984	50 %	50 %	0 %	0 %	160878174
528	NC_010001	AAAT	2	8	23122	23129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010001	TA	3	6	23163	23168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010001	TTA	2	6	23181	23186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010001	ATA	2	6	23249	23254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010001	AAT	2	6	23264	23269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010001	AGG	2	6	23315	23320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010001	A	6	6	23324	23329	100 %	0 %	0 %	0 %	160878175
535	NC_010001	T	6	6	23335	23340	0 %	100 %	0 %	0 %	160878175
536	NC_010001	GAA	2	6	23359	23364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878175
537	NC_010001	A	6	6	23368	23373	100 %	0 %	0 %	0 %	160878175
538	NC_010001	ACA	2	6	23404	23409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878175
539	NC_010001	CAT	2	6	23414	23419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878175
540	NC_010001	AAG	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878175
541	NC_010001	AAG	2	6	23447	23452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878175
542	NC_010001	GTG	2	6	23492	23497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878175
543	NC_010001	CTA	2	6	23507	23512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878175
544	NC_010001	AGA	2	6	23514	23519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878175
545	NC_010001	AAG	2	6	23537	23542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878175
546	NC_010001	AAG	2	6	23630	23635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878175
547	NC_010001	ATT	2	6	23679	23684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878175
548	NC_010001	GCT	2	6	23686	23691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878175
549	NC_010001	GAT	2	6	23734	23739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878175
550	NC_010001	AT	3	6	23791	23796	50 %	50 %	0 %	0 %	160878175
551	NC_010001	ATT	2	6	23812	23817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878175
552	NC_010001	AAT	2	6	23978	23983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878175
553	NC_010001	TG	3	6	24039	24044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010001	ATT	2	6	24058	24063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010001	GATAA	2	10	24145	24154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010001	AGG	2	6	24173	24178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010001	TGC	2	6	24287	24292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878176
558	NC_010001	AAATG	2	10	24314	24323	60 %	20 %	20 %	0 %	160878176
559	NC_010001	TGG	2	6	24377	24382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878176
560	NC_010001	ATTT	2	8	24415	24422	25 %	75 %	0 %	0 %	160878176
561	NC_010001	AGA	2	6	24440	24445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878176
562	NC_010001	ATG	2	6	24447	24452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878176
563	NC_010001	ACA	2	6	24522	24527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878176
564	NC_010001	TAA	2	6	24599	24604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878176
565	NC_010001	AGT	2	6	24617	24622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878176
566	NC_010001	ATG	2	6	24660	24665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878176
567	NC_010001	TAA	2	6	24740	24745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878176
568	NC_010001	TAA	2	6	24842	24847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878176
569	NC_010001	GAA	2	6	24852	24857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878176
570	NC_010001	GCT	2	6	24876	24881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878176
571	NC_010001	GTA	2	6	24996	25001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878176
572	NC_010001	CTTT	2	8	25039	25046	0 %	75 %	0 %	25 %	160878176
573	NC_010001	AGA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878176
574	NC_010001	AAG	2	6	25089	25094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878176
575	NC_010001	GAAG	2	8	25157	25164	50 %	0 %	50 %	0 %	160878176
576	NC_010001	AATT	2	8	25201	25208	50 %	50 %	0 %	0 %	160878176
577	NC_010001	TAAA	2	8	25276	25283	75 %	25 %	0 %	0 %	160878176
578	NC_010001	TGG	2	6	25310	25315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878176
579	NC_010001	GCA	2	6	25317	25322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878176
580	NC_010001	AAT	2	6	25353	25358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878176
581	NC_010001	GAA	2	6	25390	25395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878176
582	NC_010001	AG	3	6	25413	25418	50 %	0 %	50 %	0 %	160878176
583	NC_010001	GGC	2	6	25427	25432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160878176
584	NC_010001	ATGGT	2	10	25441	25450	20 %	40 %	40 %	0 %	160878176
585	NC_010001	CTT	2	6	25481	25486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878176
586	NC_010001	ATC	2	6	25523	25528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878176
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588	NC_010001	AGC	2	6	25612	25617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878176
589	NC_010001	AT	3	6	25648	25653	50 %	50 %	0 %	0 %	160878176
590	NC_010001	CAG	2	6	25660	25665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878176
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592	NC_010001	TCA	2	6	25767	25772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878176
593	NC_010001	AAG	2	6	25774	25779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878176
594	NC_010001	AGA	2	6	25802	25807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878176
595	NC_010001	TAA	2	6	25811	25816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878176
596	NC_010001	ATT	3	9	25833	25841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878176
597	NC_010001	GCA	2	6	25872	25877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878176
598	NC_010001	TTA	2	6	25887	25892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878176
599	NC_010001	AAG	2	6	25894	25899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878176
600	NC_010001	TAGT	2	8	25915	25922	25 %	50 %	25 %	0 %	160878176
601	NC_010001	AGCAA	2	10	25948	25957	60 %	0 %	20 %	20 %	160878176
602	NC_010001	AAAG	2	8	25965	25972	75 %	0 %	25 %	0 %	160878176
603	NC_010001	AG	3	6	25996	26001	50 %	0 %	50 %	0 %	160878176
604	NC_010001	ATT	2	6	26105	26110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878176
605	NC_010001	TAC	2	6	26126	26131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878176
606	NC_010001	GTA	2	6	26139	26144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878176
607	NC_010001	TAA	2	6	26176	26181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010001	AT	3	6	26224	26229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010001	TAATTA	2	12	26257	26268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010001	T	7	7	26305	26311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010001	TAAGT	2	10	26321	26330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010001	TAA	2	6	26338	26343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010001	AT	3	6	26387	26392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010001	TTA	2	6	26495	26500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010001	TTGA	2	8	26505	26512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010001	AGG	2	6	26518	26523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010001	TTG	2	6	26548	26553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878177
618	NC_010001	GAACTT	2	12	26583	26594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	160878177
619	NC_010001	ATG	2	6	26626	26631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878177
620	NC_010001	GT	3	6	26718	26723	0 %	50 %	50 %	0 %	160878177
621	NC_010001	AGA	2	6	26724	26729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878177
622	NC_010001	ATT	2	6	26754	26759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878177
623	NC_010001	GAT	2	6	26775	26780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878177
624	NC_010001	GAT	2	6	26817	26822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878177
625	NC_010001	GAG	2	6	26847	26852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878177
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628	NC_010001	TTAAA	2	10	26938	26947	60 %	40 %	0 %	0 %	160878177
629	NC_010001	GGA	2	6	26975	26980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878177
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