MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010001	AAAAT	2	10	266044	266053	80 %	20 %	0 %	0 %	160878375
6002	NC_010001	AAG	2	6	266067	266072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_010001	TTAA	2	8	266110	266117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010001	T	6	6	266121	266126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_010001	ATT	2	6	266214	266219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_010001	ATA	2	6	266239	266244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_010001	GAA	3	9	266249	266257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_010001	ATA	2	6	266293	266298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_010001	T	6	6	266324	266329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_010001	TTCATG	2	12	266352	266363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6011	NC_010001	AAT	2	6	266373	266378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_010001	GAAA	2	8	266387	266394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010001	TTTC	2	8	266403	266410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_010001	TAC	2	6	266418	266423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_010001	CA	3	6	266485	266490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_010001	GTT	2	6	266498	266503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010001	AAAG	2	8	266533	266540	75 %	0 %	25 %	0 %	160878376
6018	NC_010001	ATCAA	2	10	266577	266586	60 %	20 %	0 %	20 %	160878376
6019	NC_010001	ATCAA	2	10	266619	266628	60 %	20 %	0 %	20 %	160878376
6020	NC_010001	GCACCG	2	12	266678	266689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	160878376
6021	NC_010001	AGAA	2	8	266729	266736	75 %	0 %	25 %	0 %	160878376
6022	NC_010001	TGAGTT	2	12	266743	266754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	160878376
6023	NC_010001	TAA	2	6	266805	266810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878376
6024	NC_010001	TTA	2	6	266863	266868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878376
6025	NC_010001	GCTT	2	8	266938	266945	0 %	50 %	25 %	25 %	160878376
6026	NC_010001	GAT	2	6	266948	266953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878376
6027	NC_010001	GGT	2	6	266954	266959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878376
6028	NC_010001	GA	3	6	266977	266982	50 %	0 %	50 %	0 %	160878376
6029	NC_010001	GA	3	6	267026	267031	50 %	0 %	50 %	0 %	160878376
6030	NC_010001	A	6	6	267046	267051	100 %	0 %	0 %	0 %	160878376
6031	NC_010001	AACA	2	8	267130	267137	75 %	0 %	0 %	25 %	160878376
6032	NC_010001	ATC	2	6	267159	267164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878376
6033	NC_010001	TAT	2	6	267247	267252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878376
6034	NC_010001	CCT	2	6	267351	267356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878376
6035	NC_010001	TAC	2	6	267358	267363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878376
6036	NC_010001	GAA	2	6	267374	267379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878376
6037	NC_010001	GAA	2	6	267599	267604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878376
6038	NC_010001	AGG	2	6	267613	267618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878376
6039	NC_010001	AGAA	2	8	267632	267639	75 %	0 %	25 %	0 %	160878376
6040	NC_010001	GTT	2	6	267683	267688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878376
6041	NC_010001	GA	3	6	267782	267787	50 %	0 %	50 %	0 %	160878376
6042	NC_010001	GTT	2	6	267800	267805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878376
6043	NC_010001	TAC	2	6	267806	267811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878376
6044	NC_010001	TCCGA	2	10	267818	267827	20 %	20 %	20 %	40 %	160878376
6045	NC_010001	ATT	2	6	267840	267845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878376
6046	NC_010001	TA	3	6	267855	267860	50 %	50 %	0 %	0 %	160878376
6047	NC_010001	ATG	2	6	267873	267878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878376
6048	NC_010001	GAAGA	2	10	267897	267906	60 %	0 %	40 %	0 %	160878376
6049	NC_010001	GTG	2	6	267966	267971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878376
6050	NC_010001	TTG	2	6	267973	267978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878376
6051	NC_010001	GAA	2	6	267998	268003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878376
6052	NC_010001	GGA	2	6	268064	268069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878376
6053	NC_010001	TA	3	6	268095	268100	50 %	50 %	0 %	0 %	160878376
6054	NC_010001	TAT	2	6	268122	268127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878376
6055	NC_010001	GTA	2	6	268149	268154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878376
6056	NC_010001	ATG	2	6	268179	268184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878376
6057	NC_010001	AAG	2	6	268185	268190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878376
6058	NC_010001	ATG	2	6	268286	268291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878376
6059	NC_010001	ATT	2	6	268407	268412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878376
6060	NC_010001	GAA	3	9	268478	268486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878376
6061	NC_010001	CAT	2	6	268528	268533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878376
6062	NC_010001	AT	3	6	268595	268600	50 %	50 %	0 %	0 %	160878376
6063	NC_010001	ACT	2	6	268628	268633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878376
6064	NC_010001	GTA	2	6	268661	268666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878376
6065	NC_010001	TGG	2	6	268684	268689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878376
6066	NC_010001	TGGA	2	8	268782	268789	25 %	25 %	50 %	0 %	160878376
6067	NC_010001	ACGAT	2	10	268791	268800	40 %	20 %	20 %	20 %	160878376
6068	NC_010001	CAGA	2	8	268955	268962	50 %	0 %	25 %	25 %	160878377
6069	NC_010001	GGTA	2	8	269042	269049	25 %	25 %	50 %	0 %	160878377
6070	NC_010001	A	8	8	269069	269076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_010001	AAG	2	6	269096	269101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010001	A	6	6	269110	269115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_010001	GAA	2	6	269143	269148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878378
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6081	NC_010001	TATCT	2	10	269355	269364	20 %	60 %	0 %	20 %	160878378
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6084	NC_010001	AAG	2	6	269491	269496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878378
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6091	NC_010001	AT	3	6	269687	269692	50 %	50 %	0 %	0 %	160878378
6092	NC_010001	CAT	2	6	269737	269742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878378
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6102	NC_010001	GATA	2	8	269989	269996	50 %	25 %	25 %	0 %	160878378
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6109	NC_010001	A	6	6	270139	270144	100 %	0 %	0 %	0 %	160878378
6110	NC_010001	AAG	2	6	270179	270184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878378
6111	NC_010001	TGG	3	9	270226	270234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878378
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6113	NC_010001	TGG	2	6	270295	270300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878378
6114	NC_010001	TATCA	2	10	270336	270345	40 %	40 %	0 %	20 %	160878378
6115	NC_010001	GA	3	6	270398	270403	50 %	0 %	50 %	0 %	160878378
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6119	NC_010001	AGA	2	6	270463	270468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878378
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6125	NC_010001	GTT	2	6	270647	270652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878378
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6500	NC_010001	TAA	2	6	288028	288033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878390

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