MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010001	CCA	2	6	221175	221180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160878333
5002	NC_010001	ATC	2	6	221198	221203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878333
5003	NC_010001	TTC	2	6	221222	221227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878333
5004	NC_010001	ACAA	2	8	221243	221250	75 %	0 %	0 %	25 %	160878333
5005	NC_010001	T	6	6	221273	221278	0 %	100 %	0 %	0 %	160878333
5006	NC_010001	TTC	2	6	221333	221338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878333
5007	NC_010001	TCA	2	6	221347	221352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878333
5008	NC_010001	ATTG	2	8	221374	221381	25 %	50 %	25 %	0 %	160878333
5009	NC_010001	TGA	2	6	221427	221432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878333
5010	NC_010001	AAT	2	6	221541	221546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878333
5011	NC_010001	TCA	2	6	221547	221552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878333
5012	NC_010001	TCT	2	6	221652	221657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878333
5013	NC_010001	TTTA	2	8	221702	221709	25 %	75 %	0 %	0 %	160878333
5014	NC_010001	GCC	2	6	221861	221866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160878333
5015	NC_010001	GCT	2	6	221937	221942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878333
5016	NC_010001	TCC	2	6	222056	222061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_010001	TGT	2	6	222069	222074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_010001	T	7	7	222076	222082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_010001	CTT	2	6	222083	222088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_010001	GGT	2	6	222138	222143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_010001	TTG	2	6	222168	222173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_010001	GATAAG	2	12	222212	222223	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_010001	T	6	6	222238	222243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_010001	ATTTA	2	10	222259	222268	40 %	60 %	0 %	0 %	160878334
5025	NC_010001	CTT	2	6	222272	222277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878334
5026	NC_010001	TCC	2	6	222341	222346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878334
5027	NC_010001	TCT	2	6	222422	222427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878334
5028	NC_010001	CTT	2	6	222513	222518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878334
5029	NC_010001	GCT	2	6	222578	222583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878334
5030	NC_010001	TTC	2	6	222592	222597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878334
5031	NC_010001	ATA	3	9	222682	222690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878334
5032	NC_010001	CATT	2	8	222716	222723	25 %	50 %	0 %	25 %	160878334
5033	NC_010001	TGT	2	6	222809	222814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878334
5034	NC_010001	TAAA	2	8	222833	222840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010001	AT	3	6	222866	222871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_010001	A	6	6	222889	222894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_010001	A	6	6	222907	222912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_010001	TTA	2	6	222992	222997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_010001	ATT	2	6	223045	223050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_010001	A	6	6	223090	223095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_010001	ATTT	2	8	223111	223118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_010001	ATGTGA	2	12	223218	223229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_010001	TTG	2	6	223371	223376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878335
5044	NC_010001	TAT	2	6	223395	223400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878335
5045	NC_010001	TAA	2	6	223551	223556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878335
5046	NC_010001	GTA	2	6	223568	223573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878335
5047	NC_010001	TAT	2	6	223621	223626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878335
5048	NC_010001	ATAC	2	8	223644	223651	50 %	25 %	0 %	25 %	160878335
5049	NC_010001	ACGA	2	8	223714	223721	50 %	0 %	25 %	25 %	160878335
5050	NC_010001	TAT	2	6	223743	223748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878335
5051	NC_010001	ATT	2	6	223757	223762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878335
5052	NC_010001	A	7	7	223788	223794	100 %	0 %	0 %	0 %	160878335
5053	NC_010001	CAG	2	6	223796	223801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878335
5054	NC_010001	TTTA	2	8	223880	223887	25 %	75 %	0 %	0 %	160878335
5055	NC_010001	GGA	2	6	224019	224024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_010001	AAG	2	6	224048	224053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878336
5057	NC_010001	AGA	2	6	224102	224107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878336
5058	NC_010001	AGC	2	6	224129	224134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878336
5059	NC_010001	GAGTT	2	10	224137	224146	20 %	40 %	40 %	0 %	160878336
5060	NC_010001	TACAAC	2	12	224150	224161	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	160878336
5061	NC_010001	AAG	2	6	224182	224187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878336
5062	NC_010001	CTG	2	6	224263	224268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878336
5063	NC_010001	AGA	2	6	224305	224310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878336
5064	NC_010001	AAGAT	2	10	224320	224329	60 %	20 %	20 %	0 %	160878336
5065	NC_010001	AGA	3	9	224426	224434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878336
5066	NC_010001	TAT	2	6	224535	224540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878336
5067	NC_010001	TTTC	2	8	224549	224556	0 %	75 %	0 %	25 %	160878336
5068	NC_010001	T	6	6	224610	224615	0 %	100 %	0 %	0 %	160878336
5069	NC_010001	GCA	2	6	224646	224651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878336
5070	NC_010001	AGA	2	6	224702	224707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878336
5071	NC_010001	GATG	2	8	224720	224727	25 %	25 %	50 %	0 %	160878336
5072	NC_010001	ATC	2	6	224755	224760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878336
5073	NC_010001	TTG	2	6	224765	224770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878336
5074	NC_010001	GGC	2	6	224916	224921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_010001	ATA	2	6	225011	225016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_010001	AG	3	6	225041	225046	50 %	0 %	50 %	0 %	160878337
5077	NC_010001	CTG	2	6	225112	225117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878337
5078	NC_010001	TCA	2	6	225161	225166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878337
5079	NC_010001	A	7	7	225205	225211	100 %	0 %	0 %	0 %	160878337
5080	NC_010001	TATT	2	8	225221	225228	25 %	75 %	0 %	0 %	160878337
5081	NC_010001	AGG	2	6	225283	225288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878337
5082	NC_010001	TGC	2	6	225317	225322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_010001	GCT	2	6	225341	225346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_010001	GCA	2	6	225361	225366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_010001	GTT	2	6	225387	225392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878338
5086	NC_010001	TCA	2	6	225393	225398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878338
5087	NC_010001	TAT	2	6	225426	225431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878338
5088	NC_010001	AAT	2	6	225447	225452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878338
5089	NC_010001	GGA	2	6	225520	225525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878338
5090	NC_010001	ATT	2	6	225553	225558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878338
5091	NC_010001	ACT	2	6	225582	225587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878338
5092	NC_010001	TAT	2	6	225591	225596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878338
5093	NC_010001	ATT	2	6	225635	225640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878338
5094	NC_010001	TGT	2	6	225665	225670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878338
5095	NC_010001	TAT	2	6	225690	225695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878338
5096	NC_010001	ATCA	2	8	225727	225734	50 %	25 %	0 %	25 %	160878338
5097	NC_010001	TAT	2	6	225747	225752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878338
5098	NC_010001	ATG	3	9	226070	226078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_010001	AAT	2	6	226096	226101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_010001	A	6	6	226151	226156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_010001	TAA	2	6	226174	226179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_010001	ATGA	2	8	226186	226193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_010001	AG	3	6	226204	226209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_010001	ATT	2	6	226215	226220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_010001	TTTA	2	8	226241	226248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_010001	TC	3	6	226257	226262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_010001	T	6	6	226263	226268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_010001	TAA	2	6	226271	226276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_010001	T	6	6	226299	226304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_010001	ATT	2	6	226307	226312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_010001	A	6	6	226347	226352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_010001	TAATC	2	10	226356	226365	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5113	NC_010001	AT	3	6	226409	226414	50 %	50 %	0 %	0 %	160878339
5114	NC_010001	GCA	2	6	226424	226429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878339
5115	NC_010001	GAA	2	6	226445	226450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878339
5116	NC_010001	CATC	2	8	226697	226704	25 %	25 %	0 %	50 %	160878339
5117	NC_010001	GCT	2	6	226804	226809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878339
5118	NC_010001	TTC	2	6	226916	226921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878339
5119	NC_010001	TAC	2	6	226981	226986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878339
5120	NC_010001	CTC	2	6	226992	226997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878339
5121	NC_010001	A	6	6	227039	227044	100 %	0 %	0 %	0 %	160878339
5122	NC_010001	TGG	2	6	227071	227076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878339
5123	NC_010001	TGCT	2	8	227359	227366	0 %	50 %	25 %	25 %	160878339
5124	NC_010001	A	8	8	227414	227421	100 %	0 %	0 %	0 %	160878339
5125	NC_010001	TCT	2	6	227429	227434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878339
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5127	NC_010001	AGG	2	6	227466	227471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878339
5128	NC_010001	GAA	2	6	227521	227526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878339
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5131	NC_010001	A	6	6	227655	227660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5157	NC_010001	ATT	2	6	228836	228841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_010001	TACTT	2	10	228890	228899	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5161	NC_010001	TAA	2	6	229001	229006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5255	NC_010001	AC	3	6	232906	232911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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