MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome

Total Repeats: 43015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009954	GCT	2	6	166426	166431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040729
3502	NC_009954	TTA	2	6	166465	166470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040729
3503	NC_009954	TCA	2	6	166474	166479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040729
3504	NC_009954	CTT	2	6	166539	166544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040729
3505	NC_009954	CTC	2	6	166576	166581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040729
3506	NC_009954	TTCA	2	8	166611	166618	25 %	50 %	0 %	25 %	159040729
3507	NC_009954	TCT	2	6	166707	166712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040729
3508	NC_009954	TTC	2	6	166789	166794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040729
3509	NC_009954	CTT	2	6	166830	166835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040729
3510	NC_009954	TCAA	2	8	166876	166883	50 %	25 %	0 %	25 %	159040729
3511	NC_009954	CTTATC	2	12	166893	166904	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159040729
3512	NC_009954	ACC	2	6	166914	166919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040729
3513	NC_009954	AAT	2	6	166977	166982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040729
3514	NC_009954	TTC	2	6	167014	167019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040729
3515	NC_009954	ATT	2	6	167037	167042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040729
3516	NC_009954	TTA	2	6	167114	167119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040729
3517	NC_009954	CTTCT	2	10	167134	167143	0 %	60 %	0 %	40 %	159040729
3518	NC_009954	TTCA	2	8	167163	167170	25 %	50 %	0 %	25 %	159040729
3519	NC_009954	CAT	2	6	167204	167209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040729
3520	NC_009954	TCT	3	9	167234	167242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040729
3521	NC_009954	CTC	2	6	167247	167252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040729
3522	NC_009954	AAC	2	6	167282	167287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_009954	AT	3	6	167291	167296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_009954	ACC	2	6	167320	167325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_009954	AAGGC	2	10	167428	167437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3526	NC_009954	TAT	2	6	167526	167531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040730
3527	NC_009954	GAG	2	6	167568	167573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040730
3528	NC_009954	AGA	2	6	167596	167601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040730
3529	NC_009954	TGA	2	6	167694	167699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040730
3530	NC_009954	TAT	2	6	167706	167711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040730
3531	NC_009954	CTT	2	6	167735	167740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040730
3532	NC_009954	ATG	2	6	167744	167749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040730
3533	NC_009954	GAG	2	6	167754	167759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040730
3534	NC_009954	CCT	2	6	167805	167810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040730
3535	NC_009954	TGA	2	6	167871	167876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040730
3536	NC_009954	TGC	2	6	167940	167945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040730
3537	NC_009954	AAG	2	6	167947	167952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040730
3538	NC_009954	TTG	2	6	167960	167965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040730
3539	NC_009954	ATA	2	6	168046	168051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040730
3540	NC_009954	CTA	2	6	168079	168084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040730
3541	NC_009954	GT	3	6	168107	168112	0 %	50 %	50 %	0 %	159040730
3542	NC_009954	TAA	2	6	168170	168175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040730
3543	NC_009954	CAA	2	6	168206	168211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040730
3544	NC_009954	GAG	2	6	168214	168219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040730
3545	NC_009954	AAG	2	6	168263	168268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040730
3546	NC_009954	AAC	2	6	168275	168280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040730
3547	NC_009954	TCC	2	6	168362	168367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_009954	ATT	2	6	168448	168453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_009954	TTA	2	6	168479	168484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_009954	TCC	2	6	168545	168550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040731
3551	NC_009954	TCCA	2	8	168561	168568	25 %	25 %	0 %	50 %	159040731
3552	NC_009954	CCT	2	6	168693	168698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040731
3553	NC_009954	TTA	2	6	168699	168704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040731
3554	NC_009954	ATC	2	6	168739	168744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040731
3555	NC_009954	AAT	2	6	168749	168754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040731
3556	NC_009954	AAC	2	6	168811	168816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040731
3557	NC_009954	CCCT	2	8	168854	168861	0 %	25 %	0 %	75 %	159040731
3558	NC_009954	CCTC	2	8	168891	168898	0 %	25 %	0 %	75 %	159040731
3559	NC_009954	ACTAT	2	10	168902	168911	40 %	40 %	0 %	20 %	159040731
3560	NC_009954	GTG	2	6	168972	168977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040731
3561	NC_009954	TAC	2	6	169006	169011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040731
3562	NC_009954	GT	3	6	169059	169064	0 %	50 %	50 %	0 %	159040731
3563	NC_009954	TGC	2	6	169072	169077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040731
3564	NC_009954	TGC	2	6	169138	169143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040731
3565	NC_009954	CAT	3	9	169152	169160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040731
3566	NC_009954	ATA	2	6	169193	169198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040731
3567	NC_009954	CAA	2	6	169236	169241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040731
3568	NC_009954	CTC	2	6	169243	169248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040731
3569	NC_009954	CCTACC	2	12	169252	169263	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	159040731
3570	NC_009954	CTG	2	6	169269	169274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040731
3571	NC_009954	CTTA	2	8	169309	169316	25 %	50 %	0 %	25 %	159040731
3572	NC_009954	ATAC	2	8	169422	169429	50 %	25 %	0 %	25 %	159040731
3573	NC_009954	ATT	2	6	169455	169460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_009954	CAA	2	6	169494	169499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040732
3575	NC_009954	TCA	2	6	169583	169588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040732
3576	NC_009954	TAG	3	9	169623	169631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040732
3577	NC_009954	GAA	2	6	169639	169644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040732
3578	NC_009954	TAT	2	6	169645	169650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040732
3579	NC_009954	ACCGGG	2	12	169654	169665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159040732
3580	NC_009954	AGT	2	6	169685	169690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040732
3581	NC_009954	TGC	2	6	169706	169711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040732
3582	NC_009954	GT	3	6	169713	169718	0 %	50 %	50 %	0 %	159040732
3583	NC_009954	TTTA	2	8	169741	169748	25 %	75 %	0 %	0 %	159040732
3584	NC_009954	GTA	2	6	169804	169809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040732
3585	NC_009954	CAT	2	6	169851	169856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040732
3586	NC_009954	TAC	2	6	169860	169865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040732
3587	NC_009954	CTT	2	6	169930	169935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040732
3588	NC_009954	TTC	3	9	169988	169996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040732
3589	NC_009954	TCAATA	2	12	170036	170047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159040732
3590	NC_009954	ATC	2	6	170072	170077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040732
3591	NC_009954	G	6	6	170219	170224	0 %	0 %	100 %	0 %	159040732
3592	NC_009954	CGC	2	6	170287	170292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159040732
3593	NC_009954	AAC	2	6	170296	170301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040732
3594	NC_009954	CTT	2	6	170347	170352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040732
3595	NC_009954	TAG	2	6	170389	170394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040732
3596	NC_009954	AGGT	2	8	170431	170438	25 %	25 %	50 %	0 %	159040732
3597	NC_009954	TAT	2	6	170521	170526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040732
3598	NC_009954	CTT	2	6	170611	170616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040732
3599	NC_009954	TAT	2	6	170623	170628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040732
3600	NC_009954	CAC	2	6	170659	170664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040732
3601	NC_009954	TCC	2	6	170666	170671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040732
3602	NC_009954	TTA	2	6	170672	170677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040732
3603	NC_009954	AACC	2	8	170684	170691	50 %	0 %	0 %	50 %	159040732
3604	NC_009954	ATT	2	6	170815	170820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040732
3605	NC_009954	GTT	2	6	170825	170830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040732
3606	NC_009954	TAAC	2	8	170868	170875	50 %	25 %	0 %	25 %	159040732
3607	NC_009954	GCC	2	6	170980	170985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159040732
3608	NC_009954	GAA	2	6	171016	171021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040732
3609	NC_009954	CTC	2	6	171091	171096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040732
3610	NC_009954	ATT	2	6	171185	171190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040732
3611	NC_009954	GAA	2	6	171229	171234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040732
3612	NC_009954	CAT	2	6	171246	171251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040732
3613	NC_009954	TCA	2	6	171272	171277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040732
3614	NC_009954	CATT	2	8	171279	171286	25 %	50 %	0 %	25 %	159040732
3615	NC_009954	CCT	2	6	171298	171303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040732
3616	NC_009954	AGAACC	2	12	171305	171316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	159040732
3617	NC_009954	CCT	2	6	171369	171374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040732
3618	NC_009954	GGT	2	6	171440	171445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040732
3619	NC_009954	CTC	2	6	171493	171498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040732
3620	NC_009954	CTC	2	6	171514	171519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040732
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3622	NC_009954	ACC	3	9	171688	171696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040732
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3999	NC_009954	ATT	2	6	189984	189989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040748
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