MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome

Total Repeats: 43015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009954	ACC	2	6	143247	143252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040708
3002	NC_009954	TAA	2	6	143258	143263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040708
3003	NC_009954	CAT	2	6	143290	143295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040708
3004	NC_009954	TAC	2	6	143304	143309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040708
3005	NC_009954	GAG	2	6	143343	143348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040708
3006	NC_009954	AT	3	6	143381	143386	50 %	50 %	0 %	0 %	159040708
3007	NC_009954	TGT	2	6	143483	143488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040708
3008	NC_009954	CCA	2	6	143493	143498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040708
3009	NC_009954	TA	3	6	143519	143524	50 %	50 %	0 %	0 %	159040708
3010	NC_009954	ATATT	2	10	143551	143560	40 %	60 %	0 %	0 %	159040708
3011	NC_009954	TAC	2	6	143587	143592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040708
3012	NC_009954	TTCA	2	8	143610	143617	25 %	50 %	0 %	25 %	159040708
3013	NC_009954	GAC	2	6	143630	143635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040708
3014	NC_009954	CGT	2	6	143669	143674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040708
3015	NC_009954	TAC	2	6	143733	143738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040708
3016	NC_009954	AGT	2	6	143845	143850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040709
3017	NC_009954	CA	3	6	143948	143953	50 %	0 %	0 %	50 %	159040709
3018	NC_009954	ATG	2	6	143978	143983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_009954	CAT	2	6	144001	144006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_009954	CAC	2	6	144024	144029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_009954	GGA	2	6	144037	144042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_009954	TGA	2	6	144122	144127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040710
3023	NC_009954	TAG	2	6	144138	144143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040710
3024	NC_009954	AGG	2	6	144187	144192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040710
3025	NC_009954	GAT	2	6	144205	144210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040710
3026	NC_009954	TGA	2	6	144249	144254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040710
3027	NC_009954	AAG	2	6	144262	144267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040710
3028	NC_009954	TGA	2	6	144270	144275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040710
3029	NC_009954	TGA	2	6	144345	144350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040710
3030	NC_009954	AGG	2	6	144359	144364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040710
3031	NC_009954	AGC	2	6	144420	144425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040710
3032	NC_009954	AGC	2	6	144469	144474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040710
3033	NC_009954	CAC	3	9	144485	144493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040710
3034	NC_009954	ATG	2	6	144498	144503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040710
3035	NC_009954	AGCC	2	8	144576	144583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_009954	TAT	2	6	144712	144717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_009954	TAA	2	6	144751	144756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_009954	ATTA	2	8	144808	144815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009954	CTTCGT	2	12	144866	144877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159040711
3040	NC_009954	CTC	2	6	144891	144896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040711
3041	NC_009954	TAG	2	6	145058	145063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040711
3042	NC_009954	AAT	3	9	145094	145102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040711
3043	NC_009954	TCCTAA	2	12	145111	145122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040711
3044	NC_009954	TAA	2	6	145153	145158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040711
3045	NC_009954	CGA	2	6	145207	145212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040711
3046	NC_009954	CTC	2	6	145290	145295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040711
3047	NC_009954	AAT	2	6	145361	145366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040711
3048	NC_009954	GTTGA	2	10	145406	145415	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_009954	TCG	2	6	145434	145439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_009954	ATG	2	6	145444	145449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009954	CTT	2	6	145456	145461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_009954	TAA	2	6	145514	145519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_009954	GCA	2	6	145522	145527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_009954	AGTAT	2	10	145575	145584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_009954	ATT	2	6	145603	145608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_009954	AAG	2	6	145640	145645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_009954	GTA	2	6	145679	145684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_009954	GAG	2	6	145742	145747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_009954	TTG	2	6	145777	145782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_009954	GTA	2	6	145783	145788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_009954	CTT	2	6	145808	145813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_009954	CCA	2	6	145834	145839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_009954	ATT	2	6	145844	145849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_009954	TCT	2	6	145853	145858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_009954	TTAA	2	8	145979	145986	50 %	50 %	0 %	0 %	159040712
3066	NC_009954	ATA	2	6	146041	146046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040712
3067	NC_009954	CAA	2	6	146052	146057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040712
3068	NC_009954	CAT	2	6	146058	146063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040712
3069	NC_009954	ATCA	2	8	146152	146159	50 %	25 %	0 %	25 %	159040712
3070	NC_009954	ACT	2	6	146276	146281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040712
3071	NC_009954	GGT	2	6	146330	146335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040712
3072	NC_009954	CCT	2	6	146382	146387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040712
3073	NC_009954	TTACC	2	10	146451	146460	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3074	NC_009954	CTT	2	6	146465	146470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_009954	ATT	2	6	146485	146490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_009954	CAT	2	6	146511	146516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_009954	ATA	2	6	146667	146672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_009954	GTG	2	6	146680	146685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_009954	ATTA	2	8	146721	146728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_009954	AAT	2	6	146763	146768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_009954	ATA	2	6	146788	146793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_009954	CTG	2	6	146796	146801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_009954	TAA	5	15	146843	146857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_009954	GAG	2	6	146890	146895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_009954	CTC	2	6	146970	146975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_009954	GAA	2	6	146993	146998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_009954	ATT	2	6	147011	147016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_009954	AATAAA	2	12	147066	147077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009954	CT	3	6	147095	147100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_009954	TAAA	2	8	147126	147133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_009954	TAAGG	2	10	147135	147144	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_009954	ATG	2	6	147195	147200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_009954	CTTC	2	8	147225	147232	0 %	50 %	0 %	50 %	159040713
3094	NC_009954	TCATT	2	10	147248	147257	20 %	60 %	0 %	20 %	159040713
3095	NC_009954	ACGGC	2	10	147275	147284	20 %	0 %	40 %	40 %	159040713
3096	NC_009954	ATTG	2	8	147285	147292	25 %	50 %	25 %	0 %	159040713
3097	NC_009954	AAT	2	6	147397	147402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040713
3098	NC_009954	ATA	2	6	147472	147477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040713
3099	NC_009954	GGT	2	6	147552	147557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040713
3100	NC_009954	CTG	2	6	147581	147586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040713
3101	NC_009954	CTT	2	6	147594	147599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040713
3102	NC_009954	ATC	2	6	147687	147692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040713
3103	NC_009954	TAACA	2	10	147825	147834	60 %	20 %	0 %	20 %	159040713
3104	NC_009954	TTA	3	9	147939	147947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040713
3105	NC_009954	CTG	2	6	148068	148073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040714
3106	NC_009954	GTG	2	6	148131	148136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040714
3107	NC_009954	CCA	2	6	148167	148172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040714
3108	NC_009954	TCA	2	6	148206	148211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040714
3109	NC_009954	GGA	2	6	148228	148233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040714
3110	NC_009954	ACT	2	6	148259	148264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040714
3111	NC_009954	TC	3	6	148274	148279	0 %	50 %	0 %	50 %	159040714
3112	NC_009954	CAAC	2	8	148347	148354	50 %	0 %	0 %	50 %	159040714
3113	NC_009954	TTG	2	6	148495	148500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040714
3114	NC_009954	AGG	2	6	148548	148553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040714
3115	NC_009954	GAG	2	6	148569	148574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040714
3116	NC_009954	TGA	2	6	148577	148582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040714
3117	NC_009954	ATT	2	6	148605	148610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040714
3118	NC_009954	AGG	2	6	148612	148617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040714
3119	NC_009954	GAG	2	6	148692	148697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040714
3120	NC_009954	AC	3	6	148716	148721	50 %	0 %	0 %	50 %	159040714
3121	NC_009954	GGT	2	6	148754	148759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040714
3122	NC_009954	GTA	2	6	148783	148788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040715
3123	NC_009954	TAC	2	6	148799	148804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040715
3124	NC_009954	TCA	2	6	148825	148830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040715
3125	NC_009954	TAA	2	6	148850	148855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040715
3126	NC_009954	CAC	2	6	148884	148889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040715
3127	NC_009954	TCCT	2	8	148915	148922	0 %	50 %	0 %	50 %	159040715
3128	NC_009954	TAA	2	6	149009	149014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040715
3129	NC_009954	TGA	3	9	149042	149050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040715
3130	NC_009954	TCAC	2	8	149068	149075	25 %	25 %	0 %	50 %	159040715
3131	NC_009954	CAA	2	6	149081	149086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040715
3132	NC_009954	GCG	2	6	149087	149092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159040715
3133	NC_009954	CA	3	6	149157	149162	50 %	0 %	0 %	50 %	159040715
3134	NC_009954	ACC	2	6	149239	149244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040715
3135	NC_009954	ACCA	2	8	149289	149296	50 %	0 %	0 %	50 %	159040715
3136	NC_009954	TCACGT	2	12	149303	149314	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159040715
3137	NC_009954	AGC	2	6	149342	149347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040715
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3139	NC_009954	GCA	2	6	149467	149472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040715
3140	NC_009954	AACC	2	8	149506	149513	50 %	0 %	0 %	50 %	159040715
3141	NC_009954	ATG	2	6	149521	149526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040715
3142	NC_009954	CCG	2	6	149546	149551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159040715
3143	NC_009954	GTCA	3	12	149585	149596	25 %	25 %	25 %	25 %	159040715
3144	NC_009954	CTT	2	6	149661	149666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040715
3145	NC_009954	ATGG	2	8	149678	149685	25 %	25 %	50 %	0 %	159040715
3146	NC_009954	CTT	2	6	149696	149701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040715
3147	NC_009954	TCA	2	6	149731	149736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040715
3148	NC_009954	TA	3	6	149792	149797	50 %	50 %	0 %	0 %	159040715
3149	NC_009954	TAC	2	6	150053	150058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040715
3150	NC_009954	CTAG	2	8	150070	150077	25 %	25 %	25 %	25 %	159040715
3151	NC_009954	GCC	2	6	150093	150098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159040715
3152	NC_009954	CAG	2	6	150198	150203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_009954	GTTA	2	8	150222	150229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_009954	CAG	2	6	150235	150240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_009954	ATT	2	6	150274	150279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_009954	GCA	2	6	150344	150349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_009954	TGAGGA	2	12	150364	150375	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_009954	ATA	2	6	150426	150431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_009954	CTGC	2	8	150475	150482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3160	NC_009954	TGT	2	6	150574	150579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_009954	ACA	2	6	150594	150599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3162	NC_009954	AAT	2	6	150689	150694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_009954	AG	3	6	150727	150732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_009954	ATT	2	6	150876	150881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_009954	AAG	2	6	150906	150911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_009954	GA	3	6	150921	150926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_009954	TGG	2	6	150932	150937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_009954	GTT	2	6	150942	150947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3169	NC_009954	TAAT	2	8	150965	150972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3170	NC_009954	ATT	2	6	151099	151104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_009954	CAT	2	6	151128	151133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040716
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3199	NC_009954	TTAA	2	8	152538	152545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3200	NC_009954	CTA	2	6	152552	152557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3201	NC_009954	ATA	2	6	152623	152628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3202	NC_009954	CT	3	6	152687	152692	0 %	50 %	0 %	50 %	159040717
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3230	NC_009954	AAT	2	6	154231	154236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040718
3231	NC_009954	TCC	2	6	154317	154322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040718
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3235	NC_009954	TGA	2	6	154449	154454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040718
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3240	NC_009954	CCT	2	6	154722	154727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040718
3241	NC_009954	AGT	2	6	154775	154780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040718
3242	NC_009954	CAC	2	6	154854	154859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040718
3243	NC_009954	GCCT	2	8	154871	154878	0 %	25 %	25 %	50 %	159040718
3244	NC_009954	ACC	2	6	154975	154980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040718
3245	NC_009954	TATCAT	2	12	155017	155028	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159040718
3246	NC_009954	CCA	2	6	155056	155061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040718
3247	NC_009954	AAT	2	6	155120	155125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040718
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3249	NC_009954	CAA	2	6	155142	155147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040718
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3378	NC_009954	AAT	2	6	160743	160748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040724
3379	NC_009954	C	6	6	160798	160803	0 %	0 %	0 %	100 %	159040724
3380	NC_009954	CAT	2	6	160826	160831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040724
3381	NC_009954	AT	4	8	160908	160915	50 %	50 %	0 %	0 %	159040724
3382	NC_009954	CACTT	2	10	160931	160940	20 %	40 %	0 %	40 %	159040724
3383	NC_009954	ATT	2	6	161022	161027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040724
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3413	NC_009954	TAA	2	6	162380	162385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_009954	GCT	2	6	162409	162414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3450	NC_009954	GTG	2	6	164120	164125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3452	NC_009954	TAG	2	6	164166	164171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040726
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3462	NC_009954	TAA	2	6	164789	164794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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