MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON31

Total Repeats: 418

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009795	GAA	2	6	148	153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149597
2	NC_009795	AAT	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149597
3	NC_009795	GTG	2	6	368	373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149597
4	NC_009795	TAG	2	6	435	440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149597
5	NC_009795	AGA	2	6	570	575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149597
6	NC_009795	TGA	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149597
7	NC_009795	TGC	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149597
8	NC_009795	TTA	2	6	653	658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149597
9	NC_009795	TCT	2	6	708	713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149597
10	NC_009795	GAT	2	6	780	785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149597
11	NC_009795	CTT	2	6	829	834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149597
12	NC_009795	AAG	2	6	838	843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149597
13	NC_009795	TAA	2	6	885	890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149597
14	NC_009795	TTA	2	6	919	924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149597
15	NC_009795	ATA	2	6	929	934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149597
16	NC_009795	GCA	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149597
17	NC_009795	TGC	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149597
18	NC_009795	ATG	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149597
19	NC_009795	AAT	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149597
20	NC_009795	ATT	2	6	1284	1289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149597
21	NC_009795	ATA	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149597
22	NC_009795	ATT	3	9	1317	1325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009795	TAA	2	6	1343	1348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009795	TAT	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009795	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009795	ATT	2	6	1378	1383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009795	TAA	2	6	1422	1427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009795	ATA	3	9	1509	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009795	GGT	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149586
30	NC_009795	TGG	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149586
31	NC_009795	TGT	2	6	1886	1891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149586
32	NC_009795	ATG	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149586
33	NC_009795	TAG	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149586
34	NC_009795	GAT	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149586
35	NC_009795	TTA	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149586
36	NC_009795	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149592
37	NC_009795	ATT	2	6	2503	2508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009795	ATA	3	9	2539	2547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009795	ATA	2	6	2589	2594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009795	ATA	2	6	2617	2622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009795	AAC	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009795	ATT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009795	ATT	2	6	2821	2826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009795	AAC	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149590
45	NC_009795	CTT	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149590
46	NC_009795	TAG	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149590
47	NC_009795	TGA	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149590
48	NC_009795	TAA	2	6	3140	3145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149590
49	NC_009795	ACT	2	6	3164	3169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149590
50	NC_009795	AAC	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149590
51	NC_009795	ATA	2	6	3280	3285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149590
52	NC_009795	GAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149590
53	NC_009795	GCT	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149590
54	NC_009795	ACT	2	6	3794	3799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149590
55	NC_009795	AGA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149590
56	NC_009795	GGA	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149590
57	NC_009795	GCG	2	6	4175	4180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149590
58	NC_009795	TAA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149590
59	NC_009795	TTG	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149590
60	NC_009795	ACT	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149590
61	NC_009795	AGC	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149590
62	NC_009795	GCA	2	6	4520	4525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149590
63	NC_009795	ACA	2	6	4535	4540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149590
64	NC_009795	CAA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149590
65	NC_009795	TCA	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149590
66	NC_009795	AAC	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149588
67	NC_009795	CAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
68	NC_009795	TAA	3	9	4844	4852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
69	NC_009795	TAG	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
70	NC_009795	TAA	2	6	4932	4937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
71	NC_009795	TAA	2	6	4941	4946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
72	NC_009795	TTA	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149588
73	NC_009795	ATC	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
74	NC_009795	AAC	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149588
75	NC_009795	TAA	2	6	5211	5216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
76	NC_009795	CAT	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
77	NC_009795	ACG	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149588
78	NC_009795	TAG	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
79	NC_009795	TAA	2	6	5442	5447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
80	NC_009795	AAT	3	9	5485	5493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
81	NC_009795	AAC	2	6	5512	5517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149588
82	NC_009795	TAA	2	6	5568	5573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
83	NC_009795	AGC	2	6	5625	5630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149588
84	NC_009795	AGT	3	9	6042	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
85	NC_009795	TAG	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
86	NC_009795	AAT	2	6	6070	6075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
87	NC_009795	GAT	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
88	NC_009795	GCA	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149588
89	NC_009795	GGA	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149588
90	NC_009795	GGA	2	6	6343	6348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149588
91	NC_009795	TAG	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
92	NC_009795	ATG	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
93	NC_009795	ATC	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
94	NC_009795	TAC	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
95	NC_009795	TAA	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
96	NC_009795	CAC	2	6	7114	7119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149588
97	NC_009795	TGA	2	6	7143	7148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
98	NC_009795	TGC	2	6	7167	7172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149588
99	NC_009795	TCA	3	9	7228	7236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
100	NC_009795	CAT	2	6	7278	7283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
101	NC_009795	AGC	2	6	7287	7292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149588
102	NC_009795	GGT	2	6	7383	7388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149588
103	NC_009795	ATC	2	6	7452	7457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
104	NC_009795	ACA	2	6	7496	7501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149588
105	NC_009795	GCA	2	6	7619	7624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149588
106	NC_009795	ATG	2	6	7766	7771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
107	NC_009795	GTT	2	6	7846	7851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149588
108	NC_009795	AAG	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149588
109	NC_009795	AAG	2	6	7964	7969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149588
110	NC_009795	CAA	2	6	8180	8185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149588
111	NC_009795	GTT	2	6	8194	8199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149588
112	NC_009795	ATC	2	6	8269	8274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
113	NC_009795	TAC	2	6	8315	8320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
114	NC_009795	CAT	2	6	8324	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
115	NC_009795	CTA	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
116	NC_009795	AAC	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149588
117	NC_009795	AGA	2	6	8622	8627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149588
118	NC_009795	ATC	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
119	NC_009795	TAA	2	6	8691	8696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
120	NC_009795	ACA	2	6	8707	8712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149588
121	NC_009795	ACT	2	6	8863	8868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
122	NC_009795	TAA	3	9	8888	8896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149588
123	NC_009795	CAG	2	6	8918	8923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149588
124	NC_009795	TGG	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149588
125	NC_009795	AGC	2	6	8940	8945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149588
126	NC_009795	GCA	3	9	8962	8970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149588
127	NC_009795	ACA	2	6	9007	9012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149588
128	NC_009795	CAT	2	6	9083	9088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
129	NC_009795	GCC	2	6	9136	9141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149588
130	NC_009795	CTA	2	6	9197	9202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149588
131	NC_009795	GGA	2	6	9241	9246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149588
132	NC_009795	GAT	2	6	9370	9375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149588
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.