MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 chromosome

Total Repeats: 3249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009778	GTAAA	2	10	5909	5918	60 %	20 %	20 %	0 %	156932245
2	NC_009778	CTGAA	2	10	6798	6807	40 %	20 %	20 %	20 %	156932248
3	NC_009778	TGGCC	2	10	8805	8814	0 %	20 %	40 %	40 %	156932253
4	NC_009778	GCCGA	2	10	10958	10967	20 %	0 %	40 %	40 %	156932257
5	NC_009778	CGATC	2	10	13323	13332	20 %	20 %	20 %	40 %	156932260
6	NC_009778	AGTGA	2	10	13999	14008	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009778	TTAGC	2	10	17161	17170	20 %	40 %	20 %	20 %	156932266
8	NC_009778	AGCTG	2	10	18785	18794	20 %	20 %	40 %	20 %	156932267
9	NC_009778	TTCTA	2	10	20031	20040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009778	CGGGG	2	10	20683	20692	0 %	0 %	80 %	20 %	156932269
11	NC_009778	GAAAA	2	10	22168	22177	80 %	0 %	20 %	0 %	156932271
12	NC_009778	GCAAC	2	10	23513	23522	40 %	0 %	20 %	40 %	156932273
13	NC_009778	CATCA	2	10	30926	30935	40 %	20 %	0 %	40 %	156932277
14	NC_009778	CGTCG	2	10	31885	31894	0 %	20 %	40 %	40 %	156932278
15	NC_009778	GCAGT	2	10	32890	32899	20 %	20 %	40 %	20 %	156932278
16	NC_009778	CTACA	2	10	33222	33231	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009778	TGGTG	2	10	34115	34124	0 %	40 %	60 %	0 %	156932279
18	NC_009778	AGCGC	2	10	34660	34669	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009778	AAGGC	2	10	35039	35048	40 %	0 %	40 %	20 %	156932280
20	NC_009778	CGCAG	2	10	36820	36829	20 %	0 %	40 %	40 %	156932281
21	NC_009778	AGCGC	2	10	41464	41473	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009778	AGCGC	2	10	41696	41705	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009778	GTCGC	2	10	43699	43708	0 %	20 %	40 %	40 %	156932285
24	NC_009778	AACGC	2	10	43963	43972	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009778	TGCGC	2	10	47907	47916	0 %	20 %	40 %	40 %	156932289
26	NC_009778	ACGCG	2	10	51073	51082	20 %	0 %	40 %	40 %	156932292
27	NC_009778	GGCGC	2	10	51203	51212	0 %	0 %	60 %	40 %	156932292
28	NC_009778	CAGGC	2	10	52205	52214	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009778	TCGCT	2	10	55460	55469	0 %	40 %	20 %	40 %	156932300
30	NC_009778	CGGCG	2	10	55719	55728	0 %	0 %	60 %	40 %	156932300
31	NC_009778	CTGGG	2	10	56643	56652	0 %	20 %	60 %	20 %	156932301
32	NC_009778	CGCTT	2	10	58422	58431	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009778	AGCGC	2	10	58488	58497	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009778	GCGCG	2	10	59032	59041	0 %	0 %	60 %	40 %	156932303
35	NC_009778	CGCGC	2	10	59120	59129	0 %	0 %	40 %	60 %	156932303
36	NC_009778	GGCGC	2	10	59289	59298	0 %	0 %	60 %	40 %	156932303
37	NC_009778	CGGGC	2	10	59677	59686	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009778	AGCCA	2	10	61146	61155	40 %	0 %	20 %	40 %	156932305
39	NC_009778	GTCGG	2	10	61190	61199	0 %	20 %	60 %	20 %	156932305
40	NC_009778	TGCGC	2	10	62471	62480	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009778	AAGCG	2	10	62523	62532	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009778	CAGAG	2	10	63668	63677	40 %	0 %	40 %	20 %	156932306
43	NC_009778	CATAA	2	10	63870	63879	60 %	20 %	0 %	20 %	156932306
44	NC_009778	CTGCG	2	10	65067	65076	0 %	20 %	40 %	40 %	156932307
45	NC_009778	TTACT	2	10	67109	67118	20 %	60 %	0 %	20 %	156932309
46	NC_009778	TGGAG	2	10	68369	68378	20 %	20 %	60 %	0 %	156932311
47	NC_009778	GTGAC	2	10	68633	68642	20 %	20 %	40 %	20 %	156932311
48	NC_009778	AGCGC	2	10	69416	69425	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009778	CGATC	2	10	72233	72242	20 %	20 %	20 %	40 %	156932313
50	NC_009778	CTGCC	2	10	75054	75063	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_009778	GCACA	2	10	75348	75357	40 %	0 %	20 %	40 %	156932317
52	NC_009778	CGATG	2	10	76474	76483	20 %	20 %	40 %	20 %	156932319
53	NC_009778	GGCGT	2	10	76493	76502	0 %	20 %	60 %	20 %	156932319
54	NC_009778	GGCGT	2	10	77051	77060	0 %	20 %	60 %	20 %	156932319
55	NC_009778	GTCAC	2	10	78594	78603	20 %	20 %	20 %	40 %	156932320
56	NC_009778	TCAGA	2	10	80360	80369	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009778	ACCCA	2	10	82198	82207	40 %	0 %	0 %	60 %	156932325
58	NC_009778	TGCGC	2	10	83162	83171	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009778	CGCTT	2	10	83278	83287	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009778	AGCGC	2	10	83330	83339	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009778	CGTAA	2	10	84622	84631	40 %	20 %	20 %	20 %	156932326
62	NC_009778	TCATC	2	10	86927	86936	20 %	40 %	0 %	40 %	156932328
63	NC_009778	GATGT	2	10	87395	87404	20 %	40 %	40 %	0 %	156932329
64	NC_009778	GCACG	2	10	89188	89197	20 %	0 %	40 %	40 %	156932332
65	NC_009778	GCGTG	2	10	89383	89392	0 %	20 %	60 %	20 %	156932332
66	NC_009778	TGCGC	2	10	89994	90003	0 %	20 %	40 %	40 %	156932332
67	NC_009778	GCGCT	2	10	90829	90838	0 %	20 %	40 %	40 %	156932332
68	NC_009778	GAATG	2	10	91660	91669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009778	GCTGG	2	10	92863	92872	0 %	20 %	60 %	20 %	156932334
70	NC_009778	TAACG	2	10	93241	93250	40 %	20 %	20 %	20 %	156932334
71	NC_009778	TCTGC	2	10	93863	93872	0 %	40 %	20 %	40 %	156932335
72	NC_009778	GGCGC	2	10	94553	94562	0 %	0 %	60 %	40 %	156932336
73	NC_009778	CGTTC	2	10	97986	97995	0 %	40 %	20 %	40 %	156932341
74	NC_009778	CCGTC	2	10	101777	101786	0 %	20 %	20 %	60 %	156932344
75	NC_009778	TTTCA	2	10	102101	102110	20 %	60 %	0 %	20 %	156932344
76	NC_009778	GCGCA	2	10	102728	102737	20 %	0 %	40 %	40 %	156932344
77	NC_009778	TAGCG	2	10	102937	102946	20 %	20 %	40 %	20 %	156932344
78	NC_009778	ATAAA	2	10	103108	103117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009778	CGGCG	2	10	103392	103401	0 %	0 %	60 %	40 %	156932345
80	NC_009778	GCCTG	2	10	107671	107680	0 %	20 %	40 %	40 %	156932348
81	NC_009778	TAAAT	2	10	109503	109512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009778	TGGCG	2	10	111003	111012	0 %	20 %	60 %	20 %	156932351
83	NC_009778	ATCGA	2	10	111265	111274	40 %	20 %	20 %	20 %	156932351
84	NC_009778	ATGGC	2	10	113292	113301	20 %	20 %	40 %	20 %	156932352
85	NC_009778	GCCGC	2	10	113499	113508	0 %	0 %	40 %	60 %	156932352
86	NC_009778	GCTTT	2	10	114629	114638	0 %	60 %	20 %	20 %	156932353
87	NC_009778	CGCCA	2	10	115384	115393	20 %	0 %	20 %	60 %	156932355
88	NC_009778	TATTT	2	10	115862	115871	20 %	80 %	0 %	0 %	156932356
89	NC_009778	AGCGG	2	10	117167	117176	20 %	0 %	60 %	20 %	156932358
90	NC_009778	GGGCC	2	10	119522	119531	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009778	GTACC	2	10	121201	121210	20 %	20 %	20 %	40 %	156932360
92	NC_009778	ATGAA	2	10	122091	122100	60 %	20 %	20 %	0 %	156932362
93	NC_009778	CGCGC	2	10	122695	122704	0 %	0 %	40 %	60 %	156932363
94	NC_009778	GGCGC	2	10	124116	124125	0 %	0 %	60 %	40 %	156932364
95	NC_009778	ACGCC	2	10	124554	124563	20 %	0 %	20 %	60 %	156932364
96	NC_009778	GAAAG	2	10	125644	125653	60 %	0 %	40 %	0 %	156932366
97	NC_009778	TACCG	2	10	126970	126979	20 %	20 %	20 %	40 %	156932367
98	NC_009778	CGTGA	2	10	128926	128935	20 %	20 %	40 %	20 %	156932367
99	NC_009778	GCCGG	2	10	131627	131636	0 %	0 %	60 %	40 %	156932369
100	NC_009778	CGGAC	2	10	132980	132989	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009778	GTCAG	2	10	133323	133332	20 %	20 %	40 %	20 %	156932371
102	NC_009778	CGGCG	2	10	135962	135971	0 %	0 %	60 %	40 %	156932373
103	NC_009778	GCCAC	2	10	136507	136516	20 %	0 %	20 %	60 %	156932374
104	NC_009778	TGCGC	2	10	141590	141599	0 %	20 %	40 %	40 %	156932378
105	NC_009778	CTGCA	2	10	141769	141778	20 %	20 %	20 %	40 %	156932378
106	NC_009778	GAGCA	2	10	142303	142312	40 %	0 %	40 %	20 %	156932379
107	NC_009778	TGCGC	2	10	142548	142557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009778	TGCGC	2	10	142606	142615	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_009778	TGCGC	2	10	142665	142674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_009778	GCTCG	2	10	142918	142927	0 %	20 %	40 %	40 %	156932380
111	NC_009778	GCGCG	2	10	146418	146427	0 %	0 %	60 %	40 %	156932385
112	NC_009778	ACCAG	2	10	147222	147231	40 %	0 %	20 %	40 %	156932387
113	NC_009778	AGCGC	2	10	151505	151514	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009778	GCTCT	2	10	153786	153795	0 %	40 %	20 %	40 %	156932391
115	NC_009778	GCGCC	2	10	154400	154409	0 %	0 %	40 %	60 %	156932391
116	NC_009778	TCTTT	2	10	158304	158313	0 %	80 %	0 %	20 %	156932396
117	NC_009778	TGACG	2	10	159831	159840	20 %	20 %	40 %	20 %	156932397
118	NC_009778	CGCCT	2	10	161537	161546	0 %	20 %	20 %	60 %	156932399
119	NC_009778	TGACG	2	10	163469	163478	20 %	20 %	40 %	20 %	156932401
120	NC_009778	GCCTG	2	10	169099	169108	0 %	20 %	40 %	40 %	156932406
121	NC_009778	CGGCC	2	10	170721	170730	0 %	0 %	40 %	60 %	156932408
122	NC_009778	GCCGT	2	10	171269	171278	0 %	20 %	40 %	40 %	156932408
123	NC_009778	ATCCC	2	10	172281	172290	20 %	20 %	0 %	60 %	156932410
124	NC_009778	CGGCG	2	10	174574	174583	0 %	0 %	60 %	40 %	156932410
125	NC_009778	AAGCG	2	10	174663	174672	40 %	0 %	40 %	20 %	156932410
126	NC_009778	GCGCC	2	10	178966	178975	0 %	0 %	40 %	60 %	156932415
127	NC_009778	ATGGC	2	10	183212	183221	20 %	20 %	40 %	20 %	156932420
128	NC_009778	ATTGA	2	10	184250	184259	40 %	40 %	20 %	0 %	156932422
129	NC_009778	TCCCG	2	10	186198	186207	0 %	20 %	20 %	60 %	156932427
130	NC_009778	GCGCG	2	10	186400	186409	0 %	0 %	60 %	40 %	156932427
131	NC_009778	TTTCC	2	10	186477	186486	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009778	ATTTT	2	10	186530	186539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009778	GTCGC	2	10	187170	187179	0 %	20 %	40 %	40 %	156932429
134	NC_009778	ATCGG	2	10	196335	196344	20 %	20 %	40 %	20 %	156932439
135	NC_009778	GCTTT	2	10	196476	196485	0 %	60 %	20 %	20 %	156932439
136	NC_009778	AAGGC	2	10	198026	198035	40 %	0 %	40 %	20 %	156932440
137	NC_009778	CGTAC	2	10	198451	198460	20 %	20 %	20 %	40 %	156932441
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256	NC_009778	AGCGC	2	10	361631	361640	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
257	NC_009778	AGCGC	2	10	361735	361744	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
258	NC_009778	GCCAG	2	10	363071	363080	20 %	0 %	40 %	40 %	156932604
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268	NC_009778	AGCAC	2	10	373800	373809	40 %	0 %	20 %	40 %	156932617
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