MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009727	TGACAT	2	12	158900	158911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154707242
3502	NC_009727	AAT	2	6	158973	158978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707242
3503	NC_009727	CAGC	2	8	158987	158994	25 %	0 %	25 %	50 %	154707242
3504	NC_009727	T	6	6	159000	159005	0 %	100 %	0 %	0 %	154707242
3505	NC_009727	CTT	2	6	159071	159076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707242
3506	NC_009727	CGC	2	6	159095	159100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707242
3507	NC_009727	AGT	2	6	159146	159151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707242
3508	NC_009727	ATT	4	12	159165	159176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707242
3509	NC_009727	T	6	6	159193	159198	0 %	100 %	0 %	0 %	154707242
3510	NC_009727	CGT	2	6	159210	159215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154707242
3511	NC_009727	AAT	2	6	159312	159317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707242
3512	NC_009727	GT	3	6	159377	159382	0 %	50 %	50 %	0 %	154707242
3513	NC_009727	TAA	2	6	159387	159392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707242
3514	NC_009727	TTGC	2	8	159473	159480	0 %	50 %	25 %	25 %	154707242
3515	NC_009727	AAT	2	6	159536	159541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707242
3516	NC_009727	TAA	2	6	159603	159608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707242
3517	NC_009727	AGA	2	6	159634	159639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707242
3518	NC_009727	C	6	6	159646	159651	0 %	0 %	0 %	100 %	154707242
3519	NC_009727	AAT	2	6	159711	159716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707242
3520	NC_009727	T	6	6	159742	159747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009727	AGC	2	6	159798	159803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706031
3522	NC_009727	CTT	3	9	159875	159883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706031
3523	NC_009727	CGCA	2	8	159918	159925	25 %	0 %	25 %	50 %	154706031
3524	NC_009727	GCC	2	6	159975	159980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706031
3525	NC_009727	CTT	2	6	159995	160000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706031
3526	NC_009727	TAA	2	6	160050	160055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706031
3527	NC_009727	GATA	2	8	160070	160077	50 %	25 %	25 %	0 %	154706031
3528	NC_009727	GCC	2	6	160092	160097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706031
3529	NC_009727	GAC	2	6	160101	160106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706031
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3531	NC_009727	CGG	2	6	160142	160147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706031
3532	NC_009727	TCT	2	6	160181	160186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_009727	TTGA	2	8	160231	160238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_009727	CGT	2	6	160281	160286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_009727	ATC	2	6	160298	160303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363699
3536	NC_009727	CTT	2	6	160328	160333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363699
3537	NC_009727	TGA	2	6	160388	160393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363699
3538	NC_009727	GC	3	6	160442	160447	0 %	0 %	50 %	50 %	209363699
3539	NC_009727	AAAG	2	8	160467	160474	75 %	0 %	25 %	0 %	209363699
3540	NC_009727	GC	4	8	160500	160507	0 %	0 %	50 %	50 %	209363699
3541	NC_009727	GTC	2	6	160524	160529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363699
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3546	NC_009727	T	6	6	160821	160826	0 %	100 %	0 %	0 %	209363699
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3549	NC_009727	ACCC	2	8	161022	161029	25 %	0 %	0 %	75 %	209363699
3550	NC_009727	GGC	2	6	161044	161049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209363699
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3552	NC_009727	TTCT	2	8	161135	161142	0 %	75 %	0 %	25 %	209363699
3553	NC_009727	CAT	2	6	161202	161207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363699
3554	NC_009727	GCAAA	2	10	161271	161280	60 %	0 %	20 %	20 %	209363699
3555	NC_009727	TAA	2	6	161304	161309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363699
3556	NC_009727	ATCG	2	8	161394	161401	25 %	25 %	25 %	25 %	209363699
3557	NC_009727	T	6	6	161473	161478	0 %	100 %	0 %	0 %	209363699
3558	NC_009727	TGC	2	6	161507	161512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363699
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3561	NC_009727	TGT	2	6	161679	161684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363699
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3571	NC_009727	CGG	2	6	162273	162278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154707638
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3573	NC_009727	AAAT	2	8	162368	162375	75 %	25 %	0 %	0 %	154707638
3574	NC_009727	CCG	2	6	162387	162392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707638
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3580	NC_009727	TCGT	2	8	162631	162638	0 %	50 %	25 %	25 %	154707638
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3582	NC_009727	GAA	2	6	162687	162692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_009727	GC	3	6	162698	162703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_009727	GC	3	6	162707	162712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3587	NC_009727	TAT	2	6	162808	162813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154705840
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3589	NC_009727	AAT	2	6	162822	162827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705840
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3592	NC_009727	TAA	2	6	162883	162888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705840
3593	NC_009727	T	6	6	162910	162915	0 %	100 %	0 %	0 %	154705840
3594	NC_009727	AAT	2	6	162958	162963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705840
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3599	NC_009727	TAAA	2	8	163218	163225	75 %	25 %	0 %	0 %	154705840
3600	NC_009727	GTTG	2	8	163267	163274	0 %	50 %	50 %	0 %	154705840
3601	NC_009727	ATA	2	6	163310	163315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705840
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3603	NC_009727	AG	3	6	163473	163478	50 %	0 %	50 %	0 %	154705840
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3607	NC_009727	CGA	2	6	163687	163692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154705840
3608	NC_009727	GT	3	6	163733	163738	0 %	50 %	50 %	0 %	154705840
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3610	NC_009727	ATCG	2	8	163756	163763	25 %	25 %	25 %	25 %	154705840
3611	NC_009727	TAAT	2	8	163797	163804	50 %	50 %	0 %	0 %	154705840
3612	NC_009727	GATT	2	8	163840	163847	25 %	50 %	25 %	0 %	154705840
3613	NC_009727	CGGT	2	8	163854	163861	0 %	25 %	50 %	25 %	154705840
3614	NC_009727	TGA	2	6	163887	163892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154705840
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3617	NC_009727	AACAT	2	10	164153	164162	60 %	20 %	0 %	20 %	154705840
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3623	NC_009727	AAT	2	6	164387	164392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706716
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