MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009727	GATA	2	8	136483	136490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_009727	T	9	9	136502	136510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_009727	GCC	2	6	136529	136534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_009727	TCG	2	6	136617	136622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_009727	A	7	7	136626	136632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009727	CGC	2	6	136641	136646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_009727	CCGC	2	8	136758	136765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3008	NC_009727	T	6	6	136839	136844	0 %	100 %	0 %	0 %	154706309
3009	NC_009727	TCT	2	6	136860	136865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706309
3010	NC_009727	T	6	6	136865	136870	0 %	100 %	0 %	0 %	154706309
3011	NC_009727	TTA	2	6	136901	136906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706309
3012	NC_009727	GCT	2	6	136919	136924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706309
3013	NC_009727	CTAATG	2	12	136935	136946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154706309
3014	NC_009727	TGA	2	6	136956	136961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706309
3015	NC_009727	TGA	2	6	136978	136983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706309
3016	NC_009727	TGA	2	6	137001	137006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706309
3017	NC_009727	TGT	2	6	137021	137026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706309
3018	NC_009727	AAAG	2	8	137125	137132	75 %	0 %	25 %	0 %	154706309
3019	NC_009727	AGG	2	6	137360	137365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706309
3020	NC_009727	TAA	2	6	137407	137412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706309
3021	NC_009727	T	6	6	137510	137515	0 %	100 %	0 %	0 %	154706309
3022	NC_009727	A	6	6	137580	137585	100 %	0 %	0 %	0 %	154706309
3023	NC_009727	CCG	2	6	137630	137635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706309
3024	NC_009727	GTA	2	6	137707	137712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706309
3025	NC_009727	AC	3	6	137741	137746	50 %	0 %	0 %	50 %	154706309
3026	NC_009727	CGT	2	6	137870	137875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706309
3027	NC_009727	T	6	6	137910	137915	0 %	100 %	0 %	0 %	154706309
3028	NC_009727	CAT	2	6	137962	137967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_009727	TCA	2	6	138024	138029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154705989
3030	NC_009727	AAT	2	6	138063	138068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705989
3031	NC_009727	ACC	2	6	138109	138114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154705989
3032	NC_009727	GCAGG	2	10	138206	138215	20 %	0 %	60 %	20 %	154705989
3033	NC_009727	GCA	2	6	138262	138267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154705989
3034	NC_009727	GA	3	6	138287	138292	50 %	0 %	50 %	0 %	154705989
3035	NC_009727	CCG	2	6	138323	138328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154705989
3036	NC_009727	AAT	2	6	138394	138399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705989
3037	NC_009727	TCT	2	6	138469	138474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705989
3038	NC_009727	GTG	2	6	138540	138545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154705989
3039	NC_009727	TCT	2	6	138622	138627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705989
3040	NC_009727	AGC	2	6	138679	138684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154705989
3041	NC_009727	C	6	6	138704	138709	0 %	0 %	0 %	100 %	154705989
3042	NC_009727	T	6	6	138824	138829	0 %	100 %	0 %	0 %	154705989
3043	NC_009727	CGG	2	6	138841	138846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154705989
3044	NC_009727	AATA	2	8	138858	138865	75 %	25 %	0 %	0 %	154705989
3045	NC_009727	ATTC	2	8	138867	138874	25 %	50 %	0 %	25 %	154705989
3046	NC_009727	AGC	2	6	138879	138884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154705989
3047	NC_009727	CCT	2	6	138922	138927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154705989
3048	NC_009727	TTGA	2	8	138948	138955	25 %	50 %	25 %	0 %	154705989
3049	NC_009727	TCA	2	6	138990	138995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_009727	TAAGC	2	10	138996	139005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3051	NC_009727	TAT	2	6	139012	139017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009727	TCT	2	6	139053	139058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_009727	TAA	2	6	139127	139132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_009727	CTTT	2	8	139147	139154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_009727	CT	3	6	139174	139179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_009727	CGT	2	6	139233	139238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363695
3057	NC_009727	TAT	2	6	139261	139266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363695
3058	NC_009727	GAA	2	6	139268	139273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363695
3059	NC_009727	TTC	2	6	139338	139343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363695
3060	NC_009727	TTTG	2	8	139397	139404	0 %	75 %	25 %	0 %	209363695
3061	NC_009727	ACG	2	6	139429	139434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363695
3062	NC_009727	T	6	6	139439	139444	0 %	100 %	0 %	0 %	209363695
3063	NC_009727	CT	3	6	139474	139479	0 %	50 %	0 %	50 %	209363695
3064	NC_009727	A	7	7	139521	139527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_009727	T	6	6	139558	139563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_009727	TCG	2	6	139591	139596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154707736
3067	NC_009727	TGG	2	6	139612	139617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154707736
3068	NC_009727	ATC	2	6	139763	139768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707736
3069	NC_009727	GGC	2	6	139780	139785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154707736
3070	NC_009727	GC	3	6	139784	139789	0 %	0 %	50 %	50 %	154707736
3071	NC_009727	CAG	2	6	139799	139804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707736
3072	NC_009727	AC	3	6	139839	139844	50 %	0 %	0 %	50 %	154707736
3073	NC_009727	CCATT	2	10	139880	139889	20 %	40 %	0 %	40 %	154707736
3074	NC_009727	CTA	2	6	139903	139908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707736
3075	NC_009727	GGTA	2	8	139984	139991	25 %	25 %	50 %	0 %	154707736
3076	NC_009727	A	7	7	139997	140003	100 %	0 %	0 %	0 %	154707736
3077	NC_009727	GCAAA	2	10	140044	140053	60 %	0 %	20 %	20 %	154707736
3078	NC_009727	T	6	6	140076	140081	0 %	100 %	0 %	0 %	154707736
3079	NC_009727	CTT	2	6	140110	140115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707736
3080	NC_009727	TGT	2	6	140172	140177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154707736
3081	NC_009727	T	6	6	140222	140227	0 %	100 %	0 %	0 %	154707736
3082	NC_009727	AAATT	2	10	140314	140323	60 %	40 %	0 %	0 %	154707534
3083	NC_009727	ATC	2	6	140360	140365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707534
3084	NC_009727	ATCA	2	8	140408	140415	50 %	25 %	0 %	25 %	154707534
3085	NC_009727	AATT	2	8	140425	140432	50 %	50 %	0 %	0 %	154707534
3086	NC_009727	TTA	2	6	140520	140525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707534
3087	NC_009727	TAT	2	6	140566	140571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706035
3088	NC_009727	CCAAAG	2	12	140608	140619	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	154706035
3089	NC_009727	GCC	2	6	140772	140777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706035
3090	NC_009727	AGC	2	6	140778	140783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706035
3091	NC_009727	GCT	2	6	141074	141079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706035
3092	NC_009727	AC	3	6	141200	141205	50 %	0 %	0 %	50 %	154706035
3093	NC_009727	CGC	2	6	141251	141256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706035
3094	NC_009727	C	6	6	141358	141363	0 %	0 %	0 %	100 %	154706035
3095	NC_009727	CCA	2	6	141416	141421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706035
3096	NC_009727	AACT	2	8	141465	141472	50 %	25 %	0 %	25 %	154706035
3097	NC_009727	ACC	2	6	141492	141497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706035
3098	NC_009727	AAT	2	6	141510	141515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706035
3099	NC_009727	CGT	2	6	141522	141527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706035
3100	NC_009727	TGTGAT	2	12	141536	141547	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154706035
3101	NC_009727	CAG	2	6	141593	141598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706035
3102	NC_009727	CAT	2	6	141612	141617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706035
3103	NC_009727	GCT	2	6	141618	141623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706035
3104	NC_009727	TTC	2	6	141642	141647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706035
3105	NC_009727	GAG	2	6	141683	141688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706035
3106	NC_009727	A	6	6	141706	141711	100 %	0 %	0 %	0 %	154706035
3107	NC_009727	TTG	2	6	141717	141722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706035
3108	NC_009727	TGG	2	6	141733	141738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706035
3109	NC_009727	ATG	2	6	141805	141810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706035
3110	NC_009727	GAT	2	6	141833	141838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706035
3111	NC_009727	GCC	2	6	141860	141865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707430
3112	NC_009727	T	7	7	141926	141932	0 %	100 %	0 %	0 %	154707430
3113	NC_009727	T	6	6	141946	141951	0 %	100 %	0 %	0 %	154707430
3114	NC_009727	TAAA	2	8	142015	142022	75 %	25 %	0 %	0 %	154707430
3115	NC_009727	TCA	2	6	142033	142038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707430
3116	NC_009727	A	7	7	142162	142168	100 %	0 %	0 %	0 %	154707430
3117	NC_009727	AGG	2	6	142244	142249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154707430
3118	NC_009727	TCC	2	6	142332	142337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154706183
3119	NC_009727	GTC	2	6	142391	142396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706183
3120	NC_009727	CGA	2	6	142459	142464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706183
3121	NC_009727	TTG	2	6	142499	142504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706183
3122	NC_009727	TGT	2	6	142552	142557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706183
3123	NC_009727	A	7	7	142574	142580	100 %	0 %	0 %	0 %	154706183
3124	NC_009727	CTT	2	6	142585	142590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706183
3125	NC_009727	AT	3	6	142635	142640	50 %	50 %	0 %	0 %	154706183
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