MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_009727	CTGATA	2	12	69026	69037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154705751
1503	NC_009727	AAT	2	6	69044	69049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705751
1504	NC_009727	CGGG	2	8	69059	69066	0 %	0 %	75 %	25 %	154707189
1505	NC_009727	AATC	2	8	69166	69173	50 %	25 %	0 %	25 %	154707189
1506	NC_009727	AAAT	2	8	69186	69193	75 %	25 %	0 %	0 %	154707189
1507	NC_009727	CGC	2	6	69273	69278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707189
1508	NC_009727	CCG	2	6	69344	69349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707189
1509	NC_009727	AAG	2	6	69365	69370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707189
1510	NC_009727	CGG	2	6	69381	69386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154707189
1511	NC_009727	ATT	2	6	69406	69411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707189
1512	NC_009727	ATT	2	6	69713	69718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363662
1513	NC_009727	GTG	2	6	69789	69794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209363662
1514	NC_009727	A	6	6	69817	69822	100 %	0 %	0 %	0 %	209363662
1515	NC_009727	TCG	2	6	69871	69876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363662
1516	NC_009727	CGT	2	6	69968	69973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363662
1517	NC_009727	GTT	2	6	69976	69981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363662
1518	NC_009727	TCAC	2	8	69997	70004	25 %	25 %	0 %	50 %	209363662
1519	NC_009727	GGT	2	6	70040	70045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209363662
1520	NC_009727	TTGGCT	2	12	70056	70067	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	209363662
1521	NC_009727	A	6	6	70128	70133	100 %	0 %	0 %	0 %	209363662
1522	NC_009727	GAA	3	9	70218	70226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363662
1523	NC_009727	TTA	2	6	70230	70235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363662
1524	NC_009727	AAGTC	2	10	70319	70328	40 %	20 %	20 %	20 %	209363662
1525	NC_009727	GCC	2	6	70338	70343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363662
1526	NC_009727	GTC	2	6	70359	70364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363662
1527	NC_009727	ATTA	2	8	70496	70503	50 %	50 %	0 %	0 %	209363662
1528	NC_009727	CTT	2	6	70505	70510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363662
1529	NC_009727	CG	3	6	70533	70538	0 %	0 %	50 %	50 %	209363662
1530	NC_009727	AGC	2	6	70571	70576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363662
1531	NC_009727	TCAT	2	8	70582	70589	25 %	50 %	0 %	25 %	209363662
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1534	NC_009727	ATG	2	6	70776	70781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363663
1535	NC_009727	AAT	2	6	70836	70841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363663
1536	NC_009727	ACA	2	6	70857	70862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363663
1537	NC_009727	CTAT	2	8	70874	70881	25 %	50 %	0 %	25 %	209363663
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1541	NC_009727	GCAG	2	8	71162	71169	25 %	0 %	50 %	25 %	209363663
1542	NC_009727	TTC	2	6	71205	71210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_009727	CCA	2	6	71211	71216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_009727	GGT	2	6	71277	71282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_009727	TAAT	2	8	71306	71313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009727	T	6	6	71367	71372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_009727	A	6	6	71391	71396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009727	CGT	2	6	71401	71406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_009727	CT	3	6	71468	71473	0 %	50 %	0 %	50 %	209363664
1550	NC_009727	ACCC	2	8	71523	71530	25 %	0 %	0 %	75 %	209363664
1551	NC_009727	CGT	2	6	71563	71568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363664
1552	NC_009727	CTG	2	6	71585	71590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_009727	G	6	6	71627	71632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009727	TGTC	2	8	71729	71736	0 %	50 %	25 %	25 %	154706598
1555	NC_009727	ACG	2	6	71758	71763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706598
1556	NC_009727	T	8	8	71768	71775	0 %	100 %	0 %	0 %	154706598
1557	NC_009727	CT	3	6	71805	71810	0 %	50 %	0 %	50 %	154706598
1558	NC_009727	GAT	2	6	71839	71844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706598
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1560	NC_009727	TAT	2	6	71902	71907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_009727	TTC	2	6	71920	71925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_009727	TATT	2	8	71930	71937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009727	ATT	2	6	71949	71954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009727	ATA	2	6	71956	71961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706906
1565	NC_009727	ATTGAT	2	12	72072	72083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154706906
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1573	NC_009727	AAT	2	6	72670	72675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_009727	T	7	7	73056	73062	0 %	100 %	0 %	0 %	209363665
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1598	NC_009727	A	6	6	73793	73798	100 %	0 %	0 %	0 %	209363666
1599	NC_009727	CAA	2	6	73911	73916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363666
1600	NC_009727	CTA	2	6	73925	73930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363666
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1609	NC_009727	AAC	2	6	74293	74298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363666
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1612	NC_009727	CATT	2	8	74501	74508	25 %	50 %	0 %	25 %	209363666
1613	NC_009727	CCT	2	6	74690	74695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209363666
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1620	NC_009727	TAAA	2	8	74944	74951	75 %	25 %	0 %	0 %	209363666
1621	NC_009727	GAG	2	6	75113	75118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_009727	TCAAAG	2	12	75351	75362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209363667
1626	NC_009727	AGG	2	6	75517	75522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_009727	TCT	2	6	75575	75580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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