MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009727	TTAC	2	8	46630	46637	25 %	50 %	0 %	25 %	209363652
1003	NC_009727	GAA	2	6	46638	46643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363652
1004	NC_009727	CCAA	2	8	46708	46715	50 %	0 %	0 %	50 %	209363652
1005	NC_009727	AC	3	6	46753	46758	50 %	0 %	0 %	50 %	209363652
1006	NC_009727	AGTG	2	8	46776	46783	25 %	25 %	50 %	0 %	209363652
1007	NC_009727	GCG	2	6	46845	46850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209363652
1008	NC_009727	GGAAT	2	10	46911	46920	40 %	20 %	40 %	0 %	209363652
1009	NC_009727	GAA	2	6	46935	46940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363652
1010	NC_009727	AAC	2	6	46957	46962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363652
1011	NC_009727	CGA	2	6	47024	47029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363652
1012	NC_009727	CGC	2	6	47039	47044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363652
1013	NC_009727	GCC	2	6	47060	47065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363652
1014	NC_009727	GAAA	2	8	47115	47122	75 %	0 %	25 %	0 %	209363652
1015	NC_009727	GAC	2	6	47130	47135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363652
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1017	NC_009727	AAAAT	2	10	47209	47218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009727	ATA	2	6	47246	47251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009727	TAAA	2	8	47260	47267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009727	TAAA	2	8	47276	47283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009727	A	6	6	47281	47286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009727	TTAT	2	8	47287	47294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009727	ATTTT	2	10	47295	47304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009727	TTTA	2	8	47305	47312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009727	TTAA	2	8	47316	47323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009727	TAT	2	6	47331	47336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009727	T	6	6	47353	47358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009727	AAAT	2	8	47365	47372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_009727	AAC	2	6	47639	47644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154706010
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1042	NC_009727	GAA	2	6	48049	48054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706010
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1057	NC_009727	TTA	2	6	48865	48870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_009727	A	9	9	49012	49020	100 %	0 %	0 %	0 %	209363653
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1098	NC_009727	TAA	2	6	50529	50534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363654
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1101	NC_009727	TCA	2	6	50651	50656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706619
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1107	NC_009727	AGAA	2	8	50931	50938	75 %	0 %	25 %	0 %	154706619
1108	NC_009727	TCA	2	6	51007	51012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706619
1109	NC_009727	AGC	2	6	51037	51042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706619
1110	NC_009727	T	6	6	51051	51056	0 %	100 %	0 %	0 %	154706619
1111	NC_009727	GCAA	2	8	51079	51086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_009727	A	6	6	51113	51118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009727	GCT	2	6	51139	51144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009727	AAAAT	2	10	51154	51163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009727	CAC	2	6	51204	51209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_009727	CGC	2	6	51210	51215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_009727	GAT	2	6	51228	51233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009727	AAT	2	6	51237	51242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009727	CAC	2	6	51246	51251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_009727	AATG	2	8	51266	51273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009727	T	8	8	51332	51339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009727	CCGC	2	8	51426	51433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1123	NC_009727	CGG	2	6	51494	51499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009727	TTA	2	6	51520	51525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009727	AAATA	2	10	51636	51645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009727	TTAAT	2	10	51793	51802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_009727	TTC	2	6	51867	51872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707221
1128	NC_009727	ATAA	2	8	51934	51941	75 %	25 %	0 %	0 %	154707221
1129	NC_009727	AAG	2	6	51953	51958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707221
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