MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009727	CG	3	6	225762	225767	0 %	0 %	50 %	50 %	209363731
5002	NC_009727	TTGGC	2	10	225773	225782	0 %	40 %	40 %	20 %	209363731
5003	NC_009727	TAAA	2	8	225804	225811	75 %	25 %	0 %	0 %	209363731
5004	NC_009727	GATC	2	8	225842	225849	25 %	25 %	25 %	25 %	209363731
5005	NC_009727	GC	3	6	225851	225856	0 %	0 %	50 %	50 %	209363731
5006	NC_009727	CAATC	2	10	225870	225879	40 %	20 %	0 %	40 %	209363731
5007	NC_009727	GAA	2	6	225906	225911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363731
5008	NC_009727	TGC	2	6	225914	225919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363731
5009	NC_009727	AAT	2	6	226041	226046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363731
5010	NC_009727	CGC	2	6	226094	226099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363731
5011	NC_009727	T	7	7	226165	226171	0 %	100 %	0 %	0 %	209363731
5012	NC_009727	TCA	2	6	226205	226210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363731
5013	NC_009727	ATAA	2	8	226211	226218	75 %	25 %	0 %	0 %	209363731
5014	NC_009727	GCG	2	6	226219	226224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209363731
5015	NC_009727	CT	3	6	226357	226362	0 %	50 %	0 %	50 %	209363731
5016	NC_009727	AGT	2	6	226432	226437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363731
5017	NC_009727	A	6	6	226632	226637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_009727	CAA	2	6	226639	226644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_009727	AATG	2	8	226713	226720	50 %	25 %	25 %	0 %	154706125
5020	NC_009727	AATG	2	8	226874	226881	50 %	25 %	25 %	0 %	154706125
5021	NC_009727	GGC	2	6	227013	227018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706125
5022	NC_009727	TGA	2	6	227053	227058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706125
5023	NC_009727	A	6	6	227068	227073	100 %	0 %	0 %	0 %	154706125
5024	NC_009727	A	6	6	227091	227096	100 %	0 %	0 %	0 %	154706125
5025	NC_009727	GCA	2	6	227113	227118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706125
5026	NC_009727	TCATT	2	10	227152	227161	20 %	60 %	0 %	20 %	154706125
5027	NC_009727	A	6	6	227362	227367	100 %	0 %	0 %	0 %	154706125
5028	NC_009727	TTGG	2	8	227416	227423	0 %	50 %	50 %	0 %	154706125
5029	NC_009727	GTC	2	6	227456	227461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706125
5030	NC_009727	TTA	2	6	227506	227511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706125
5031	NC_009727	AGTC	2	8	227542	227549	25 %	25 %	25 %	25 %	154706125
5032	NC_009727	TTGT	2	8	227553	227560	0 %	75 %	25 %	0 %	154706125
5033	NC_009727	TAA	2	6	227580	227585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706125
5034	NC_009727	T	8	8	227595	227602	0 %	100 %	0 %	0 %	154706125
5035	NC_009727	CAG	2	6	227643	227648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706125
5036	NC_009727	CG	3	6	227716	227721	0 %	0 %	50 %	50 %	154706125
5037	NC_009727	AAG	2	6	227841	227846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706125
5038	NC_009727	GAAA	2	8	227881	227888	75 %	0 %	25 %	0 %	154706125
5039	NC_009727	AAT	2	6	228025	228030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706125
5040	NC_009727	TGAAA	2	10	228098	228107	60 %	20 %	20 %	0 %	154706125
5041	NC_009727	AAT	2	6	228133	228138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_009727	A	6	6	228149	228154	100 %	0 %	0 %	0 %	154707750
5043	NC_009727	AAT	2	6	228169	228174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707750
5044	NC_009727	GAA	2	6	228178	228183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707750
5045	NC_009727	AAT	2	6	228202	228207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707750
5046	NC_009727	A	7	7	228351	228357	100 %	0 %	0 %	0 %	154707750
5047	NC_009727	GAT	2	6	228367	228372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707750
5048	NC_009727	GAA	2	6	228412	228417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707750
5049	NC_009727	AAG	2	6	228482	228487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707750
5050	NC_009727	GAA	2	6	228544	228549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707750
5051	NC_009727	GAA	2	6	228667	228672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707750
5052	NC_009727	TTCAT	2	10	228722	228731	20 %	60 %	0 %	20 %	154707750
5053	NC_009727	A	8	8	228782	228789	100 %	0 %	0 %	0 %	154707750
5054	NC_009727	A	6	6	228802	228807	100 %	0 %	0 %	0 %	154707750
5055	NC_009727	CAA	2	6	228847	228852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154707750
5056	NC_009727	GAA	2	6	228970	228975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707750
5057	NC_009727	AATT	2	8	229034	229041	50 %	50 %	0 %	0 %	154707750
5058	NC_009727	AGA	2	6	229071	229076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707750
5059	NC_009727	AT	3	6	229085	229090	50 %	50 %	0 %	0 %	154707750
5060	NC_009727	CTT	2	6	229115	229120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707750
5061	NC_009727	ATT	2	6	229152	229157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707750
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5063	NC_009727	A	6	6	229289	229294	100 %	0 %	0 %	0 %	154707750
5064	NC_009727	ACG	2	6	229298	229303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707750
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5076	NC_009727	A	6	6	229787	229792	100 %	0 %	0 %	0 %	154707750
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5084	NC_009727	A	6	6	230009	230014	100 %	0 %	0 %	0 %	154707750
5085	NC_009727	TTA	2	6	230176	230181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_009727	AAT	2	6	230193	230198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_009727	A	6	6	230228	230233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_009727	TAA	2	6	230360	230365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363732
5089	NC_009727	AT	4	8	230384	230391	50 %	50 %	0 %	0 %	209363732
5090	NC_009727	ATT	3	9	230416	230424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363732
5091	NC_009727	CGCTT	2	10	230435	230444	0 %	40 %	20 %	40 %	209363732
5092	NC_009727	A	6	6	230463	230468	100 %	0 %	0 %	0 %	209363732
5093	NC_009727	CTTAA	2	10	230491	230500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5094	NC_009727	CGT	2	6	230556	230561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706246
5095	NC_009727	AATC	2	8	230578	230585	50 %	25 %	0 %	25 %	154706246
5096	NC_009727	TTA	2	6	230745	230750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706246
5097	NC_009727	TAA	2	6	230776	230781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706246
5098	NC_009727	GCGT	2	8	230810	230817	0 %	25 %	50 %	25 %	154706246
5099	NC_009727	AAT	2	6	230882	230887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706246
5100	NC_009727	AGCG	2	8	230906	230913	25 %	0 %	50 %	25 %	154706246
5101	NC_009727	A	6	6	230931	230936	100 %	0 %	0 %	0 %	154706246
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5104	NC_009727	ATT	2	6	231070	231075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706246
5105	NC_009727	TTA	2	6	231114	231119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706246
5106	NC_009727	TTAA	2	8	231192	231199	50 %	50 %	0 %	0 %	154706246
5107	NC_009727	TTTAT	2	10	231200	231209	20 %	80 %	0 %	0 %	154706246
5108	NC_009727	CAG	2	6	231234	231239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706246
5109	NC_009727	ATT	2	6	231251	231256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706246
5110	NC_009727	GTG	2	6	231279	231284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706246
5111	NC_009727	GAA	2	6	231347	231352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706246
5112	NC_009727	CAAA	2	8	231362	231369	75 %	0 %	0 %	25 %	154706246
5113	NC_009727	TGG	2	6	231474	231479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706246
5114	NC_009727	GA	3	6	231519	231524	50 %	0 %	50 %	0 %	154706246
5115	NC_009727	TGT	2	6	231538	231543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706246
5116	NC_009727	AGA	2	6	231584	231589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706246
5117	NC_009727	TTA	2	6	231648	231653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706246
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5119	NC_009727	TTG	2	6	231711	231716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706246
5120	NC_009727	GGT	2	6	231719	231724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706246
5121	NC_009727	AGC	2	6	231755	231760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706246
5122	NC_009727	CTA	2	6	231761	231766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706246
5123	NC_009727	CTG	2	6	231780	231785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706246
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5125	NC_009727	TCC	2	6	231858	231863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154706246
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5241	NC_009727	CGGGT	2	10	236855	236864	0 %	20 %	60 %	20 %	154705816
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5243	NC_009727	TCC	2	6	236899	236904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154705816
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5245	NC_009727	TCTT	2	8	236943	236950	0 %	75 %	0 %	25 %	154705816
5246	NC_009727	A	6	6	236994	236999	100 %	0 %	0 %	0 %	154705816
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5249	NC_009727	CCA	2	6	237085	237090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154705816
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