MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009727	T	6	6	202782	202787	0 %	100 %	0 %	0 %	154707129
4502	NC_009727	CTT	2	6	202796	202801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707129
4503	NC_009727	C	6	6	202821	202826	0 %	0 %	0 %	100 %	154707129
4504	NC_009727	AGA	2	6	202866	202871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707129
4505	NC_009727	TTTA	2	8	202897	202904	25 %	75 %	0 %	0 %	154707129
4506	NC_009727	TAT	2	6	202990	202995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707129
4507	NC_009727	AGA	2	6	203015	203020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707129
4508	NC_009727	TCGCT	2	10	203072	203081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4509	NC_009727	ACCC	2	8	203095	203102	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4510	NC_009727	TTG	2	6	203103	203108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_009727	CAA	2	6	203110	203115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_009727	TGA	2	6	203123	203128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_009727	AAAG	2	8	203129	203136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_009727	CCA	2	6	203176	203181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_009727	TGA	2	6	203191	203196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_009727	AGG	2	6	203246	203251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154707555
4517	NC_009727	GAT	2	6	203317	203322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707555
4518	NC_009727	GTT	2	6	203347	203352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154707555
4519	NC_009727	T	7	7	203377	203383	0 %	100 %	0 %	0 %	154707555
4520	NC_009727	CGA	2	6	203394	203399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707555
4521	NC_009727	TGA	2	6	203493	203498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707555
4522	NC_009727	TAA	2	6	203499	203504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707555
4523	NC_009727	GA	3	6	203552	203557	50 %	0 %	50 %	0 %	154707555
4524	NC_009727	CTT	2	6	203578	203583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707555
4525	NC_009727	GCT	2	6	203592	203597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154707555
4526	NC_009727	T	6	6	203597	203602	0 %	100 %	0 %	0 %	154707555
4527	NC_009727	ACC	2	6	203661	203666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154707555
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4529	NC_009727	CTTC	2	8	203710	203717	0 %	50 %	0 %	50 %	154707555
4530	NC_009727	T	6	6	203778	203783	0 %	100 %	0 %	0 %	154707555
4531	NC_009727	T	6	6	203810	203815	0 %	100 %	0 %	0 %	154707555
4532	NC_009727	GTAA	2	8	203827	203834	50 %	25 %	25 %	0 %	154707555
4533	NC_009727	ATA	2	6	203835	203840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707555
4534	NC_009727	T	6	6	203956	203961	0 %	100 %	0 %	0 %	154707555
4535	NC_009727	TA	3	6	204056	204061	50 %	50 %	0 %	0 %	154707555
4536	NC_009727	GCCT	2	8	204136	204143	0 %	25 %	25 %	50 %	154707555
4537	NC_009727	TGC	2	6	204165	204170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154707555
4538	NC_009727	CT	3	6	204188	204193	0 %	50 %	0 %	50 %	154707555
4539	NC_009727	GA	3	6	204211	204216	50 %	0 %	50 %	0 %	154707555
4540	NC_009727	GGT	2	6	204296	204301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_009727	TCA	2	6	204376	204381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706696
4542	NC_009727	GT	3	6	204407	204412	0 %	50 %	50 %	0 %	154706696
4543	NC_009727	T	8	8	204429	204436	0 %	100 %	0 %	0 %	154706696
4544	NC_009727	CGG	2	6	204442	204447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706696
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4546	NC_009727	ATTC	2	8	204538	204545	25 %	50 %	0 %	25 %	209363721
4547	NC_009727	T	6	6	204596	204601	0 %	100 %	0 %	0 %	209363721
4548	NC_009727	CAA	2	6	204676	204681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363721
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4550	NC_009727	TGT	2	6	204704	204709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363721
4551	NC_009727	TGA	2	6	204758	204763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363721
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4553	NC_009727	TCC	2	6	204869	204874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209363721
4554	NC_009727	CAA	2	6	204904	204909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363721
4555	NC_009727	ACAA	2	8	204918	204925	75 %	0 %	0 %	25 %	209363721
4556	NC_009727	TCGC	2	8	204965	204972	0 %	25 %	25 %	50 %	209363721
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4559	NC_009727	TTG	2	6	205120	205125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363721
4560	NC_009727	TGC	2	6	205235	205240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363721
4561	NC_009727	CTC	2	6	205299	205304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209363721
4562	NC_009727	CAC	2	6	205318	205323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_009727	ATAC	2	8	205353	205360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_009727	TCA	2	6	205402	205407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_009727	CA	3	6	205412	205417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_009727	GGGT	2	8	205534	205541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_009727	TACTT	2	10	205556	205565	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4568	NC_009727	GCTA	2	8	205597	205604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_009727	CCA	2	6	205620	205625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_009727	T	6	6	205802	205807	0 %	100 %	0 %	0 %	209363722
4571	NC_009727	CGATCG	2	12	205838	205849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209363722
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4577	NC_009727	CGGCGA	2	12	206132	206143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209363722
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4581	NC_009727	CGA	2	6	206267	206272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363722
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4583	NC_009727	CAT	2	6	206408	206413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363722
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4589	NC_009727	CTTT	2	8	206751	206758	0 %	75 %	0 %	25 %	209363722
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4592	NC_009727	GCGT	2	8	206899	206906	0 %	25 %	50 %	25 %	209363722
4593	NC_009727	AATG	2	8	206927	206934	50 %	25 %	25 %	0 %	209363722
4594	NC_009727	CG	3	6	206996	207001	0 %	0 %	50 %	50 %	209363722
4595	NC_009727	TGCGG	2	10	207005	207014	0 %	20 %	60 %	20 %	209363722
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4606	NC_009727	TA	3	6	207661	207666	50 %	50 %	0 %	0 %	209363722
4607	NC_009727	GC	3	6	207739	207744	0 %	0 %	50 %	50 %	154707520
4608	NC_009727	A	6	6	207760	207765	100 %	0 %	0 %	0 %	154707520
4609	NC_009727	GGTG	2	8	207865	207872	0 %	25 %	75 %	0 %	154707520
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4622	NC_009727	A	6	6	208436	208441	100 %	0 %	0 %	0 %	154707520
4623	NC_009727	TTAG	2	8	208442	208449	25 %	50 %	25 %	0 %	154707520
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