MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 chromosome

Total Repeats: 1959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009706	GTAACA	2	12	377	388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153952671
2	NC_009706	TAAAAA	2	12	2097	2108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153952672
3	NC_009706	AAATTA	2	12	2753	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952673
4	NC_009706	TGAAGT	2	12	4830	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952676
5	NC_009706	CAGATG	2	12	5924	5935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153952676
6	NC_009706	TAAAAA	2	12	6048	6059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153952676
7	NC_009706	ATGCTA	2	12	7281	7292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153952677
8	NC_009706	ACAGGC	2	12	7609	7620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153952677
9	NC_009706	GATGAG	2	12	8621	8632	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	153952677
10	NC_009706	TTAAAT	2	12	8945	8956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009706	AGAATT	2	12	14836	14847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952678
12	NC_009706	AAACAA	2	12	27673	27684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	153952690
13	NC_009706	TTTAAC	2	12	29875	29886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009706	CATTTA	2	12	31701	31712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153952694
15	NC_009706	TTTTCA	2	12	34106	34117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153952696
16	NC_009706	CCAATG	2	12	35630	35641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	153952697
17	NC_009706	AAAATA	2	12	37276	37287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153952698
18	NC_009706	CAACTA	2	12	43392	43403	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009706	TATAAA	2	12	43723	43734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009706	CAAAAC	2	12	46259	46270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153952706
21	NC_009706	TTTTAA	2	12	46589	46600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009706	TAATCT	2	12	50479	50490	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009706	CAATAT	2	12	58492	58503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153952718
24	NC_009706	ATGTTG	2	12	61588	61599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	153952724
25	NC_009706	ACTTTC	2	12	65222	65233	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	153952727
26	NC_009706	CTTTTT	2	12	66676	66687	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	153952730
27	NC_009706	AAATAC	2	12	77069	77080	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153952741
28	NC_009706	AATTTT	2	12	78091	78102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009706	AGATGT	2	12	83789	83800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952747
30	NC_009706	AAAGGT	2	12	84734	84745	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153952747
31	NC_009706	TACTAA	2	12	84929	84940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153952747
32	NC_009706	TTAATT	2	12	87655	87666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009706	TAGATA	2	12	93128	93139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952755
34	NC_009706	TAAATG	2	12	96015	96026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952759
35	NC_009706	CTTGAT	2	12	96518	96529	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	153952760
36	NC_009706	TTATTT	2	12	101812	101823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009706	GTATTT	2	12	102769	102780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153952767
38	NC_009706	TATATG	2	12	105074	105085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009706	TATAGG	2	12	108287	108298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952773
40	NC_009706	CAGTGC	3	18	109845	109862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	153952774
41	NC_009706	TTTTTA	2	12	110230	110241	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153952774
42	NC_009706	ATTTTT	2	12	112119	112130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153952774
43	NC_009706	TATATT	2	12	113215	113226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952775
44	NC_009706	TTTATA	2	12	116883	116894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952780
45	NC_009706	CTTCTA	2	12	119240	119251	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	153952783
46	NC_009706	ATCTAA	2	12	119385	119396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153952783
47	NC_009706	AAAGAT	2	12	122125	122136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153952784
48	NC_009706	ATATTT	2	12	126455	126466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952788
49	NC_009706	GATACA	2	12	128135	128146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153952789
50	NC_009706	AAAGAT	2	12	129183	129194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153952790
51	NC_009706	TCTTTT	2	12	131795	131806	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	153952794
52	NC_009706	TTTATC	2	12	132277	132288	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153952794
53	NC_009706	GCCTAT	2	12	134551	134562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	153952796
54	NC_009706	GTATTA	2	12	134780	134791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009706	AGATAG	2	12	140863	140874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153952802
56	NC_009706	CAGAAT	2	12	141009	141020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153952802
57	NC_009706	GGACTT	2	12	141083	141094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	153952802
58	NC_009706	ATAGAA	2	12	142423	142434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153952803
59	NC_009706	TATAGA	2	12	142837	142848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952804
60	NC_009706	ATTTTA	2	12	144472	144483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952805
61	NC_009706	GATGTA	2	12	145420	145431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952805
62	NC_009706	AGTGGC	2	12	145824	145835	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	153952805
63	NC_009706	ATAAAT	2	12	150123	150134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952808
64	NC_009706	AACAAT	2	12	151897	151908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009706	ATTTTA	2	12	152120	152131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009706	AAAAGA	2	12	154364	154375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153952815
67	NC_009706	AAAAAG	2	12	154486	154497	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153952815
68	NC_009706	ATATAA	2	12	155376	155387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009706	TAGAAT	2	12	156492	156503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952816
70	NC_009706	GATATA	2	12	157682	157693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952816
71	NC_009706	ATAGCT	2	12	158476	158487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153952817
72	NC_009706	AGATTT	2	12	159760	159771	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153952818
73	NC_009706	AAAGTT	2	12	159914	159925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952818
74	NC_009706	GTTTAT	2	12	160496	160507	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153952819
75	NC_009706	AGAAAA	2	12	161879	161890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153952819
76	NC_009706	TAATAT	2	12	164573	164584	50 %	50 %	0 %	0 %	153952823
77	NC_009706	AGATGA	2	12	165649	165660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153952824
78	NC_009706	AAGAGA	2	12	167232	167243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952825
79	NC_009706	TGGAAT	2	12	168638	168649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952826
80	NC_009706	GACATT	2	12	173808	173819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009706	GATATT	2	12	178516	178527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153952828
82	NC_009706	GGAGCT	2	12	184317	184328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	153952834
83	NC_009706	AAAGAA	2	12	184734	184745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153952834
84	NC_009706	GGAAAA	2	12	185385	185396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952834
85	NC_009706	TATAAT	2	12	185417	185428	50 %	50 %	0 %	0 %	153952834
86	NC_009706	TCTAAA	2	12	187172	187183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153952835
87	NC_009706	AGAAAA	2	12	187422	187433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153952836
88	NC_009706	AGTTAT	2	12	187764	187775	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153952836
89	NC_009706	TGAAAT	2	12	188016	188027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952836
90	NC_009706	AGCTAG	2	12	188406	188417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153952836
91	NC_009706	AATTAA	2	12	191291	191302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009706	ATAGAT	2	12	191873	191884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952840
93	NC_009706	TAAATA	2	12	192147	192158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952840
94	NC_009706	AAGGAA	2	12	193928	193939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952842
95	NC_009706	TTTAAT	2	12	194609	194620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009706	TTTGAT	2	12	199081	199092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153952850
97	NC_009706	CAGTAG	2	12	200302	200313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153952852
98	NC_009706	AGGATT	2	12	200432	200443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952852
99	NC_009706	TGGATA	2	12	201066	201077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952853
100	NC_009706	TAAAGG	2	12	201135	201146	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153952853
101	NC_009706	ATTGAA	2	12	201842	201853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952853
102	NC_009706	TAAATA	2	12	201888	201899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952853
103	NC_009706	CAGCAC	2	12	208752	208763	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	153952856
104	NC_009706	AATAAC	2	12	209944	209955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153952858
105	NC_009706	AATAAG	2	12	213449	213460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153952860
106	NC_009706	TAGGTG	2	12	220593	220604	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	153952875
107	NC_009706	TAGTTG	2	12	221748	221759	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	153952878
108	NC_009706	TGTAGG	2	12	221776	221787	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	153952878
109	NC_009706	TAGAAG	2	12	222315	222326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153952879
110	NC_009706	AAACAG	2	12	225935	225946	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153952885
111	NC_009706	TAGAAA	2	12	227638	227649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153952889
112	NC_009706	TATATT	2	12	231014	231025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952893
113	NC_009706	GTAATA	2	12	232680	232691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952895
114	NC_009706	CTGTTT	2	12	234612	234623	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	153952898
115	NC_009706	CTGGCA	2	12	241315	241326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	153952907
116	NC_009706	AACCAT	2	12	241819	241830	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	153952907
117	NC_009706	ACAGGA	2	12	246036	246047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153952912
118	NC_009706	GATAAT	2	12	246752	246763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952913
119	NC_009706	CGTCCT	2	12	249323	249334	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	153952918
120	NC_009706	GCTCCG	2	12	249545	249556	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	153952918
121	NC_009706	CCGTTC	2	12	249821	249832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	153952918
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239	NC_009706	TTGAGA	2	12	464822	464833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153953125
240	NC_009706	ACCTCC	2	12	466332	466343	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
241	NC_009706	ATGATA	2	12	467300	467311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
242	NC_009706	ATCCTT	2	12	469118	469129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	153953132
243	NC_009706	TAAATA	2	12	475220	475231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_009706	TTGTAA	2	12	479186	479197	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153953144
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246	NC_009706	CTTATA	2	12	480392	480403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153953145
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259	NC_009706	AAATTG	2	12	511719	511730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153953172
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