MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland plasmid pCLI

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009700	ATTT	2	8	486	493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009700	TAAA	2	8	507	514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009700	ATTT	2	8	679	686	25 %	75 %	0 %	0 %	153941554
4	NC_009700	CTAT	2	8	756	763	25 %	50 %	0 %	25 %	153941554
5	NC_009700	TAAC	2	8	929	936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009700	CTAT	2	8	1076	1083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009700	TATC	2	8	1093	1100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009700	TTGT	2	8	1283	1290	0 %	75 %	25 %	0 %	153941563
9	NC_009700	TAAT	2	8	1695	1702	50 %	50 %	0 %	0 %	153941569
10	NC_009700	ATAA	2	8	2243	2250	75 %	25 %	0 %	0 %	153941566
11	NC_009700	TAAT	2	8	2381	2388	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
12	NC_009700	AAAT	2	8	2396	2403	75 %	25 %	0 %	0 %	153941561
13	NC_009700	ATGA	2	8	3195	3202	50 %	25 %	25 %	0 %	153941565
14	NC_009700	GGCT	2	8	3353	3360	0 %	25 %	50 %	25 %	153941565
15	NC_009700	ATTA	2	8	3475	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
16	NC_009700	GGGT	2	8	3490	3497	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009700	AATT	2	8	3506	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009700	AAGG	2	8	3526	3533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009700	TTAC	2	8	3642	3649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009700	TTTA	2	8	3888	3895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009700	TAAA	2	8	4257	4264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009700	ATTA	2	8	4322	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009700	TATT	2	8	4345	4352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009700	TATT	2	8	4368	4375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009700	ACTT	2	8	4448	4455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009700	TAAT	2	8	4490	4497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009700	TTAT	3	12	4723	4734	25 %	75 %	0 %	0 %	153941558
28	NC_009700	TTTG	2	8	5183	5190	0 %	75 %	25 %	0 %	153941558
29	NC_009700	TAAA	2	8	5414	5421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009700	ATCT	2	8	5677	5684	25 %	50 %	0 %	25 %	153941548
31	NC_009700	CTTT	2	8	5760	5767	0 %	75 %	0 %	25 %	153941548
32	NC_009700	CTTT	2	8	5982	5989	0 %	75 %	0 %	25 %	153941548
33	NC_009700	AATA	2	8	6005	6012	75 %	25 %	0 %	0 %	153941548
34	NC_009700	TAAA	2	8	6248	6255	75 %	25 %	0 %	0 %	153941548
35	NC_009700	TTAT	2	8	6270	6277	25 %	75 %	0 %	0 %	153941548
36	NC_009700	TAAT	2	8	6517	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	153941548
37	NC_009700	AATT	2	8	6560	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	153941548
38	NC_009700	AATA	2	8	7577	7584	75 %	25 %	0 %	0 %	153941551
39	NC_009700	AGTT	2	8	7755	7762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009700	ATCT	2	8	8257	8264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009700	TACA	2	8	8554	8561	50 %	25 %	0 %	25 %	153941560
42	NC_009700	TAAA	2	8	9092	9099	75 %	25 %	0 %	0 %	153941560
43	NC_009700	TAAT	2	8	9125	9132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009700	AAAT	2	8	9161	9168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009700	ATTC	2	8	9278	9285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009700	ATAA	2	8	9312	9319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009700	AGTA	2	8	9460	9467	50 %	25 %	25 %	0 %	153941559
48	NC_009700	ACTG	2	8	9565	9572	25 %	25 %	25 %	25 %	153941559
49	NC_009700	ATAA	2	8	9920	9927	75 %	25 %	0 %	0 %	153941549
50	NC_009700	TAAT	2	8	10032	10039	50 %	50 %	0 %	0 %	153941568
51	NC_009700	GCTT	2	8	10113	10120	0 %	50 %	25 %	25 %	153941568
52	NC_009700	AATA	2	8	10178	10185	75 %	25 %	0 %	0 %	153941568
53	NC_009700	ATTT	2	8	10343	10350	25 %	75 %	0 %	0 %	153941570
54	NC_009700	TTCA	2	8	10428	10435	25 %	50 %	0 %	25 %	153941570
55	NC_009700	ATCT	2	8	10499	10506	25 %	50 %	0 %	25 %	153941570
56	NC_009700	AATA	2	8	11046	11053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009700	TTTA	2	8	11269	11276	25 %	75 %	0 %	0 %	153941562
58	NC_009700	CTAT	2	8	11963	11970	25 %	50 %	0 %	25 %	153941562
59	NC_009700	ATTT	2	8	12366	12373	25 %	75 %	0 %	0 %	153941562
60	NC_009700	ACTG	2	8	12539	12546	25 %	25 %	25 %	25 %	153941562
61	NC_009700	ATAC	2	8	12879	12886	50 %	25 %	0 %	25 %	153941555
62	NC_009700	AATT	2	8	13525	13532	50 %	50 %	0 %	0 %	153941555
63	NC_009700	CTAT	2	8	13848	13855	25 %	50 %	0 %	25 %	153941564
64	NC_009700	TTTA	2	8	14216	14223	25 %	75 %	0 %	0 %	153941564
65	NC_009700	ATTT	2	8	14276	14283	25 %	75 %	0 %	0 %	153941564
66	NC_009700	ATTT	2	8	14519	14526	25 %	75 %	0 %	0 %	153941564
67	NC_009700	TCCC	2	8	15156	15163	0 %	25 %	0 %	75 %	153941567
68	NC_009700	TACC	2	8	15233	15240	25 %	25 %	0 %	50 %	153941567
69	NC_009700	ATTC	2	8	15372	15379	25 %	50 %	0 %	25 %	153941567
70	NC_009700	GCTC	2	8	15395	15402	0 %	25 %	25 %	50 %	153941567
71	NC_009700	TAAA	2	8	15657	15664	75 %	25 %	0 %	0 %	153941567
72	NC_009700	TATT	2	8	15735	15742	25 %	75 %	0 %	0 %	153941567
73	NC_009700	TTAT	2	8	16205	16212	25 %	75 %	0 %	0 %	153941567
74	NC_009700	CTAT	2	8	16502	16509	25 %	50 %	0 %	25 %	153941567
75	NC_009700	TAAA	2	8	16672	16679	75 %	25 %	0 %	0 %	153941567
76	NC_009700	TAAA	2	8	17133	17140	75 %	25 %	0 %	0 %	153941567
77	NC_009700	CCTT	2	8	17222	17229	0 %	50 %	0 %	50 %	153941567

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.