MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland chromosome

Total Repeats: 63545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009699	AAT	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
2	NC_009699	ACT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940298
3	NC_009699	GAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
4	NC_009699	ATA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
5	NC_009699	ATG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
6	NC_009699	CTA	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940298
7	NC_009699	GCA	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153940298
8	NC_009699	TGG	2	6	441	446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153940298
9	NC_009699	AGT	2	6	519	524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
10	NC_009699	TCT	2	6	532	537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153940298
11	NC_009699	GAT	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
12	NC_009699	TGA	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
13	NC_009699	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
14	NC_009699	AGA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
15	NC_009699	TAA	2	6	947	952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
16	NC_009699	TAG	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
17	NC_009699	TCA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940298
18	NC_009699	TAA	2	6	978	983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
19	NC_009699	ATT	2	6	1063	1068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940298
20	NC_009699	AAG	2	6	1070	1075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
21	NC_009699	TAT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940298
22	NC_009699	AGA	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
23	NC_009699	AGA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
24	NC_009699	GAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
25	NC_009699	TAC	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940298
26	NC_009699	TAA	2	6	1266	1271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
27	NC_009699	TAA	2	6	1359	1364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009699	TTG	2	6	1377	1382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009699	ATT	2	6	1455	1460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009699	CAA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009699	CTA	6	18	1521	1538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009699	TAT	2	6	1542	1547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009699	TAA	2	6	1581	1586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009699	AGG	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009699	TAT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
36	NC_009699	TTA	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
37	NC_009699	TAA	2	6	1711	1716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
38	NC_009699	AGA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
39	NC_009699	ATA	2	6	1829	1834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
40	NC_009699	AGA	2	6	1873	1878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
41	NC_009699	ATA	2	6	1892	1897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
42	NC_009699	TAT	2	6	1957	1962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
43	NC_009699	TAG	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939951
44	NC_009699	AAG	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
45	NC_009699	GTT	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153939951
46	NC_009699	AGA	3	9	2215	2223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
47	NC_009699	AAT	2	6	2287	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
48	NC_009699	ATT	2	6	2299	2304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
49	NC_009699	TTA	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
50	NC_009699	GAA	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
51	NC_009699	ATA	2	6	2360	2365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
52	NC_009699	AAG	2	6	2418	2423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
53	NC_009699	GAT	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939951
54	NC_009699	TAA	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
55	NC_009699	GAA	2	6	2504	2509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
56	NC_009699	AGT	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939951
57	NC_009699	TAT	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
58	NC_009699	AAT	2	6	2696	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
59	NC_009699	ATA	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938642
60	NC_009699	CAA	2	6	2787	2792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153938642
61	NC_009699	GAC	2	6	2885	2890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153938642
62	NC_009699	TAA	2	6	2902	2907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938642
63	NC_009699	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938642
64	NC_009699	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009699	AAT	2	6	2958	2963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009699	TAT	2	6	2977	2982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009699	TAA	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
68	NC_009699	ATG	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940655
69	NC_009699	TAA	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
70	NC_009699	ATA	2	6	3204	3209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
71	NC_009699	TGT	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153940655
72	NC_009699	AGA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
73	NC_009699	AAT	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
74	NC_009699	TAT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940655
75	NC_009699	ATA	2	6	3468	3473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
76	NC_009699	ATG	2	6	3543	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940655
77	NC_009699	ATT	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940655
78	NC_009699	AAG	2	6	3635	3640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
79	NC_009699	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
80	NC_009699	ATT	2	6	3715	3720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940655
81	NC_009699	GAT	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940655
82	NC_009699	ACA	2	6	3844	3849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153940655
83	NC_009699	CAT	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940655
84	NC_009699	ATA	2	6	3890	3895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
85	NC_009699	ATA	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
86	NC_009699	GAT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940655
87	NC_009699	TAA	2	6	4005	4010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
88	NC_009699	AGA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
89	NC_009699	AAG	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
90	NC_009699	TAA	2	6	4075	4080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
91	NC_009699	TTC	2	6	4127	4132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153939945
92	NC_009699	GTA	3	9	4147	4155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939945
93	NC_009699	TTG	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153939945
94	NC_009699	AGG	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009699	ATG	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939432
96	NC_009699	TCA	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153939432
97	NC_009699	ATA	2	6	4546	4551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939432
98	NC_009699	GAT	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939432
99	NC_009699	CTG	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153939432
100	NC_009699	TAA	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939432
101	NC_009699	TGG	3	9	4724	4732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153939432
102	NC_009699	TGG	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153939432
103	NC_009699	TGT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153939432
104	NC_009699	AGA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939432
105	NC_009699	TGA	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939432
106	NC_009699	CAA	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153939432
107	NC_009699	ATT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939432
108	NC_009699	CAG	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153939432
109	NC_009699	TAG	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939432
110	NC_009699	ATA	2	6	5517	5522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939432
111	NC_009699	AGA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939432
112	NC_009699	TTC	2	6	5639	5644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153939432
113	NC_009699	CAT	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153939432
114	NC_009699	GAA	2	6	5713	5718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939432
115	NC_009699	ATA	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939432
116	NC_009699	AAT	2	6	5882	5887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939432
117	NC_009699	AGA	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939432
118	NC_009699	ACC	2	6	5999	6004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153939432
119	NC_009699	TGC	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153939432
120	NC_009699	ATT	2	6	6071	6076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939432
121	NC_009699	AAC	2	6	6145	6150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153939432
122	NC_009699	TAC	2	6	6158	6163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153939432
123	NC_009699	TTA	2	6	6186	6191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939432
124	NC_009699	AAG	2	6	6263	6268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939432
125	NC_009699	AAT	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939432
126	NC_009699	GAA	2	6	6390	6395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153938259
127	NC_009699	AGA	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153938259
128	NC_009699	ATA	2	6	6481	6486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938259
129	NC_009699	ATC	2	6	6569	6574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153938259
130	NC_009699	CAG	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153938259
131	NC_009699	TAG	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153938259
132	NC_009699	AGC	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153938259
133	NC_009699	GAA	4	12	6793	6804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153938259
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266	NC_009699	GTA	2	6	16748	16753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941427
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