MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland chromosome

Total Repeats: 114701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009699	TA	3	6	19298	19303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009699	AATT	2	8	19307	19314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009699	A	7	7	19338	19344	100 %	0 %	0 %	0 %	153938168
504	NC_009699	TA	3	6	19348	19353	50 %	50 %	0 %	0 %	153938168
505	NC_009699	TTG	2	6	19354	19359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153938168
506	NC_009699	ATT	3	9	19373	19381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938168
507	NC_009699	TACA	2	8	19396	19403	50 %	25 %	0 %	25 %	153938168
508	NC_009699	A	7	7	19403	19409	100 %	0 %	0 %	0 %	153938168
509	NC_009699	TAA	2	6	19424	19429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938168
510	NC_009699	AAAT	2	8	19450	19457	75 %	25 %	0 %	0 %	153938168
511	NC_009699	GAAAT	2	10	19474	19483	60 %	20 %	20 %	0 %	153938168
512	NC_009699	A	7	7	19512	19518	100 %	0 %	0 %	0 %	153938168
513	NC_009699	TTA	2	6	19520	19525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938168
514	NC_009699	TA	3	6	19524	19529	50 %	50 %	0 %	0 %	153938168
515	NC_009699	AATAAA	2	12	19530	19541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153938168
516	NC_009699	TA	3	6	19549	19554	50 %	50 %	0 %	0 %	153938168
517	NC_009699	TAT	2	6	19579	19584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938168
518	NC_009699	ATT	2	6	19585	19590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938168
519	NC_009699	GAT	2	6	19599	19604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153938168
520	NC_009699	AT	4	8	19634	19641	50 %	50 %	0 %	0 %	153938168
521	NC_009699	GAA	2	6	19647	19652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153938168
522	NC_009699	GAA	2	6	19663	19668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153938168
523	NC_009699	GGAT	2	8	19671	19678	25 %	25 %	50 %	0 %	153938168
524	NC_009699	A	8	8	19680	19687	100 %	0 %	0 %	0 %	153938168
525	NC_009699	ATA	2	6	19785	19790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938168
526	NC_009699	A	6	6	19790	19795	100 %	0 %	0 %	0 %	153938168
527	NC_009699	T	6	6	19852	19857	0 %	100 %	0 %	0 %	153938168
528	NC_009699	GGT	2	6	19905	19910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153938168
529	NC_009699	ATATT	2	10	19913	19922	40 %	60 %	0 %	0 %	153938168
530	NC_009699	ATT	2	6	19936	19941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938168
531	NC_009699	ATTC	2	8	19944	19951	25 %	50 %	0 %	25 %	153938168
532	NC_009699	TAATA	2	10	19973	19982	60 %	40 %	0 %	0 %	153938168
533	NC_009699	GAA	3	9	19983	19991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153938168
534	NC_009699	GGA	2	6	20042	20047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153938168
535	NC_009699	TA	3	6	20059	20064	50 %	50 %	0 %	0 %	153938168
536	NC_009699	TAA	2	6	20075	20080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938168
537	NC_009699	TAA	2	6	20086	20091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938168
538	NC_009699	ATT	2	6	20098	20103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938168
539	NC_009699	GA	3	6	20110	20115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009699	TGA	2	6	20121	20126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009699	ATG	2	6	20137	20142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
542	NC_009699	TGA	2	6	20143	20148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
543	NC_009699	AAT	2	6	20162	20167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939164
544	NC_009699	GAT	2	6	20244	20249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
545	NC_009699	ATG	2	6	20278	20283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
546	NC_009699	GAT	2	6	20298	20303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
547	NC_009699	AGC	2	6	20306	20311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153939164
548	NC_009699	TAA	2	6	20330	20335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939164
549	NC_009699	A	6	6	20355	20360	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
550	NC_009699	A	7	7	20376	20382	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
551	NC_009699	TAA	2	6	20392	20397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939164
552	NC_009699	A	6	6	20442	20447	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
553	NC_009699	A	6	6	20465	20470	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
554	NC_009699	A	6	6	20500	20505	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
555	NC_009699	AGA	2	6	20633	20638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939164
556	NC_009699	TAA	2	6	20687	20692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939164
557	NC_009699	TGA	2	6	20732	20737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
558	NC_009699	AT	3	6	20748	20753	50 %	50 %	0 %	0 %	153939164
559	NC_009699	A	7	7	20775	20781	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
560	NC_009699	ATT	2	6	20791	20796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939164
561	NC_009699	A	7	7	20806	20812	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
562	NC_009699	TAA	2	6	20828	20833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939164
563	NC_009699	TAG	2	6	20836	20841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
564	NC_009699	TAA	2	6	20852	20857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939164
565	NC_009699	A	8	8	20867	20874	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
566	NC_009699	GTA	2	6	20899	20904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
567	NC_009699	AAAT	2	8	20980	20987	75 %	25 %	0 %	0 %	153939164
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569	NC_009699	ATG	2	6	21025	21030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
570	NC_009699	GAT	2	6	21045	21050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939164
571	NC_009699	AT	3	6	21068	21073	50 %	50 %	0 %	0 %	153939164
572	NC_009699	TA	3	6	21117	21122	50 %	50 %	0 %	0 %	153939164
573	NC_009699	TAGT	2	8	21145	21152	25 %	50 %	25 %	0 %	153939164
574	NC_009699	AAAG	2	8	21170	21177	75 %	0 %	25 %	0 %	153939164
575	NC_009699	ATT	2	6	21199	21204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939164
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579	NC_009699	AAG	2	6	21362	21367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939164
580	NC_009699	AGC	2	6	21374	21379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153939164
581	NC_009699	TAAA	2	8	21409	21416	75 %	25 %	0 %	0 %	153939164
582	NC_009699	AAAT	2	8	21443	21450	75 %	25 %	0 %	0 %	153939164
583	NC_009699	A	6	6	21476	21481	100 %	0 %	0 %	0 %	153939164
584	NC_009699	AATTT	2	10	21521	21530	40 %	60 %	0 %	0 %	153939164
585	NC_009699	AGG	2	6	21531	21536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009699	ATTT	2	8	21555	21562	25 %	75 %	0 %	0 %	153938251
587	NC_009699	A	6	6	21577	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	153938251
588	NC_009699	TAA	2	6	21669	21674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938251
589	NC_009699	TAC	2	6	21690	21695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153938251
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591	NC_009699	ATA	2	6	21868	21873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938251
592	NC_009699	TTA	2	6	21955	21960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009699	AG	3	6	22024	22029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009699	TAA	2	6	22048	22053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009699	AG	3	6	22119	22124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009699	T	7	7	22191	22197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009699	ATTAT	2	10	22198	22207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009699	TATT	2	8	22235	22242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009699	AATA	2	8	22252	22259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009699	AAT	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939104
601	NC_009699	AAG	2	6	22310	22315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939104
602	NC_009699	TGA	2	6	22356	22361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939104
603	NC_009699	GAA	2	6	22378	22383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939104
604	NC_009699	AGA	2	6	22384	22389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939104
605	NC_009699	TCT	2	6	22438	22443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153939104
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607	NC_009699	TAG	2	6	22487	22492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939104
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610	NC_009699	A	6	6	22556	22561	100 %	0 %	0 %	0 %	153939104
611	NC_009699	AT	3	6	22566	22571	50 %	50 %	0 %	0 %	153939104
612	NC_009699	ATA	2	6	22631	22636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939104
613	NC_009699	CAA	2	6	22661	22666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153939104
614	NC_009699	ATTTT	2	10	22668	22677	20 %	80 %	0 %	0 %	153939104
615	NC_009699	T	6	6	22812	22817	0 %	100 %	0 %	0 %	153939104
616	NC_009699	ACC	2	6	22857	22862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153939104
617	NC_009699	GAA	2	6	22915	22920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939104
618	NC_009699	GAT	2	6	22942	22947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939104
619	NC_009699	TA	3	6	22988	22993	50 %	50 %	0 %	0 %	153939104
620	NC_009699	TGA	2	6	23013	23018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939104
621	NC_009699	CAG	2	6	23072	23077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153939104
622	NC_009699	ACA	2	6	23103	23108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153939104
623	NC_009699	TAA	2	6	23115	23120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939104
624	NC_009699	GAA	2	6	23161	23166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939104
625	NC_009699	ATG	2	6	23183	23188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939104
626	NC_009699	GTA	2	6	23330	23335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939104
627	NC_009699	CAAG	2	8	23350	23357	50 %	0 %	25 %	25 %	153939104
628	NC_009699	AGA	2	6	23379	23384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939104
629	NC_009699	GCAAAA	2	12	23386	23397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153939104
630	NC_009699	GAA	2	6	23441	23446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939104
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