MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. Hall chromosome

Total Repeats: 4243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009698	AATAA	2	10	3298	3307	80 %	20 %	0 %	0 %	153935303
2	NC_009698	TAAAT	2	10	3603	3612	60 %	40 %	0 %	0 %	153935303
3	NC_009698	TAAAA	2	10	4083	4092	80 %	20 %	0 %	0 %	153935303
4	NC_009698	ACTTT	2	10	5927	5936	20 %	60 %	0 %	20 %	153936801
5	NC_009698	AAGAT	2	10	6315	6324	60 %	20 %	20 %	0 %	153936801
6	NC_009698	TAAAA	2	10	6968	6977	80 %	20 %	0 %	0 %	153935617
7	NC_009698	GGTAA	2	10	9525	9534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009698	TCGTG	2	10	10316	10325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009698	TAAGT	2	10	12053	12062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009698	AAATT	2	10	14637	14646	60 %	40 %	0 %	0 %	153934873
11	NC_009698	AATAA	2	10	15375	15384	80 %	20 %	0 %	0 %	153937121
12	NC_009698	ATATA	2	10	15753	15762	60 %	40 %	0 %	0 %	153936038
13	NC_009698	TTTTA	2	10	16315	16324	20 %	80 %	0 %	0 %	153936038
14	NC_009698	AATAA	2	10	16664	16673	80 %	20 %	0 %	0 %	153937022
15	NC_009698	TTATT	2	10	17107	17116	20 %	80 %	0 %	0 %	153937022
16	NC_009698	TATAA	2	10	17753	17762	60 %	40 %	0 %	0 %	153937022
17	NC_009698	CAAAG	2	10	18542	18551	60 %	0 %	20 %	20 %	153937022
18	NC_009698	TAATG	2	10	18727	18736	40 %	40 %	20 %	0 %	153937022
19	NC_009698	TAAAA	2	10	19275	19284	80 %	20 %	0 %	0 %	153937022
20	NC_009698	GAAAT	2	10	19564	19573	60 %	20 %	20 %	0 %	153937535
21	NC_009698	ATATT	2	10	20003	20012	40 %	60 %	0 %	0 %	153937535
22	NC_009698	TAATA	2	10	20063	20072	60 %	40 %	0 %	0 %	153937535
23	NC_009698	ATAGT	2	10	21121	21130	40 %	40 %	20 %	0 %	153935047
24	NC_009698	AATTT	2	10	21611	21620	40 %	60 %	0 %	0 %	153935047
25	NC_009698	ATTAT	2	10	22288	22297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009698	CTAAA	2	10	22541	22550	60 %	20 %	0 %	20 %	153937253
27	NC_009698	TGAAA	2	10	22584	22593	60 %	20 %	20 %	0 %	153937253
28	NC_009698	TCAAT	2	10	23199	23208	40 %	40 %	0 %	20 %	153937253
29	NC_009698	TTTAA	2	10	23672	23681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009698	ATTAA	2	10	23692	23701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009698	TATTT	2	10	23764	23773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009698	TTTTA	2	10	26425	26434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009698	AATTA	2	10	26506	26515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009698	ATATT	2	10	26567	26576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009698	TTAAT	2	10	26980	26989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009698	AATAA	2	10	27870	27879	80 %	20 %	0 %	0 %	153936191
37	NC_009698	TATGT	2	10	28699	28708	20 %	60 %	20 %	0 %	153936228
38	NC_009698	TTATT	2	10	28817	28826	20 %	80 %	0 %	0 %	153935706
39	NC_009698	GGATT	2	10	29020	29029	20 %	40 %	40 %	0 %	153935706
40	NC_009698	ATTAT	2	10	29810	29819	40 %	60 %	0 %	0 %	153934746
41	NC_009698	ATTTT	2	10	30320	30329	20 %	80 %	0 %	0 %	153934746
42	NC_009698	TAATT	2	10	32495	32504	40 %	60 %	0 %	0 %	153937271
43	NC_009698	ATTTT	2	10	33324	33333	20 %	80 %	0 %	0 %	153934830
44	NC_009698	TAAAT	2	10	33662	33671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009698	ATATA	2	10	33950	33959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009698	AATAA	2	10	35507	35516	80 %	20 %	0 %	0 %	153935787
47	NC_009698	AAAAT	2	10	37116	37125	80 %	20 %	0 %	0 %	153937691
48	NC_009698	CAATA	2	10	37207	37216	60 %	20 %	0 %	20 %	153937691
49	NC_009698	ATATT	2	10	37547	37556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009698	AATAA	2	10	37605	37614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009698	GATTT	2	10	38624	38633	20 %	60 %	20 %	0 %	153935315
52	NC_009698	TAATA	2	10	41157	41166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009698	GAATA	2	10	41244	41253	60 %	20 %	20 %	0 %	153935371
54	NC_009698	TTATT	2	10	41260	41269	20 %	80 %	0 %	0 %	153935371
55	NC_009698	ATAAA	2	10	41639	41648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009698	GATTT	2	10	41994	42003	20 %	60 %	20 %	0 %	153937461
57	NC_009698	ACACC	2	10	42203	42212	40 %	0 %	0 %	60 %	153937461
58	NC_009698	AAAAG	2	10	42253	42262	80 %	0 %	20 %	0 %	153937461
59	NC_009698	ATAGA	2	10	43916	43925	60 %	20 %	20 %	0 %	153934545
60	NC_009698	GCAAT	2	10	44573	44582	40 %	20 %	20 %	20 %	153934545
61	NC_009698	AAAGA	2	10	44590	44599	80 %	0 %	20 %	0 %	153934545
62	NC_009698	AGTAT	2	10	45599	45608	40 %	40 %	20 %	0 %	153935856
63	NC_009698	TTAAT	2	10	46636	46645	40 %	60 %	0 %	0 %	153935425
64	NC_009698	ATTGT	2	10	47819	47828	20 %	60 %	20 %	0 %	153934499
65	NC_009698	ATAGA	2	10	47924	47933	60 %	20 %	20 %	0 %	153934499
66	NC_009698	GGTAA	2	10	48711	48720	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009698	TCGTG	2	10	49502	49511	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009698	TAAGT	2	10	51240	51249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009698	AAAAT	2	10	53091	53100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009698	AATAA	2	10	53765	53774	80 %	20 %	0 %	0 %	153937546
71	NC_009698	GAATA	2	10	54116	54125	60 %	20 %	20 %	0 %	153937546
72	NC_009698	GGTAA	2	10	55339	55348	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009698	TCGTG	2	10	56130	56139	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009698	TAAGT	2	10	57868	57877	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009698	AAAAT	2	10	59719	59728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009698	TTATA	2	10	60298	60307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009698	GGTAA	2	10	63284	63293	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009698	TCGTG	2	10	64075	64084	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009698	TAAGT	2	10	65813	65822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009698	AAAAT	2	10	67664	67673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009698	GAAGA	2	10	68173	68182	60 %	0 %	40 %	0 %	153936847
82	NC_009698	AAATA	2	10	68791	68800	80 %	20 %	0 %	0 %	153936847
83	NC_009698	ATTAT	2	10	68914	68923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009698	TCGTG	2	10	70357	70366	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009698	TAAGT	2	10	72095	72104	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009698	AAAAT	2	10	73946	73955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009698	ATTTT	2	10	74431	74440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009698	TTGAA	2	10	75352	75361	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009698	CAATC	2	10	75503	75512	40 %	20 %	0 %	40 %	153935897
90	NC_009698	TTATT	2	10	77780	77789	20 %	80 %	0 %	0 %	153936188
91	NC_009698	ATTTT	2	10	77797	77806	20 %	80 %	0 %	0 %	153936188
92	NC_009698	ATTTT	2	10	78150	78159	20 %	80 %	0 %	0 %	153936188
93	NC_009698	AAAAT	2	10	78184	78193	80 %	20 %	0 %	0 %	153936188
94	NC_009698	TTTCC	2	10	78865	78874	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009698	ATTTT	2	10	78880	78889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009698	GAATA	2	10	79440	79449	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009698	TATAA	2	10	81018	81027	60 %	40 %	0 %	0 %	153935270
98	NC_009698	AATAT	2	10	82052	82061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009698	TAAAT	2	10	82868	82877	60 %	40 %	0 %	0 %	153935866
100	NC_009698	TAAAT	2	10	83661	83670	60 %	40 %	0 %	0 %	153935087
101	NC_009698	TAGAA	2	10	83790	83799	60 %	20 %	20 %	0 %	153935087
102	NC_009698	GATAG	2	10	85398	85407	40 %	20 %	40 %	0 %	153935508
103	NC_009698	AGGAT	2	10	86099	86108	40 %	20 %	40 %	0 %	153936779
104	NC_009698	AATGG	2	10	86346	86355	40 %	20 %	40 %	0 %	153936779
105	NC_009698	AAATT	2	10	86531	86540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009698	AAAGA	2	10	87087	87096	80 %	0 %	20 %	0 %	153937146
107	NC_009698	ATTTA	2	10	88182	88191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009698	CAATA	2	10	88442	88451	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009698	TTTAA	2	10	88848	88857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009698	AAGTT	2	10	89742	89751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009698	TAAAT	2	10	91203	91212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009698	TATAA	2	10	92298	92307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009698	ATTTT	2	10	93368	93377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009698	ATTTA	2	10	93570	93579	40 %	60 %	0 %	0 %	153936920
115	NC_009698	TAATA	2	10	93840	93849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009698	TAATA	2	10	95025	95034	60 %	40 %	0 %	0 %	153934572
117	NC_009698	ATATT	2	10	97209	97218	40 %	60 %	0 %	0 %	153935117
118	NC_009698	AGAAA	2	10	99709	99718	80 %	0 %	20 %	0 %	153936823
119	NC_009698	AAAAC	2	10	99754	99763	80 %	0 %	0 %	20 %	153936823
120	NC_009698	AAATT	2	10	100724	100733	60 %	40 %	0 %	0 %	153937583
121	NC_009698	AAATG	2	10	100992	101001	60 %	20 %	20 %	0 %	153937583
122	NC_009698	GAAGT	2	10	102005	102014	40 %	20 %	40 %	0 %	153934841
123	NC_009698	AGATA	2	10	102627	102636	60 %	20 %	20 %	0 %	153934841
124	NC_009698	GAAAA	2	10	103570	103579	80 %	0 %	20 %	0 %	153935585
125	NC_009698	ACATT	2	10	106581	106590	40 %	40 %	0 %	20 %	153937636
126	NC_009698	AAAAT	2	10	109069	109078	80 %	20 %	0 %	0 %	153937786
127	NC_009698	ATTTA	2	10	110046	110055	40 %	60 %	0 %	0 %	153934714
128	NC_009698	GTTAT	2	10	112657	112666	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009698	GAAAT	2	10	113357	113366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009698	ATTTT	2	10	114398	114407	20 %	80 %	0 %	0 %	153935993
131	NC_009698	ATACA	2	10	114915	114924	60 %	20 %	0 %	20 %	153935494
132	NC_009698	AATAT	2	10	115219	115228	60 %	40 %	0 %	0 %	153935494
133	NC_009698	TAAAA	2	10	115511	115520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009698	AAGAA	2	10	116484	116493	80 %	0 %	20 %	0 %	153935349
135	NC_009698	TAATA	2	10	116772	116781	60 %	40 %	0 %	0 %	153935349
136	NC_009698	AGAGA	2	10	116806	116815	60 %	0 %	40 %	0 %	153935349
137	NC_009698	TAAAT	2	10	117396	117405	60 %	40 %	0 %	0 %	153935349
138	NC_009698	TAATT	2	10	119736	119745	40 %	60 %	0 %	0 %	153936562
139	NC_009698	ATTAT	2	10	120468	120477	40 %	60 %	0 %	0 %	153937324
140	NC_009698	GAAAA	2	10	121839	121848	80 %	0 %	20 %	0 %	153934659
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142	NC_009698	AAAAG	2	10	122623	122632	80 %	0 %	20 %	0 %	153934659
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