MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 19397 chromosome

Total Repeats: 2515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009697	TAGCAG	2	12	401	412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153930843
2	NC_009697	AAAAAT	2	12	1340	1351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153930843
3	NC_009697	TCTATT	2	12	1561	1572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009697	GATAAT	2	12	2159	2170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153931816
5	NC_009697	AAGTTA	2	12	2841	2852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153932828
6	NC_009697	CAAATA	2	12	3074	3085	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153933867
7	NC_009697	ATAAAG	2	12	3170	3181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153933867
8	NC_009697	GAAGTA	2	12	4802	4813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153931278
9	NC_009697	TTGATA	2	12	5853	5864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153931278
10	NC_009697	GATTAG	2	12	6499	6510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153932201
11	NC_009697	TTTAAA	2	12	7364	7375	50 %	50 %	0 %	0 %	153932201
12	NC_009697	CAAGCT	2	12	7590	7601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	153932201
13	NC_009697	GATATA	2	12	7809	7820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153932201
14	NC_009697	ATAGAT	2	12	17738	17749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153932174
15	NC_009697	ACAAAT	2	12	18647	18658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153932174
16	NC_009697	AATAAA	2	12	19620	19631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153931833
17	NC_009697	GCAAAA	2	12	23476	23487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153931011
18	NC_009697	AGATTT	2	12	24311	24322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009697	ATTTAG	2	12	25332	25343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009697	TATAAT	2	12	29355	29366	50 %	50 %	0 %	0 %	153933982
21	NC_009697	ATATAA	2	12	30455	30466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009697	ATTTAG	2	12	31138	31149	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153932372
23	NC_009697	ATATAG	2	12	32454	32465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153933391
24	NC_009697	AGAAGC	2	12	32872	32883	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153933391
25	NC_009697	AGATGA	2	12	40006	40017	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153934028
26	NC_009697	CTATAG	2	12	40187	40198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153932718
27	NC_009697	AATATA	2	12	41201	41212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009697	AGAAAA	2	12	42010	42021	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153931903
29	NC_009697	ATGTTT	2	12	47064	47075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153933366
30	NC_009697	TAAAAA	2	12	77487	77498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009697	ATTTAA	2	12	77909	77920	50 %	50 %	0 %	0 %	153933952
32	NC_009697	ATTATA	2	12	81026	81037	50 %	50 %	0 %	0 %	153933078
33	NC_009697	AATATG	2	12	81046	81057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153933078
34	NC_009697	AATTAT	2	12	83068	83079	50 %	50 %	0 %	0 %	153933729
35	NC_009697	GAAAAA	2	12	83609	83620	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153930936
36	NC_009697	TGTAGA	2	12	84444	84455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153931682
37	NC_009697	AAAATA	2	12	86061	86072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153933655
38	NC_009697	GTTTTA	2	12	86294	86305	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153933655
39	NC_009697	AGAAAA	2	12	86329	86340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153933655
40	NC_009697	GTAAGA	2	12	87733	87744	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153931064
41	NC_009697	AATAAA	2	12	88341	88352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009697	TTTCAA	2	12	93443	93454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009697	ATTTAA	2	12	97435	97446	50 %	50 %	0 %	0 %	153930891
44	NC_009697	ATAAAT	2	12	101384	101395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931982
45	NC_009697	AGTTAA	2	12	103248	103259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153932954
46	NC_009697	AGAACA	2	12	106120	106131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153933996
47	NC_009697	AATATA	2	12	108494	108505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933646
48	NC_009697	AGGACA	2	12	109242	109253	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153930962
49	NC_009697	GTAGAT	2	12	109510	109521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930962
50	NC_009697	TACTGA	2	12	112167	112178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153931578
51	NC_009697	TATTAA	2	12	113286	113297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009697	AATAAA	2	12	115347	115358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153931920
53	NC_009697	GATATA	2	12	115435	115446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153931920
54	NC_009697	TAAAGA	2	12	116683	116694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153933790
55	NC_009697	TTAAAT	2	12	120454	120465	50 %	50 %	0 %	0 %	153931647
56	NC_009697	TCAAAA	2	12	122970	122981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153932381
57	NC_009697	TTTGCT	2	12	123996	124007	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	153932381
58	NC_009697	GAAAAA	2	12	126131	126142	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153933124
59	NC_009697	AGGAAA	2	12	126393	126404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153933124
60	NC_009697	AATGTA	2	12	127203	127214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153933124
61	NC_009697	TGGATA	2	12	130254	130265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153933815
62	NC_009697	CATGAA	2	12	131427	131438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153931061
63	NC_009697	ATAAAT	2	12	131541	131552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931061
64	NC_009697	ATAAGA	2	12	137139	137150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153933021
65	NC_009697	ATATAA	2	12	139823	139834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933328
66	NC_009697	ATTTTT	2	12	142744	142755	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153931087
67	NC_009697	GTAAGT	2	12	142978	142989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153931087
68	NC_009697	TTGAAA	2	12	143176	143187	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153933618
69	NC_009697	TGATTT	2	12	143642	143653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153933618
70	NC_009697	AAAGAA	2	12	147770	147781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153933578
71	NC_009697	AATATA	2	12	148849	148860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153932484
72	NC_009697	ATTAGT	2	12	151714	151725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153931054
73	NC_009697	TTAAAG	2	12	156610	156621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153933803
74	NC_009697	TACCTA	2	12	157697	157708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930980
75	NC_009697	ACATTA	2	12	158418	158429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009697	GTAGAA	2	12	160684	160695	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153930964
77	NC_009697	AAGGAA	2	12	161176	161187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009697	AAAAGA	2	12	161243	161254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153932095
79	NC_009697	ATAAAT	2	12	161484	161495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153932095
80	NC_009697	ATAGAA	2	12	161903	161914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153933139
81	NC_009697	AAACTT	2	12	162234	162245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009697	AGATTT	2	12	162495	162506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153934153
83	NC_009697	AAAGAA	2	12	162682	162693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153934153
84	NC_009697	ATGAAT	2	12	164432	164443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153931602
85	NC_009697	TTTATT	2	12	164704	164715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009697	GTGGTA	2	12	168662	168673	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	153933674
87	NC_009697	ATATAA	2	12	169868	169879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153932228
88	NC_009697	AGGTAT	2	12	173522	173533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153931351
89	NC_009697	AGTTAT	2	12	175769	175780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153932257
90	NC_009697	TACAAC	2	12	176862	176873	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	153933182
91	NC_009697	ATATTT	2	12	177873	177884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009697	AAAAAT	2	12	178404	178415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153932017
93	NC_009697	ATGGTA	2	12	182412	182423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153933849
94	NC_009697	AACATA	2	12	182480	182491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153933849
95	NC_009697	AATTAA	2	12	184862	184873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931834
96	NC_009697	TAATTT	2	12	185578	185589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153932741
97	NC_009697	AATAAA	2	12	186556	186567	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009697	ATAAAA	2	12	186629	186640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009697	TTTAAT	2	12	188647	188658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009697	TAAAGT	2	12	189522	189533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153931581
101	NC_009697	AATGGT	2	12	193721	193732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153932206
102	NC_009697	TTAAAA	2	12	195082	195093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153932456
103	NC_009697	TAAATA	2	12	195842	195853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153932456
104	NC_009697	AAAGAT	2	12	196459	196470	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153932456
105	NC_009697	TGTAAT	2	12	201219	201230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153931697
106	NC_009697	AAAGAA	2	12	202150	202161	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153931697
107	NC_009697	GTAGAA	2	12	202387	202398	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153931697
108	NC_009697	GAAATA	2	12	203494	203505	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153932889
109	NC_009697	AAAAAT	2	12	203962	203973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009697	AATTAA	2	12	204336	204347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153934088
111	NC_009697	GAAAAA	2	12	206172	206183	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153931281
112	NC_009697	CTATAT	2	12	206797	206808	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153931281
113	NC_009697	AATATT	2	12	207665	207676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009697	ATTAAT	2	12	207717	207728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009697	ATTAAT	2	12	208834	208845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009697	GGGTAA	2	12	210287	210298	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	153932190
117	NC_009697	ATATAG	2	12	210777	210788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153933699
118	NC_009697	TAAGAT	2	12	211309	211320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153931177
119	NC_009697	CAGATA	2	12	212385	212396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153933505
120	NC_009697	GATAAA	2	12	213365	213376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153933505
121	NC_009697	TAAAAG	2	12	213783	213794	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153933505
122	NC_009697	CTATAT	2	12	214936	214947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153931164
123	NC_009697	ATTATA	2	12	215346	215357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_009697	AAAAAG	2	12	416068	416079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153931032
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362	NC_009697	TTAAAA	2	12	581775	581786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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