MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 plasmid pBOT3502

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009496	ATGAAG	2	12	3550	3561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148381587
2	NC_009496	ATGTAA	2	12	4729	4740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009496	TTATAT	2	12	6168	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009496	ATTAAA	2	12	6180	6191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009496	ATGAAG	2	12	6659	6670	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148381593
6	NC_009496	AAGTAT	2	12	6803	6814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148381593
7	NC_009496	AGAATA	2	12	7449	7460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009496	AACAGA	2	12	9335	9346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148381598
9	NC_009496	GATAAT	2	12	12235	12246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148381602
10	NC_009496	CATTAA	2	12	12590	12601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148381602
11	NC_009496	AAATGG	2	12	12846	12857	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148381602
12	NC_009496	TTAATA	2	12	13968	13979	50 %	50 %	0 %	0 %	148381603
13	NC_009496	AAGATA	2	12	14284	14295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148381603
14	NC_009496	ATTAAA	2	12	14431	14442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381604
15	NC_009496	ATTTAG	2	12	15603	15614	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148381604
16	NC_009496	AAATTT	2	12	16255	16266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.