MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 12954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009480	CT	3	6	506	511	0 %	50 %	0 %	50 %	148271179
2	NC_009480	CT	3	6	1511	1516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009480	GA	3	6	1598	1603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009480	GA	3	6	3142	3147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009480	GC	5	10	3194	3203	0 %	0 %	50 %	50 %	148271181
6	NC_009480	CG	3	6	3362	3367	0 %	0 %	50 %	50 %	148271181
7	NC_009480	CG	3	6	3938	3943	0 %	0 %	50 %	50 %	148271181
8	NC_009480	CG	3	6	4090	4095	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
9	NC_009480	CG	3	6	4255	4260	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
10	NC_009480	CG	3	6	4324	4329	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
11	NC_009480	CG	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
12	NC_009480	GC	3	6	4633	4638	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
13	NC_009480	CG	5	10	4671	4680	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
14	NC_009480	CG	3	6	4716	4721	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
15	NC_009480	GC	3	6	4783	4788	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
16	NC_009480	CG	3	6	4845	4850	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
17	NC_009480	CG	3	6	5265	5270	0 %	0 %	50 %	50 %	148271183
18	NC_009480	CG	3	6	5749	5754	0 %	0 %	50 %	50 %	148271183
19	NC_009480	AG	3	6	5819	5824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009480	CA	3	6	5972	5977	50 %	0 %	0 %	50 %	148271184
21	NC_009480	CG	3	6	6154	6159	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
22	NC_009480	CG	4	8	6615	6622	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
23	NC_009480	CG	3	6	6936	6941	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
24	NC_009480	CG	4	8	6968	6975	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
25	NC_009480	GC	3	6	7242	7247	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
26	NC_009480	CG	3	6	7458	7463	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
27	NC_009480	GC	4	8	8349	8356	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
28	NC_009480	GC	3	6	8834	8839	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
29	NC_009480	GC	3	6	8927	8932	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
30	NC_009480	GC	3	6	8994	8999	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
31	NC_009480	GT	3	6	9029	9034	0 %	50 %	50 %	0 %	148271185
32	NC_009480	CG	3	6	9391	9396	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
33	NC_009480	CG	3	6	9480	9485	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
34	NC_009480	CG	3	6	9797	9802	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
35	NC_009480	CG	3	6	10506	10511	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
36	NC_009480	GC	3	6	10526	10531	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
37	NC_009480	CG	3	6	11695	11700	0 %	0 %	50 %	50 %	148271187
38	NC_009480	GC	3	6	12115	12120	0 %	0 %	50 %	50 %	148271187
39	NC_009480	CG	3	6	13680	13685	0 %	0 %	50 %	50 %	148271189
40	NC_009480	GC	3	6	13784	13789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009480	TG	3	6	14043	14048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009480	GT	3	6	16200	16205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009480	CG	4	8	16223	16230	0 %	0 %	50 %	50 %	148271193
44	NC_009480	AG	3	6	17069	17074	50 %	0 %	50 %	0 %	148271193
45	NC_009480	CG	3	6	17170	17175	0 %	0 %	50 %	50 %	148271193
46	NC_009480	GC	3	6	17367	17372	0 %	0 %	50 %	50 %	148271193
47	NC_009480	CG	3	6	17473	17478	0 %	0 %	50 %	50 %	148271193
48	NC_009480	GC	3	6	17772	17777	0 %	0 %	50 %	50 %	148271193
49	NC_009480	GC	3	6	18960	18965	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
50	NC_009480	GC	3	6	18972	18977	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
51	NC_009480	GC	3	6	19035	19040	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
52	NC_009480	CG	4	8	19216	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
53	NC_009480	GC	3	6	20441	20446	0 %	0 %	50 %	50 %	148271195
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55	NC_009480	CG	3	6	20896	20901	0 %	0 %	50 %	50 %	148271195
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58	NC_009480	GC	3	6	22969	22974	0 %	0 %	50 %	50 %	148271197
59	NC_009480	CG	4	8	23226	23233	0 %	0 %	50 %	50 %	148271197
60	NC_009480	GC	3	6	23243	23248	0 %	0 %	50 %	50 %	148271197
61	NC_009480	GC	3	6	23282	23287	0 %	0 %	50 %	50 %	148271197
62	NC_009480	GC	3	6	23802	23807	0 %	0 %	50 %	50 %	148271197
63	NC_009480	GC	3	6	24260	24265	0 %	0 %	50 %	50 %	148271198
64	NC_009480	CG	3	6	24416	24421	0 %	0 %	50 %	50 %	148271198
65	NC_009480	GC	3	6	24843	24848	0 %	0 %	50 %	50 %	148271199
66	NC_009480	GC	3	6	25382	25387	0 %	0 %	50 %	50 %	148271199
67	NC_009480	CG	3	6	25437	25442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009480	GT	3	6	25663	25668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009480	GC	3	6	25851	25856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009480	CG	3	6	26444	26449	0 %	0 %	50 %	50 %	148271200
71	NC_009480	CG	3	6	26929	26934	0 %	0 %	50 %	50 %	148271200
72	NC_009480	CG	3	6	27100	27105	0 %	0 %	50 %	50 %	148271200
73	NC_009480	CG	3	6	27616	27621	0 %	0 %	50 %	50 %	148271200
74	NC_009480	CG	4	8	27687	27694	0 %	0 %	50 %	50 %	148271200
75	NC_009480	GC	3	6	27793	27798	0 %	0 %	50 %	50 %	148271200
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77	NC_009480	GC	3	6	27989	27994	0 %	0 %	50 %	50 %	148271200
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79	NC_009480	GC	3	6	28620	28625	0 %	0 %	50 %	50 %	148271201
80	NC_009480	CG	4	8	28670	28677	0 %	0 %	50 %	50 %	148271201
81	NC_009480	CG	3	6	28774	28779	0 %	0 %	50 %	50 %	148271201
82	NC_009480	CG	3	6	29117	29122	0 %	0 %	50 %	50 %	148271202
83	NC_009480	CG	3	6	29124	29129	0 %	0 %	50 %	50 %	148271202
84	NC_009480	GC	3	6	29370	29375	0 %	0 %	50 %	50 %	148271202
85	NC_009480	CG	3	6	29484	29489	0 %	0 %	50 %	50 %	148271202
86	NC_009480	GC	3	6	29550	29555	0 %	0 %	50 %	50 %	148271202
87	NC_009480	CG	3	6	29635	29640	0 %	0 %	50 %	50 %	148271202
88	NC_009480	GC	3	6	29685	29690	0 %	0 %	50 %	50 %	148271202
89	NC_009480	CG	3	6	29724	29729	0 %	0 %	50 %	50 %	148271202
90	NC_009480	CG	3	6	29987	29992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009480	GC	3	6	30069	30074	0 %	0 %	50 %	50 %	148271203
92	NC_009480	CG	3	6	30335	30340	0 %	0 %	50 %	50 %	148271204
93	NC_009480	CG	3	6	30414	30419	0 %	0 %	50 %	50 %	148271204
94	NC_009480	GC	3	6	30639	30644	0 %	0 %	50 %	50 %	148271204
95	NC_009480	CG	3	6	30658	30663	0 %	0 %	50 %	50 %	148271204
96	NC_009480	CG	3	6	30942	30947	0 %	0 %	50 %	50 %	148271204
97	NC_009480	GC	4	8	31320	31327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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100	NC_009480	CG	3	6	31905	31910	0 %	0 %	50 %	50 %	148271205
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104	NC_009480	GC	3	6	32558	32563	0 %	0 %	50 %	50 %	148271205
105	NC_009480	GC	3	6	32653	32658	0 %	0 %	50 %	50 %	148271205
106	NC_009480	GC	3	6	32669	32674	0 %	0 %	50 %	50 %	148271205
107	NC_009480	CG	3	6	32763	32768	0 %	0 %	50 %	50 %	148271205
108	NC_009480	CG	3	6	33369	33374	0 %	0 %	50 %	50 %	148271206
109	NC_009480	GC	4	8	33375	33382	0 %	0 %	50 %	50 %	148271206
110	NC_009480	CG	3	6	33401	33406	0 %	0 %	50 %	50 %	148271206
111	NC_009480	GC	3	6	33879	33884	0 %	0 %	50 %	50 %	148271207
112	NC_009480	CG	3	6	34108	34113	0 %	0 %	50 %	50 %	148271207
113	NC_009480	CG	3	6	34646	34651	0 %	0 %	50 %	50 %	148271207
114	NC_009480	GC	4	8	34829	34836	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
115	NC_009480	CG	4	8	35091	35098	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
116	NC_009480	CG	3	6	35139	35144	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
117	NC_009480	GC	3	6	35157	35162	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
118	NC_009480	GC	3	6	35310	35315	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
119	NC_009480	CG	3	6	35619	35624	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
120	NC_009480	CG	3	6	35786	35791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009480	CG	3	6	35939	35944	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
122	NC_009480	GC	4	8	36126	36133	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
123	NC_009480	CG	3	6	36170	36175	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
124	NC_009480	CG	3	6	36196	36201	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
125	NC_009480	CG	3	6	36219	36224	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
126	NC_009480	CG	3	6	36250	36255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009480	GC	3	6	36379	36384	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
128	NC_009480	CG	3	6	36808	36813	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
129	NC_009480	GC	3	6	36846	36851	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
130	NC_009480	CG	5	10	37517	37526	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
131	NC_009480	TC	3	6	37969	37974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009480	GT	3	6	38073	38078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009480	GC	3	6	40176	40181	0 %	0 %	50 %	50 %	148271212
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136	NC_009480	CG	3	6	40996	41001	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
137	NC_009480	GC	3	6	41227	41232	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
138	NC_009480	GC	3	6	41270	41275	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
139	NC_009480	CG	4	8	41372	41379	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
140	NC_009480	CG	3	6	41508	41513	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
141	NC_009480	CG	3	6	41783	41788	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
142	NC_009480	GC	3	6	41813	41818	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
143	NC_009480	CT	3	6	42601	42606	0 %	50 %	0 %	50 %	148271214
144	NC_009480	GC	4	8	42698	42705	0 %	0 %	50 %	50 %	148271214
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