MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 104857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009480	CGC	2	6	92161	92166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_009480	CTC	2	6	92171	92176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271241
2503	NC_009480	CGG	2	6	92182	92187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271241
2504	NC_009480	GCCG	2	8	92233	92240	0 %	0 %	50 %	50 %	148271241
2505	NC_009480	GGA	2	6	92318	92323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271241
2506	NC_009480	GCTC	2	8	92346	92353	0 %	25 %	25 %	50 %	148271241
2507	NC_009480	ACG	2	6	92445	92450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271241
2508	NC_009480	GCA	2	6	92544	92549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271241
2509	NC_009480	CCA	2	6	92571	92576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271241
2510	NC_009480	GGC	2	6	92578	92583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271241
2511	NC_009480	ACC	2	6	92595	92600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271241
2512	NC_009480	GCC	3	9	92633	92641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271241
2513	NC_009480	CCG	2	6	92653	92658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271241
2514	NC_009480	AGC	2	6	92661	92666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271241
2515	NC_009480	CGAC	2	8	92670	92677	25 %	0 %	25 %	50 %	148271241
2516	NC_009480	CAA	2	6	92680	92685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271241
2517	NC_009480	CGA	2	6	92706	92711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271241
2518	NC_009480	GCC	2	6	92756	92761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271241
2519	NC_009480	CGAC	2	8	92820	92827	25 %	0 %	25 %	50 %	148271241
2520	NC_009480	CCGCG	2	10	92836	92845	0 %	0 %	40 %	60 %	148271241
2521	NC_009480	CAT	2	6	92934	92939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2525	NC_009480	ACG	2	6	93210	93215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271242
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2527	NC_009480	ACCAA	2	10	93278	93287	60 %	0 %	0 %	40 %	148271242
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2530	NC_009480	AT	3	6	93327	93332	50 %	50 %	0 %	0 %	148271242
2531	NC_009480	ACGC	2	8	93452	93459	25 %	0 %	25 %	50 %	148271242
2532	NC_009480	GCC	2	6	93479	93484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271242
2533	NC_009480	CCG	2	6	93513	93518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271242
2534	NC_009480	C	6	6	93540	93545	0 %	0 %	0 %	100 %	148271242
2535	NC_009480	GCCA	2	8	93589	93596	25 %	0 %	25 %	50 %	148271242
2536	NC_009480	A	6	6	93652	93657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_009480	AAG	2	6	93683	93688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_009480	TTGC	2	8	93773	93780	0 %	50 %	25 %	25 %	148271243
2539	NC_009480	AGG	2	6	93841	93846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271243
2540	NC_009480	TAT	2	6	93849	93854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148271243
2541	NC_009480	GAA	3	9	93897	93905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271243
2542	NC_009480	AAGA	2	8	93952	93959	75 %	0 %	25 %	0 %	148271243
2543	NC_009480	GTT	2	6	93976	93981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148271243
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2548	NC_009480	CGT	2	6	94320	94325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271243
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2554	NC_009480	AG	3	6	94471	94476	50 %	0 %	50 %	0 %	148271243
2555	NC_009480	CACT	2	8	94488	94495	25 %	25 %	0 %	50 %	148271243
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2559	NC_009480	CGA	2	6	94720	94725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271244
2560	NC_009480	TCG	2	6	94777	94782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271244
2561	NC_009480	CTC	2	6	94799	94804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271244
2562	NC_009480	CGCT	2	8	94805	94812	0 %	25 %	25 %	50 %	148271244
2563	NC_009480	CGCC	2	8	94843	94850	0 %	0 %	25 %	75 %	148271244
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2583	NC_009480	CCA	2	6	95577	95582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_009480	TGCGC	2	10	95590	95599	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2587	NC_009480	GCTA	2	8	95661	95668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2588	NC_009480	AGCA	2	8	95675	95682	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_009480	GC	3	6	95693	95698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2596	NC_009480	GCCC	2	8	95995	96002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2597	NC_009480	GAA	2	6	96013	96018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_009480	TGTC	2	8	96049	96056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2599	NC_009480	AG	3	6	96073	96078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2602	NC_009480	TCG	2	6	96151	96156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271245
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2611	NC_009480	GC	3	6	96424	96429	0 %	0 %	50 %	50 %	148271245
2612	NC_009480	ACGG	2	8	96465	96472	25 %	0 %	50 %	25 %	148271245
2613	NC_009480	ACC	2	6	96474	96479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271245
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2621	NC_009480	CGAAG	2	10	96743	96752	40 %	0 %	40 %	20 %	148271245
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2758	NC_009480	CGT	2	6	102312	102317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271248
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2776	NC_009480	CCGG	2	8	102812	102819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2787	NC_009480	GGC	2	6	103143	103148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2874	NC_009480	CT	3	6	106874	106879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2875	NC_009480	TGG	2	6	106927	106932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2876	NC_009480	TGCCA	3	15	106935	106949	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2877	NC_009480	GCGT	2	8	107044	107051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2878	NC_009480	GGT	2	6	107091	107096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2879	NC_009480	GCG	3	9	107199	107207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2880	NC_009480	C	6	6	107240	107245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2881	NC_009480	GAA	2	6	107259	107264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2883	NC_009480	GCA	2	6	107321	107326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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