MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 104857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009480	CGG	2	6	17348	17353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271193
502	NC_009480	GC	3	6	17367	17372	0 %	0 %	50 %	50 %	148271193
503	NC_009480	GCGG	2	8	17412	17419	0 %	0 %	75 %	25 %	148271193
504	NC_009480	GGT	2	6	17433	17438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271193
505	NC_009480	TGG	2	6	17447	17452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271193
506	NC_009480	CG	3	6	17473	17478	0 %	0 %	50 %	50 %	148271193
507	NC_009480	ATG	2	6	17521	17526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271193
508	NC_009480	GAC	2	6	17550	17555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271193
509	NC_009480	ATG	2	6	17599	17604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271193
510	NC_009480	TGA	2	6	17639	17644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271193
511	NC_009480	GGC	2	6	17657	17662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271193
512	NC_009480	GAC	2	6	17721	17726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271193
513	NC_009480	TGG	2	6	17756	17761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271193
514	NC_009480	GC	3	6	17772	17777	0 %	0 %	50 %	50 %	148271193
515	NC_009480	GCC	2	6	17779	17784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271193
516	NC_009480	CCT	2	6	17789	17794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271193
517	NC_009480	CAG	2	6	17916	17921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271193
518	NC_009480	GCC	2	6	17940	17945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271193
519	NC_009480	TCG	2	6	17977	17982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009480	GGGC	2	8	18058	18065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
521	NC_009480	CGC	3	9	18070	18078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_009480	GAGC	2	8	18128	18135	25 %	0 %	50 %	25 %	148271194
523	NC_009480	GGT	2	6	18176	18181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271194
524	NC_009480	GCC	3	9	18182	18190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271194
525	NC_009480	GCC	3	9	18203	18211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271194
526	NC_009480	CGC	2	6	18217	18222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271194
527	NC_009480	GTGCCG	2	12	18225	18236	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148271194
528	NC_009480	GTGCCG	2	12	18240	18251	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148271194
529	NC_009480	GGC	2	6	18257	18262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
530	NC_009480	TGC	2	6	18283	18288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271194
531	NC_009480	TCG	2	6	18388	18393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271194
532	NC_009480	TGC	2	6	18400	18405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271194
533	NC_009480	CGG	2	6	18475	18480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
534	NC_009480	CGTC	2	8	18529	18536	0 %	25 %	25 %	50 %	148271194
535	NC_009480	GTG	2	6	18564	18569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271194
536	NC_009480	GGC	2	6	18579	18584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
537	NC_009480	TGG	2	6	18604	18609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271194
538	NC_009480	CTC	3	9	18656	18664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271194
539	NC_009480	CGGCG	2	10	18671	18680	0 %	0 %	60 %	40 %	148271194
540	NC_009480	GAC	2	6	18689	18694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271194
541	NC_009480	CCG	2	6	18724	18729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271194
542	NC_009480	TCT	2	6	18736	18741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271194
543	NC_009480	GTC	2	6	18758	18763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271194
544	NC_009480	GCTCGG	2	12	18824	18835	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148271194
545	NC_009480	GCG	2	6	18870	18875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
546	NC_009480	CTGG	2	8	18881	18888	0 %	25 %	50 %	25 %	148271194
547	NC_009480	GAG	2	6	18899	18904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271194
548	NC_009480	CGA	2	6	18910	18915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271194
549	NC_009480	CCA	2	6	18922	18927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271194
550	NC_009480	CGA	4	12	18937	18948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271194
551	NC_009480	GC	3	6	18960	18965	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
552	NC_009480	GC	3	6	18972	18977	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
553	NC_009480	CTC	2	6	18980	18985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271194
554	NC_009480	CTC	2	6	18989	18994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271194
555	NC_009480	GTC	2	6	18995	19000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271194
556	NC_009480	CGT	2	6	19003	19008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271194
557	NC_009480	GAG	2	6	19010	19015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271194
558	NC_009480	GC	3	6	19035	19040	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
559	NC_009480	CGG	2	6	19078	19083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
560	NC_009480	GCG	2	6	19143	19148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
561	NC_009480	TGG	2	6	19174	19179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271194
562	NC_009480	CGC	2	6	19192	19197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271194
563	NC_009480	GCGCG	2	10	19210	19219	0 %	0 %	60 %	40 %	148271194
564	NC_009480	CG	4	8	19216	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
565	NC_009480	GCG	2	6	19230	19235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
566	NC_009480	CGGT	2	8	19241	19248	0 %	25 %	50 %	25 %	148271194
567	NC_009480	CGGC	2	8	19249	19256	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
568	NC_009480	TTC	2	6	19257	19262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271194
569	NC_009480	GGC	2	6	19320	19325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
570	NC_009480	ATGGCG	2	12	19344	19355	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148271194
571	NC_009480	GCG	2	6	19379	19384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
572	NC_009480	CGA	2	6	19405	19410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271194
573	NC_009480	GTCG	2	8	19427	19434	0 %	25 %	50 %	25 %	148271194
574	NC_009480	TGA	2	6	19576	19581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271194
575	NC_009480	GCG	2	6	19629	19634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
576	NC_009480	GAT	2	6	19658	19663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271194
577	NC_009480	TGG	2	6	19708	19713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271194
578	NC_009480	TCC	2	6	19761	19766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271194
579	NC_009480	GCG	2	6	19812	19817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271194
580	NC_009480	CCG	2	6	19941	19946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271194
581	NC_009480	GCGAT	2	10	19950	19959	20 %	20 %	40 %	20 %	148271194
582	NC_009480	TTC	2	6	20033	20038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271195
583	NC_009480	GCG	2	6	20048	20053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271195
584	NC_009480	TCGTCC	2	12	20074	20085	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148271195
585	NC_009480	GCC	2	6	20086	20091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271195
586	NC_009480	GACCGC	2	12	20104	20115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148271195
587	NC_009480	CCG	3	9	20127	20135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271195
588	NC_009480	GTC	2	6	20167	20172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271195
589	NC_009480	CGACG	2	10	20233	20242	20 %	0 %	40 %	40 %	148271195
590	NC_009480	CGT	2	6	20253	20258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271195
591	NC_009480	ATC	3	9	20261	20269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271195
592	NC_009480	CGG	2	6	20283	20288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271195
593	NC_009480	GCTC	2	8	20337	20344	0 %	25 %	25 %	50 %	148271195
594	NC_009480	CGA	2	6	20367	20372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271195
595	NC_009480	CGC	2	6	20391	20396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271195
596	NC_009480	CGG	2	6	20409	20414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271195
597	NC_009480	GC	3	6	20441	20446	0 %	0 %	50 %	50 %	148271195
598	NC_009480	CGT	2	6	20484	20489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271195
599	NC_009480	TCGA	2	8	20534	20541	25 %	25 %	25 %	25 %	148271195
600	NC_009480	TGA	2	6	20694	20699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271195
601	NC_009480	GTGCCG	2	12	20702	20713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148271195
602	NC_009480	CGG	2	6	20728	20733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271195
603	NC_009480	GCA	2	6	20739	20744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271195
604	NC_009480	GGC	3	9	20776	20784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271195
605	NC_009480	TGA	2	6	20790	20795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271195
606	NC_009480	CGGG	2	8	20811	20818	0 %	0 %	75 %	25 %	148271195
607	NC_009480	CG	3	6	20833	20838	0 %	0 %	50 %	50 %	148271195
608	NC_009480	TGA	2	6	20841	20846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271195
609	NC_009480	GAG	2	6	20866	20871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271195
610	NC_009480	CGA	2	6	20872	20877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271195
611	NC_009480	CTG	2	6	20884	20889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271195
612	NC_009480	CG	3	6	20896	20901	0 %	0 %	50 %	50 %	148271195
613	NC_009480	CGT	2	6	21012	21017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271195
614	NC_009480	CGC	2	6	21019	21024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271195
615	NC_009480	CTG	2	6	21025	21030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271195
616	NC_009480	CGAC	2	8	21054	21061	25 %	0 %	25 %	50 %	148271195
617	NC_009480	GAA	2	6	21106	21111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271195
618	NC_009480	CGT	2	6	21138	21143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271195
619	NC_009480	GTA	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271195
620	NC_009480	GGA	2	6	21231	21236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271195
621	NC_009480	GTC	2	6	21247	21252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271195
622	NC_009480	GAG	2	6	21263	21268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271195
623	NC_009480	CGA	2	6	21285	21290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271195
624	NC_009480	GAT	2	6	21322	21327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271195
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626	NC_009480	ACC	2	6	21463	21468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271196
627	NC_009480	GGA	2	6	21503	21508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271196
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