MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 104857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009480	AGC	2	6	217696	217701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271336
6002	NC_009480	CGG	2	6	217702	217707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271336
6003	NC_009480	GAC	2	6	217767	217772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271336
6004	NC_009480	CGA	2	6	217781	217786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271336
6005	NC_009480	GCC	2	6	217788	217793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271336
6006	NC_009480	GCGGT	2	10	217819	217828	0 %	20 %	60 %	20 %	148271336
6007	NC_009480	CGG	2	6	217847	217852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271336
6008	NC_009480	TCGG	2	8	217867	217874	0 %	25 %	50 %	25 %	148271336
6009	NC_009480	CAC	2	6	217905	217910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271336
6010	NC_009480	ACG	2	6	217939	217944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271336
6011	NC_009480	CAG	2	6	217962	217967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271336
6012	NC_009480	CGC	2	6	218003	218008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271336
6013	NC_009480	CG	4	8	218015	218022	0 %	0 %	50 %	50 %	148271336
6014	NC_009480	GTGC	2	8	218047	218054	0 %	25 %	50 %	25 %	148271336
6015	NC_009480	ATC	2	6	218072	218077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_009480	TGG	2	6	218097	218102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_009480	GTGC	2	8	218147	218154	0 %	25 %	50 %	25 %	148271337
6018	NC_009480	CAG	2	6	218165	218170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6019	NC_009480	CG	3	6	218199	218204	0 %	0 %	50 %	50 %	148271337
6020	NC_009480	GCG	3	9	218202	218210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271337
6021	NC_009480	GTC	2	6	218231	218236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6022	NC_009480	CGT	2	6	218263	218268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6023	NC_009480	TCG	2	6	218322	218327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6024	NC_009480	AGC	3	9	218328	218336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6025	NC_009480	GC	3	6	218351	218356	0 %	0 %	50 %	50 %	148271337
6026	NC_009480	CGT	2	6	218392	218397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6027	NC_009480	GCA	3	9	218437	218445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6028	NC_009480	GTT	2	6	218468	218473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148271337
6029	NC_009480	GAG	2	6	218489	218494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271337
6030	NC_009480	GTC	3	9	218504	218512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6031	NC_009480	GTC	2	6	218547	218552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271337
6032	NC_009480	C	6	6	218562	218567	0 %	0 %	0 %	100 %	148271337
6033	NC_009480	CG	3	6	218588	218593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_009480	GC	4	8	218620	218627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_009480	CCGG	3	12	218669	218680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_009480	GC	4	8	218716	218723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_009480	CTG	3	9	218731	218739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_009480	TGA	2	6	218773	218778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_009480	CGG	2	6	218790	218795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_009480	G	6	6	218794	218799	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_009480	CGG	2	6	218803	218808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_009480	CTC	2	6	218812	218817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_009480	CGG	2	6	218833	218838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_009480	G	6	6	218843	218848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_009480	CT	3	6	218886	218891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_009480	GGA	2	6	218894	218899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_009480	CCG	2	6	218960	218965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_009480	GCG	2	6	218981	218986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271338
6049	NC_009480	GTC	2	6	219026	219031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271338
6050	NC_009480	GCGGT	2	10	219059	219068	0 %	20 %	60 %	20 %	148271338
6051	NC_009480	GAC	2	6	219073	219078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271338
6052	NC_009480	CGA	2	6	219087	219092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271338
6053	NC_009480	TCG	2	6	219110	219115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271338
6054	NC_009480	TCG	2	6	219140	219145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271338
6055	NC_009480	GAG	2	6	219163	219168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271338
6056	NC_009480	GCGAG	2	10	219174	219183	20 %	0 %	60 %	20 %	148271338
6057	NC_009480	GC	3	6	219202	219207	0 %	0 %	50 %	50 %	148271338
6058	NC_009480	GTG	2	6	219220	219225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271338
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6060	NC_009480	CCG	2	6	219276	219281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271338
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6062	NC_009480	CGT	2	6	219330	219335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271338
6063	NC_009480	CGAAGC	2	12	219339	219350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271338
6064	NC_009480	GAG	2	6	219400	219405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271338
6065	NC_009480	TCG	2	6	219434	219439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271338
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6070	NC_009480	GAC	2	6	219529	219534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271338
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6079	NC_009480	CGA	3	9	219751	219759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_009480	CGG	2	6	219802	219807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_009480	CG	3	6	219813	219818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_009480	CG	3	6	219843	219848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6095	NC_009480	CG	3	6	220281	220286	0 %	0 %	50 %	50 %	148271339
6096	NC_009480	GCGG	2	8	220290	220297	0 %	0 %	75 %	25 %	148271339
6097	NC_009480	GGCG	2	8	220314	220321	0 %	0 %	75 %	25 %	148271339
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6121	NC_009480	GCG	2	6	220955	220960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_009480	GGC	2	6	220961	220966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6124	NC_009480	GCG	2	6	221031	221036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_009480	TCG	2	6	221042	221047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_009480	GGC	2	6	221048	221053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6130	NC_009480	CG	3	6	221107	221112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_009480	GGA	2	6	221124	221129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_009480	GCC	2	6	221139	221144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6251	NC_009480	GGCG	2	8	224550	224557	0 %	0 %	75 %	25 %	148271343
6252	NC_009480	CTCC	2	8	224577	224584	0 %	25 %	0 %	75 %	148271343
6253	NC_009480	CGCC	2	8	224592	224599	0 %	0 %	25 %	75 %	148271343
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6256	NC_009480	CGG	2	6	224634	224639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271343
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6360	NC_009480	CTCGCG	2	12	227566	227577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148271345
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6367	NC_009480	GGC	2	6	227770	227775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271345
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6369	NC_009480	ATC	2	6	227845	227850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271345
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6372	NC_009480	CGA	3	9	228009	228017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271345
6373	NC_009480	CCT	2	6	228027	228032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271345
6374	NC_009480	CTCG	2	8	228039	228046	0 %	25 %	25 %	50 %	148271345
6375	NC_009480	CGG	2	6	228095	228100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271345
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6380	NC_009480	TCG	2	6	228161	228166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
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6401	NC_009480	TCGAC	2	10	228991	229000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6402	NC_009480	GCA	2	6	229001	229006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6403	NC_009480	GCC	2	6	229027	229032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6404	NC_009480	GAT	2	6	229162	229167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6405	NC_009480	TCC	2	6	229175	229180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6406	NC_009480	GGC	3	9	229194	229202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6407	NC_009480	CGT	2	6	229227	229232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6409	NC_009480	CCA	2	6	229253	229258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6410	NC_009480	CT	3	6	229379	229384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6411	NC_009480	GCT	2	6	229423	229428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6418	NC_009480	TAC	2	6	229660	229665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6420	NC_009480	TCGGC	2	10	229803	229812	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6421	NC_009480	ACT	2	6	229831	229836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6428	NC_009480	GCT	3	9	230140	230148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
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6431	NC_009480	GCCCC	2	10	230308	230317	0 %	0 %	20 %	80 %	148271347
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6436	NC_009480	CTG	2	6	230468	230473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
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6470	NC_009480	GAC	2	6	231514	231519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271348
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6480	NC_009480	CGA	2	6	231663	231668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271348
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6491	NC_009480	CGA	2	6	231885	231890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271348
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6493	NC_009480	GGT	2	6	231936	231941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271348
6494	NC_009480	CGA	2	6	231958	231963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271348
6495	NC_009480	GC	3	6	231977	231982	0 %	0 %	50 %	50 %	148271348
6496	NC_009480	CG	3	6	231989	231994	0 %	0 %	50 %	50 %	148271348
6497	NC_009480	CG	3	6	232044	232049	0 %	0 %	50 %	50 %	148271348
6498	NC_009480	TCT	2	6	232097	232102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271348
6499	NC_009480	ACC	2	6	232133	232138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271348
6500	NC_009480	CGT	2	6	232191	232196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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