MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 104857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009480	TCC	3	9	201454	201462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271321
5502	NC_009480	GCG	2	6	201478	201483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271321
5503	NC_009480	CCG	2	6	201490	201495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271321
5504	NC_009480	AAC	2	6	201510	201515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271321
5505	NC_009480	CGT	2	6	201523	201528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271321
5506	NC_009480	CTT	2	6	201536	201541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271321
5507	NC_009480	CCG	2	6	201622	201627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271321
5508	NC_009480	CGC	2	6	201632	201637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271321
5509	NC_009480	CGG	2	6	201665	201670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271321
5510	NC_009480	ACG	2	6	201684	201689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271321
5511	NC_009480	AGC	2	6	201690	201695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271321
5512	NC_009480	CG	3	6	201706	201711	0 %	0 %	50 %	50 %	148271321
5513	NC_009480	GGC	2	6	201717	201722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271321
5514	NC_009480	ACC	2	6	201810	201815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271321
5515	NC_009480	GGC	2	6	201822	201827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271321
5516	NC_009480	TCG	2	6	201864	201869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271321
5517	NC_009480	ACG	2	6	201897	201902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271321
5518	NC_009480	CGG	2	6	201929	201934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271321
5519	NC_009480	ACA	2	6	202108	202113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271321
5520	NC_009480	TCG	2	6	202147	202152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271321
5521	NC_009480	GCA	2	6	202153	202158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271321
5522	NC_009480	GCCG	2	8	202221	202228	0 %	0 %	50 %	50 %	148271321
5523	NC_009480	CGA	2	6	202235	202240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_009480	CCGTC	2	10	202257	202266	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5525	NC_009480	CAC	2	6	202297	202302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271322
5526	NC_009480	GCC	2	6	202324	202329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271322
5527	NC_009480	CGG	2	6	202347	202352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271322
5528	NC_009480	GTC	2	6	202363	202368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5529	NC_009480	GA	3	6	202389	202394	50 %	0 %	50 %	0 %	148271322
5530	NC_009480	GTC	3	9	202408	202416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5531	NC_009480	CTG	2	6	202435	202440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5532	NC_009480	GC	3	6	202452	202457	0 %	0 %	50 %	50 %	148271322
5533	NC_009480	GAA	2	6	202465	202470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271322
5534	NC_009480	GCC	2	6	202481	202486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271322
5535	NC_009480	TGC	2	6	202511	202516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5536	NC_009480	CGT	2	6	202554	202559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5537	NC_009480	CCT	3	9	202608	202616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271322
5538	NC_009480	GCT	2	6	202617	202622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5539	NC_009480	TCGTGT	2	12	202671	202682	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148271322
5540	NC_009480	GC	3	6	202729	202734	0 %	0 %	50 %	50 %	148271322
5541	NC_009480	TCG	3	9	202790	202798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5542	NC_009480	CGG	2	6	202842	202847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271322
5543	NC_009480	GC	3	6	202869	202874	0 %	0 %	50 %	50 %	148271322
5544	NC_009480	TCG	2	6	202904	202909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5545	NC_009480	CGC	2	6	202914	202919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271322
5546	NC_009480	GGCC	2	8	202923	202930	0 %	0 %	50 %	50 %	148271322
5547	NC_009480	GCC	2	6	202970	202975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271322
5548	NC_009480	CGG	2	6	202980	202985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271322
5549	NC_009480	GC	3	6	202989	202994	0 %	0 %	50 %	50 %	148271322
5550	NC_009480	CGG	2	6	202995	203000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271322
5551	NC_009480	CGC	2	6	203017	203022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271322
5552	NC_009480	GAT	2	6	203038	203043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271322
5553	NC_009480	GTC	2	6	203056	203061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5554	NC_009480	GTG	2	6	203087	203092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271322
5555	NC_009480	CCG	2	6	203093	203098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271322
5556	NC_009480	CGCC	2	8	203100	203107	0 %	0 %	25 %	75 %	148271322
5557	NC_009480	GGT	2	6	203119	203124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271322
5558	NC_009480	CGG	2	6	203130	203135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271322
5559	NC_009480	GTG	2	6	203150	203155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271322
5560	NC_009480	GGC	2	6	203161	203166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271322
5561	NC_009480	GGAGC	2	10	203180	203189	20 %	0 %	60 %	20 %	148271322
5562	NC_009480	GAC	2	6	203200	203205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271322
5563	NC_009480	GCG	2	6	203219	203224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271322
5564	NC_009480	GCG	2	6	203316	203321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_009480	C	7	7	203387	203393	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5566	NC_009480	CCT	2	6	203452	203457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_009480	CCGC	2	8	203501	203508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5568	NC_009480	CGT	2	6	203514	203519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_009480	CG	3	6	203522	203527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_009480	CCG	2	6	203528	203533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_009480	CCG	2	6	203542	203547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_009480	CGG	2	6	203553	203558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_009480	ACG	2	6	203563	203568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_009480	CGT	2	6	203579	203584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_009480	GGGCC	2	10	203585	203594	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5576	NC_009480	GTG	3	9	203599	203607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_009480	GGGT	2	8	203628	203635	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_009480	CGA	3	9	203669	203677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271323
5579	NC_009480	AGG	2	6	203716	203721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271323
5580	NC_009480	GGC	2	6	203724	203729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271323
5581	NC_009480	GTG	2	6	203749	203754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271323
5582	NC_009480	TCGCCG	2	12	203842	203853	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148271323
5583	NC_009480	GGC	2	6	203873	203878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271323
5584	NC_009480	ACG	2	6	203914	203919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271323
5585	NC_009480	CGG	2	6	203927	203932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271323
5586	NC_009480	GCC	2	6	204018	204023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271323
5587	NC_009480	TCG	2	6	204167	204172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271323
5588	NC_009480	GCG	2	6	204176	204181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271323
5589	NC_009480	GTC	2	6	204196	204201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271323
5590	NC_009480	GAC	2	6	204220	204225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271323
5591	NC_009480	GGA	2	6	204228	204233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271323
5592	NC_009480	CGG	2	6	204245	204250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271323
5593	NC_009480	CGA	3	9	204272	204280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271323
5594	NC_009480	GATC	2	8	204330	204337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_009480	GGC	2	6	204350	204355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_009480	GGC	2	6	204539	204544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271324
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5598	NC_009480	CCG	2	6	204576	204581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271324
5599	NC_009480	CG	3	6	204584	204589	0 %	0 %	50 %	50 %	148271324
5600	NC_009480	CGA	2	6	204619	204624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271324
5601	NC_009480	CCA	2	6	204637	204642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271324
5602	NC_009480	GC	3	6	204679	204684	0 %	0 %	50 %	50 %	148271324
5603	NC_009480	GCC	2	6	204752	204757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271324
5604	NC_009480	TCCGC	2	10	204867	204876	0 %	20 %	20 %	60 %	148271324
5605	NC_009480	CGC	3	9	204874	204882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271324
5606	NC_009480	GCCC	2	8	204902	204909	0 %	0 %	25 %	75 %	148271324
5607	NC_009480	CGAGGG	2	12	204970	204981	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148271324
5608	NC_009480	CGG	4	12	205011	205022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271324
5609	NC_009480	GCG	2	6	205028	205033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271324
5610	NC_009480	GGC	2	6	205034	205039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271324
5611	NC_009480	GCGG	2	8	205061	205068	0 %	0 %	75 %	25 %	148271324
5612	NC_009480	GCGCG	2	10	205078	205087	0 %	0 %	60 %	40 %	148271324
5613	NC_009480	GGCC	2	8	205102	205109	0 %	0 %	50 %	50 %	148271325
5614	NC_009480	GGT	2	6	205114	205119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271325
5615	NC_009480	GCG	2	6	205122	205127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271325
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5617	NC_009480	CGA	2	6	205173	205178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271325
5618	NC_009480	CG	3	6	205192	205197	0 %	0 %	50 %	50 %	148271325
5619	NC_009480	ACC	2	6	205244	205249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271325
5620	NC_009480	CGT	2	6	205269	205274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271325
5621	NC_009480	GTT	2	6	205309	205314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148271325
5622	NC_009480	GTC	2	6	205342	205347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271325
5623	NC_009480	TCC	2	6	205373	205378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271325
5624	NC_009480	CGTG	2	8	205389	205396	0 %	25 %	50 %	25 %	148271325
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5863	NC_009480	GCA	2	6	213841	213846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5989	NC_009480	GGC	2	6	217377	217382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271335
5990	NC_009480	CGT	3	9	217401	217409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271335
5991	NC_009480	ATC	2	6	217480	217485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271336
5992	NC_009480	CGA	2	6	217526	217531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271336
5993	NC_009480	CGG	2	6	217556	217561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271336
5994	NC_009480	GC	3	6	217602	217607	0 %	0 %	50 %	50 %	148271336
5995	NC_009480	GCGA	2	8	217609	217616	25 %	0 %	50 %	25 %	148271336
5996	NC_009480	CAG	2	6	217617	217622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271336
5997	NC_009480	ATC	2	6	217630	217635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271336
5998	NC_009480	GCC	2	6	217641	217646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271336
5999	NC_009480	GGC	2	6	217670	217675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271336
6000	NC_009480	CCGG	2	8	217688	217695	0 %	0 %	50 %	50 %	148271336

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