MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 104857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_009480	AGG	2	6	170782	170787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271293
4503	NC_009480	GC	3	6	170825	170830	0 %	0 %	50 %	50 %	148271293
4504	NC_009480	TCG	2	6	170863	170868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271293
4505	NC_009480	CGC	2	6	170871	170876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271293
4506	NC_009480	TCG	2	6	170956	170961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271293
4507	NC_009480	CGC	2	6	171035	171040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271293
4508	NC_009480	GAG	2	6	171042	171047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271293
4509	NC_009480	CGA	2	6	171053	171058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271293
4510	NC_009480	CGA	2	6	171071	171076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271293
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4512	NC_009480	CG	3	6	171108	171113	0 %	0 %	50 %	50 %	148271293
4513	NC_009480	GAG	2	6	171117	171122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271293
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4521	NC_009480	CCCG	2	8	171249	171256	0 %	0 %	25 %	75 %	148271293
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4525	NC_009480	CGGCGT	2	12	171374	171385	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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4527	NC_009480	GC	3	6	171489	171494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_009480	CGG	2	6	171573	171578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271294
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4541	NC_009480	GCC	2	6	172087	172092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_009480	GCC	2	6	172124	172129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271295
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4553	NC_009480	CGA	2	6	172398	172403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271295
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4557	NC_009480	CGA	2	6	172506	172511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271295
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4559	NC_009480	CGA	2	6	172536	172541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271295
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4591	NC_009480	TCG	2	6	173439	173444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271295
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4601	NC_009480	CGA	2	6	173782	173787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271296
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4603	NC_009480	GGC	2	6	173821	173826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271296
4604	NC_009480	TCGGC	2	10	173827	173836	0 %	20 %	40 %	40 %	148271296
4605	NC_009480	CGA	2	6	173875	173880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271296
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4609	NC_009480	CGA	2	6	173995	174000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271296
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4862	NC_009480	CGA	2	6	181729	181734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271301
4863	NC_009480	AGA	2	6	181753	181758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271301
4864	NC_009480	AGG	2	6	181843	181848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271301
4865	NC_009480	CGC	2	6	181861	181866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271301
4866	NC_009480	CGGG	2	8	181888	181895	0 %	0 %	75 %	25 %	148271301
4867	NC_009480	GCG	2	6	181921	181926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271301
4868	NC_009480	TATC	2	8	182011	182018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4869	NC_009480	TCT	2	6	182092	182097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4870	NC_009480	CGC	2	6	182117	182122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4871	NC_009480	GCGT	2	8	182188	182195	0 %	25 %	50 %	25 %	148271302
4872	NC_009480	GCC	3	9	182202	182210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271302
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4875	NC_009480	GA	3	6	182276	182281	50 %	0 %	50 %	0 %	148271302
4876	NC_009480	CG	3	6	182312	182317	0 %	0 %	50 %	50 %	148271302
4877	NC_009480	CCG	2	6	182338	182343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271302
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4881	NC_009480	CG	3	6	182444	182449	0 %	0 %	50 %	50 %	148271302
4882	NC_009480	GTC	2	6	182474	182479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271302
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4884	NC_009480	CGA	2	6	182518	182523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271302
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4886	NC_009480	CGT	3	9	182542	182550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271302
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4891	NC_009480	CGGC	2	8	182629	182636	0 %	0 %	50 %	50 %	148271302
4892	NC_009480	CGT	2	6	182641	182646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271302
4893	NC_009480	ACGA	2	8	182685	182692	50 %	0 %	25 %	25 %	148271302
4894	NC_009480	GGT	2	6	182708	182713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271302
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4898	NC_009480	TCG	2	6	182892	182897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271302
4899	NC_009480	TCG	2	6	182940	182945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271302
4900	NC_009480	GC	3	6	182947	182952	0 %	0 %	50 %	50 %	148271302
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4903	NC_009480	CCGC	2	8	182997	183004	0 %	0 %	25 %	75 %	148271302
4904	NC_009480	CGG	2	6	183043	183048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271302
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4912	NC_009480	GGC	2	6	183298	183303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271302
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4978	NC_009480	CGA	2	6	185098	185103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271302
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4980	NC_009480	GCG	2	6	185121	185126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271302
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4982	NC_009480	GTCGGT	2	12	185144	185155	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148271302
4983	NC_009480	CGG	2	6	185224	185229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271302
4984	NC_009480	CGT	2	6	185249	185254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271302
4985	NC_009480	CTC	2	6	185255	185260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271302
4986	NC_009480	CG	3	6	185267	185272	0 %	0 %	50 %	50 %	148271302
4987	NC_009480	GC	3	6	185287	185292	0 %	0 %	50 %	50 %	148271302
4988	NC_009480	CGG	2	6	185392	185397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271302
4989	NC_009480	GC	3	6	185425	185430	0 %	0 %	50 %	50 %	148271302
4990	NC_009480	TGC	2	6	185511	185516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271302
4991	NC_009480	TCGA	2	8	185529	185536	25 %	25 %	25 %	25 %	148271302
4992	NC_009480	GTCC	2	8	185609	185616	0 %	25 %	25 %	50 %	148271303
4993	NC_009480	TCG	2	6	185619	185624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271303
4994	NC_009480	GC	3	6	185634	185639	0 %	0 %	50 %	50 %	148271303
4995	NC_009480	GC	3	6	185644	185649	0 %	0 %	50 %	50 %	148271303
4996	NC_009480	TCG	2	6	185662	185667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271303
4997	NC_009480	CGCCAG	2	12	185679	185690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148271303
4998	NC_009480	C	6	6	185691	185696	0 %	0 %	0 %	100 %	148271303
4999	NC_009480	CCCGGT	2	12	185712	185723	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148271303
5000	NC_009480	CGG	3	9	185843	185851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271303

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