MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009479	GC	3	6	600	605	0 %	0 %	50 %	50 %	148271111
2	NC_009479	GC	3	6	615	620	0 %	0 %	50 %	50 %	148271111
3	NC_009479	CG	3	6	1665	1670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009479	CG	3	6	1819	1824	0 %	0 %	50 %	50 %	148271112
5	NC_009479	GC	4	8	2119	2126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009479	CT	3	6	2319	2324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009479	GC	3	6	3621	3626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009479	TA	3	6	3800	3805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009479	GC	3	6	5614	5619	0 %	0 %	50 %	50 %	148271117
10	NC_009479	GC	4	8	6177	6184	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
11	NC_009479	GC	3	6	6414	6419	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
12	NC_009479	GC	3	6	6469	6474	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
13	NC_009479	CA	4	8	6825	6832	50 %	0 %	0 %	50 %	148271118
14	NC_009479	CG	3	6	7021	7026	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
15	NC_009479	CG	3	6	7133	7138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009479	CG	3	6	7198	7203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009479	CG	3	6	7383	7388	0 %	0 %	50 %	50 %	148271119
18	NC_009479	CG	3	6	7653	7658	0 %	0 %	50 %	50 %	148271119
19	NC_009479	GC	5	10	8151	8160	0 %	0 %	50 %	50 %	148271120
20	NC_009479	CG	3	6	8168	8173	0 %	0 %	50 %	50 %	148271120
21	NC_009479	GC	3	6	8324	8329	0 %	0 %	50 %	50 %	148271121
22	NC_009479	CG	3	6	8721	8726	0 %	0 %	50 %	50 %	148271122
23	NC_009479	CA	3	6	8804	8809	50 %	0 %	0 %	50 %	148271122
24	NC_009479	CG	3	6	8850	8855	0 %	0 %	50 %	50 %	148271122
25	NC_009479	GC	3	6	9612	9617	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
26	NC_009479	GC	3	6	9761	9766	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
27	NC_009479	CG	3	6	10366	10371	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
28	NC_009479	GC	4	8	10567	10574	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
29	NC_009479	GC	3	6	10670	10675	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
30	NC_009479	GC	3	6	11354	11359	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
31	NC_009479	CG	5	10	11685	11694	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
32	NC_009479	CG	3	6	12184	12189	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
33	NC_009479	GC	3	6	12249	12254	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
34	NC_009479	GC	3	6	13275	13280	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
35	NC_009479	GC	3	6	13419	13424	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
36	NC_009479	CG	3	6	13757	13762	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
37	NC_009479	GC	3	6	14998	15003	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
38	NC_009479	CG	5	10	15009	15018	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
39	NC_009479	CG	3	6	15288	15293	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
40	NC_009479	CG	3	6	15573	15578	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
41	NC_009479	GC	3	6	15868	15873	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
42	NC_009479	CG	3	6	16262	16267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009479	CG	4	8	16844	16851	0 %	0 %	50 %	50 %	148271126
44	NC_009479	TG	3	6	16867	16872	0 %	50 %	50 %	0 %	148271126
45	NC_009479	CG	4	8	17039	17046	0 %	0 %	50 %	50 %	148271126
46	NC_009479	GC	3	6	17089	17094	0 %	0 %	50 %	50 %	148271126
47	NC_009479	GA	3	6	17146	17151	50 %	0 %	50 %	0 %	148271126
48	NC_009479	GC	3	6	18001	18006	0 %	0 %	50 %	50 %	148271128
49	NC_009479	GC	3	6	18101	18106	0 %	0 %	50 %	50 %	148271128
50	NC_009479	CG	3	6	18298	18303	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
51	NC_009479	CG	3	6	18342	18347	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
52	NC_009479	CG	3	6	18353	18358	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
53	NC_009479	GC	3	6	18419	18424	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
54	NC_009479	GC	3	6	18587	18592	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
55	NC_009479	GA	3	6	18713	18718	50 %	0 %	50 %	0 %	148271127
56	NC_009479	GC	3	6	19047	19052	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
57	NC_009479	CG	3	6	19187	19192	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
58	NC_009479	TG	3	6	19797	19802	0 %	50 %	50 %	0 %	148271130
59	NC_009479	AG	3	6	20042	20047	50 %	0 %	50 %	0 %	148271130
60	NC_009479	TC	3	6	20167	20172	0 %	50 %	0 %	50 %	148271130
61	NC_009479	TG	3	6	22209	22214	0 %	50 %	50 %	0 %	148271131
62	NC_009479	CG	3	6	22232	22237	0 %	0 %	50 %	50 %	148271131
63	NC_009479	AT	3	6	23337	23342	50 %	50 %	0 %	0 %	148271132
64	NC_009479	CG	3	6	24170	24175	0 %	0 %	50 %	50 %	148271133
65	NC_009479	CG	3	6	24951	24956	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
66	NC_009479	CG	3	6	24961	24966	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
67	NC_009479	GC	3	6	25204	25209	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
68	NC_009479	TC	3	6	25243	25248	0 %	50 %	0 %	50 %	148271135
69	NC_009479	CG	3	6	25405	25410	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
70	NC_009479	CG	3	6	25957	25962	0 %	0 %	50 %	50 %	148271136
71	NC_009479	GC	3	6	26046	26051	0 %	0 %	50 %	50 %	148271136
72	NC_009479	GC	3	6	26532	26537	0 %	0 %	50 %	50 %	148271136
73	NC_009479	GA	3	6	27282	27287	50 %	0 %	50 %	0 %	148271137
74	NC_009479	GC	5	10	27680	27689	0 %	0 %	50 %	50 %	148271137
75	NC_009479	GC	3	6	27942	27947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009479	CG	3	6	28378	28383	0 %	0 %	50 %	50 %	148271138
77	NC_009479	CG	3	6	28404	28409	0 %	0 %	50 %	50 %	148271138
78	NC_009479	CG	3	6	28551	28556	0 %	0 %	50 %	50 %	148271138
79	NC_009479	GC	3	6	28729	28734	0 %	0 %	50 %	50 %	148271138
80	NC_009479	CG	3	6	29240	29245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009479	AC	3	6	29293	29298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009479	CG	3	6	29414	29419	0 %	0 %	50 %	50 %	148271139
83	NC_009479	CG	4	8	29477	29484	0 %	0 %	50 %	50 %	148271139
84	NC_009479	CG	3	6	29775	29780	0 %	0 %	50 %	50 %	148271140
85	NC_009479	GC	3	6	29788	29793	0 %	0 %	50 %	50 %	148271140
86	NC_009479	GC	3	6	30337	30342	0 %	0 %	50 %	50 %	148271140
87	NC_009479	CG	3	6	30404	30409	0 %	0 %	50 %	50 %	148271140
88	NC_009479	AC	3	6	31761	31766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009479	GC	3	6	32596	32601	0 %	0 %	50 %	50 %	148271141
90	NC_009479	CT	3	6	33074	33079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009479	TC	5	10	33144	33153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009479	GC	4	8	33497	33504	0 %	0 %	50 %	50 %	148271142
93	NC_009479	CG	3	6	33787	33792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009479	GA	3	6	33920	33925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009479	GC	3	6	35152	35157	0 %	0 %	50 %	50 %	148271143
96	NC_009479	GC	3	6	37015	37020	0 %	0 %	50 %	50 %	148271143
97	NC_009479	AT	3	6	37581	37586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009479	TG	3	6	37734	37739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009479	GC	3	6	37990	37995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009479	CG	4	8	38237	38244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009479	GC	3	6	38357	38362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009479	CG	3	6	38484	38489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009479	GC	4	8	38861	38868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009479	CG	3	6	39122	39127	0 %	0 %	50 %	50 %	148271144
105	NC_009479	GA	3	6	39633	39638	50 %	0 %	50 %	0 %	148271145
106	NC_009479	GC	3	6	40039	40044	0 %	0 %	50 %	50 %	148271145
107	NC_009479	GA	3	6	40622	40627	50 %	0 %	50 %	0 %	148271146
108	NC_009479	CG	3	6	40718	40723	0 %	0 %	50 %	50 %	148271146
109	NC_009479	CG	3	6	41715	41720	0 %	0 %	50 %	50 %	148271147
110	NC_009479	GC	3	6	42360	42365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009479	TA	3	6	42685	42690	50 %	50 %	0 %	0 %	148271148
112	NC_009479	CG	3	6	43415	43420	0 %	0 %	50 %	50 %	148271149
113	NC_009479	GC	3	6	43889	43894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009479	CG	4	8	44263	44270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009479	GC	3	6	44706	44711	0 %	0 %	50 %	50 %	148271150
116	NC_009479	CG	3	6	45582	45587	0 %	0 %	50 %	50 %	148271151
117	NC_009479	CT	3	6	45599	45604	0 %	50 %	0 %	50 %	148271151
118	NC_009479	TG	3	6	45618	45623	0 %	50 %	50 %	0 %	148271151
119	NC_009479	GC	3	6	45964	45969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009479	GC	3	6	46422	46427	0 %	0 %	50 %	50 %	148271152
121	NC_009479	GC	3	6	47125	47130	0 %	0 %	50 %	50 %	148271154
122	NC_009479	GC	3	6	47479	47484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009479	TG	3	6	48050	48055	0 %	50 %	50 %	0 %	148271155
124	NC_009479	CG	3	6	48196	48201	0 %	0 %	50 %	50 %	148271155
125	NC_009479	GC	3	6	49266	49271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009479	CG	3	6	49282	49287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009479	GC	3	6	49561	49566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009479	GC	3	6	50177	50182	0 %	0 %	50 %	50 %	148271157
129	NC_009479	CG	3	6	50637	50642	0 %	0 %	50 %	50 %	148271158
130	NC_009479	GC	3	6	50656	50661	0 %	0 %	50 %	50 %	148271158
131	NC_009479	CA	3	6	51057	51062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009479	GC	3	6	51223	51228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009479	GC	3	6	51389	51394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009479	CG	3	6	51618	51623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009479	GA	3	6	51866	51871	50 %	0 %	50 %	0 %	148271159
136	NC_009479	GC	3	6	52465	52470	0 %	0 %	50 %	50 %	148271160
137	NC_009479	GA	3	6	53186	53191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009479	CG	3	6	53426	53431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009479	TC	3	6	53821	53826	0 %	50 %	0 %	50 %	148271161
140	NC_009479	TG	3	6	54314	54319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009479	TC	3	6	55736	55741	0 %	50 %	0 %	50 %	148271162
142	NC_009479	GA	3	6	55924	55929	50 %	0 %	50 %	0 %	148271162
143	NC_009479	CG	3	6	56214	56219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009479	CG	3	6	57676	57681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009479	CG	3	6	58036	58041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009479	GC	3	6	58450	58455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009479	GC	3	6	58727	58732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.