MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 1706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009479	TGC	2	6	17684	17689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271126
502	NC_009479	GCCC	2	8	17779	17786	0 %	0 %	25 %	75 %	148271128
503	NC_009479	CGC	2	6	17807	17812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271128
504	NC_009479	CTG	2	6	17825	17830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271128
505	NC_009479	CACG	2	8	17854	17861	25 %	0 %	25 %	50 %	148271128
506	NC_009479	CGC	2	6	17891	17896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271128
507	NC_009479	GGC	2	6	17968	17973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271128
508	NC_009479	CGCGGC	2	12	17978	17989	0 %	0 %	50 %	50 %	148271128
509	NC_009479	GC	3	6	18001	18006	0 %	0 %	50 %	50 %	148271128
510	NC_009479	TCA	2	6	18018	18023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271128
511	NC_009479	TCG	2	6	18028	18033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271128
512	NC_009479	GGC	2	6	18077	18082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271128
513	NC_009479	GCG	2	6	18085	18090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271128
514	NC_009479	GC	3	6	18101	18106	0 %	0 %	50 %	50 %	148271128
515	NC_009479	ACG	2	6	18138	18143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271128
516	NC_009479	CGA	2	6	18205	18210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271127
517	NC_009479	GGC	2	6	18212	18217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271127
518	NC_009479	CG	3	6	18298	18303	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
519	NC_009479	CGA	2	6	18323	18328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271127
520	NC_009479	CTC	2	6	18329	18334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271127
521	NC_009479	CG	3	6	18342	18347	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
522	NC_009479	CG	3	6	18353	18358	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
523	NC_009479	TCG	2	6	18366	18371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271127
524	NC_009479	TGA	2	6	18391	18396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271127
525	NC_009479	CGA	2	6	18397	18402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271127
526	NC_009479	GC	3	6	18419	18424	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
527	NC_009479	CAGC	2	8	18440	18447	25 %	0 %	25 %	50 %	148271127
528	NC_009479	CGA	2	6	18473	18478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271127
529	NC_009479	TCACGA	2	12	18493	18504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148271127
530	NC_009479	GGA	2	6	18520	18525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271127
531	NC_009479	CAC	2	6	18572	18577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271127
532	NC_009479	GTA	2	6	18581	18586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271127
533	NC_009479	GC	3	6	18587	18592	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
534	NC_009479	GTG	2	6	18686	18691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271127
535	NC_009479	GA	3	6	18713	18718	50 %	0 %	50 %	0 %	148271127
536	NC_009479	GAC	2	6	18740	18745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271127
537	NC_009479	CGT	2	6	18772	18777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271127
538	NC_009479	GCC	2	6	18780	18785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271127
539	NC_009479	CGG	2	6	18842	18847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271127
540	NC_009479	CGC	2	6	18850	18855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271127
541	NC_009479	CAT	2	6	18869	18874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271127
542	NC_009479	GTC	2	6	18888	18893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271127
543	NC_009479	CGC	2	6	18907	18912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271127
544	NC_009479	CGC	2	6	18968	18973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271127
545	NC_009479	CAC	2	6	19016	19021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271127
546	NC_009479	GC	3	6	19047	19052	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
547	NC_009479	CCGCGG	2	12	19061	19072	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
548	NC_009479	CGT	2	6	19142	19147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271127
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550	NC_009479	CGGCGC	2	12	19175	19186	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
551	NC_009479	CG	3	6	19187	19192	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
552	NC_009479	CGT	2	6	19234	19239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271129
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554	NC_009479	CGC	2	6	19393	19398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271129
555	NC_009479	AGC	2	6	19407	19412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271129
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557	NC_009479	GCT	3	9	19483	19491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271130
558	NC_009479	CGGC	2	8	19554	19561	0 %	0 %	50 %	50 %	148271130
559	NC_009479	AGG	2	6	19565	19570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271130
560	NC_009479	GCG	2	6	19617	19622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271130
561	NC_009479	TG	3	6	19797	19802	0 %	50 %	50 %	0 %	148271130
562	NC_009479	TGC	2	6	19825	19830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271130
563	NC_009479	CGT	2	6	19849	19854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271130
564	NC_009479	CGA	2	6	19861	19866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271130
565	NC_009479	CCT	2	6	19966	19971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271130
566	NC_009479	TGC	2	6	19989	19994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271130
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572	NC_009479	GCGA	2	8	20204	20211	25 %	0 %	50 %	25 %	148271130
573	NC_009479	GCA	2	6	20254	20259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271130
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593	NC_009479	ACG	2	6	21301	21306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
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609	NC_009479	ACG	2	6	21890	21895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
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617	NC_009479	CG	3	6	22232	22237	0 %	0 %	50 %	50 %	148271131
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624	NC_009479	TCAC	2	8	22478	22485	25 %	25 %	0 %	50 %	148271131
625	NC_009479	TTCC	2	8	22492	22499	0 %	50 %	0 %	50 %	148271132
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627	NC_009479	GCC	2	6	22545	22550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271132
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