MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 1421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009466	CTG	2	6	40254	40259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1002	NC_009466	TTC	2	6	40269	40274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1003	NC_009466	GTA	2	6	40276	40281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245165
1004	NC_009466	TCT	2	6	40348	40353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1005	NC_009466	T	6	6	40355	40360	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1006	NC_009466	TCT	2	6	40369	40374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1007	NC_009466	AT	3	6	40418	40423	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
1008	NC_009466	ACT	2	6	40431	40436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1009	NC_009466	GCA	2	6	40465	40470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1010	NC_009466	GCT	2	6	40525	40530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1011	NC_009466	TGC	2	6	40722	40727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1012	NC_009466	ATT	2	6	40761	40766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1013	NC_009466	TTC	2	6	40809	40814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1014	NC_009466	CTT	2	6	40847	40852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1015	NC_009466	CTTT	2	8	40866	40873	0 %	75 %	0 %	25 %	148245165
1016	NC_009466	CAT	2	6	40892	40897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1017	NC_009466	CTG	2	6	41118	41123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1018	NC_009466	ATT	2	6	41142	41147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1019	NC_009466	GCC	2	6	41164	41169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245165
1020	NC_009466	T	6	6	41217	41222	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1021	NC_009466	GCT	2	6	41299	41304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1022	NC_009466	T	6	6	41362	41367	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1023	NC_009466	ATT	2	6	41484	41489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1024	NC_009466	TCC	2	6	41502	41507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245165
1025	NC_009466	TA	3	6	41642	41647	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
1026	NC_009466	TA	3	6	41667	41672	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
1027	NC_009466	GCT	3	9	41680	41688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1028	NC_009466	CCA	2	6	41824	41829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245165
1029	NC_009466	TCCAG	2	10	41851	41860	20 %	20 %	20 %	40 %	148245165
1030	NC_009466	C	6	6	41922	41927	0 %	0 %	0 %	100 %	148245165
1031	NC_009466	TTTTG	2	10	41951	41960	0 %	80 %	20 %	0 %	148245165
1032	NC_009466	GAA	2	6	41961	41966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245165
1033	NC_009466	TGT	2	6	42030	42035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245165
1034	NC_009466	AAT	2	6	42087	42092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245165
1035	NC_009466	CAG	2	6	42134	42139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1036	NC_009466	ATT	2	6	42213	42218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1037	NC_009466	ATT	2	6	42237	42242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1038	NC_009466	GCC	2	6	42322	42327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245165
1039	NC_009466	AGTTA	2	10	42339	42348	40 %	40 %	20 %	0 %	148245165
1040	NC_009466	GTA	2	6	42358	42363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245165
1041	NC_009466	ATT	2	6	42369	42374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1042	NC_009466	ATT	2	6	42399	42404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1043	NC_009466	TTGC	2	8	42457	42464	0 %	50 %	25 %	25 %	148245165
1044	NC_009466	ATT	2	6	42531	42536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1045	NC_009466	TCT	2	6	42634	42639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1046	NC_009466	TAT	2	6	42764	42769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1047	NC_009466	TTA	2	6	42779	42784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1048	NC_009466	ATT	2	6	42819	42824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1049	NC_009466	TTGT	2	8	42827	42834	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
1050	NC_009466	TAG	2	6	42854	42859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245165
1051	NC_009466	ATT	2	6	42873	42878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1052	NC_009466	GTG	2	6	42905	42910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245165
1053	NC_009466	CAT	2	6	43049	43054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1054	NC_009466	GTA	2	6	43144	43149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245165
1055	NC_009466	TTTTG	2	10	43158	43167	0 %	80 %	20 %	0 %	148245165
1056	NC_009466	TAA	2	6	43214	43219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245165
1057	NC_009466	CGC	2	6	43226	43231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245165
1058	NC_009466	CTT	2	6	43256	43261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1059	NC_009466	GGT	2	6	43282	43287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245165
1060	NC_009466	CTA	2	6	43373	43378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1061	NC_009466	ATT	2	6	43383	43388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1062	NC_009466	T	6	6	43420	43425	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1063	NC_009466	CAT	2	6	43493	43498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1064	NC_009466	CAA	2	6	43520	43525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148245165
1065	NC_009466	ATT	2	6	43642	43647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1066	NC_009466	TCGC	2	8	43726	43733	0 %	25 %	25 %	50 %	148245165
1067	NC_009466	TTACT	2	10	43781	43790	20 %	60 %	0 %	20 %	148245165
1068	NC_009466	ATT	2	6	43890	43895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1069	NC_009466	AT	3	6	43908	43913	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
1070	NC_009466	T	6	6	43943	43948	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1071	NC_009466	T	6	6	43950	43955	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1072	NC_009466	TGT	2	6	43993	43998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245165
1073	NC_009466	AAAT	2	8	44028	44035	75 %	25 %	0 %	0 %	148245165
1074	NC_009466	GCA	2	6	44077	44082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1075	NC_009466	T	7	7	44191	44197	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1076	NC_009466	GTT	2	6	44198	44203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245165
1077	NC_009466	TTTG	2	8	44231	44238	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
1078	NC_009466	ATT	2	6	44277	44282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1079	NC_009466	TTA	2	6	44287	44292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1080	NC_009466	TTTCA	2	10	44325	44334	20 %	60 %	0 %	20 %	148245165
1081	NC_009466	AGT	2	6	44400	44405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245165
1082	NC_009466	TTG	2	6	44433	44438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245165
1083	NC_009466	CAAA	2	8	44588	44595	75 %	0 %	0 %	25 %	148245165
1084	NC_009466	GTCTG	2	10	44611	44620	0 %	40 %	40 %	20 %	148245165
1085	NC_009466	TA	3	6	44639	44644	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
1086	NC_009466	GCC	2	6	44656	44661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245165
1087	NC_009466	TGC	2	6	44703	44708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1088	NC_009466	TGC	2	6	44721	44726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1089	NC_009466	TCC	2	6	44739	44744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245165
1090	NC_009466	AGC	2	6	44748	44753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1091	NC_009466	CCAGCT	2	12	44770	44781	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148245165
1092	NC_009466	CTG	2	6	44783	44788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1093	NC_009466	CTG	2	6	44804	44809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1094	NC_009466	TGC	2	6	44811	44816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1095	NC_009466	GCG	2	6	44824	44829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245165
1096	NC_009466	GCA	2	6	44839	44844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1097	NC_009466	AGCCA	2	10	44895	44904	40 %	0 %	20 %	40 %	148245165
1098	NC_009466	CCT	2	6	44923	44928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245165
1099	NC_009466	GCT	2	6	44929	44934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1100	NC_009466	CTA	2	6	44954	44959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1101	NC_009466	CTT	2	6	45050	45055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1102	NC_009466	CTG	2	6	45068	45073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1103	NC_009466	TGC	2	6	45129	45134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1104	NC_009466	GCA	2	6	45145	45150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1105	NC_009466	AGC	2	6	45381	45386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1106	NC_009466	ATC	2	6	45387	45392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1107	NC_009466	GCT	2	6	45577	45582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1108	NC_009466	ACA	2	6	45655	45660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148245165
1109	NC_009466	TTCCA	2	10	45681	45690	20 %	40 %	0 %	40 %	148245165
1110	NC_009466	GAA	2	6	45691	45696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245165
1111	NC_009466	CTTG	2	8	45981	45988	0 %	50 %	25 %	25 %	148245165
1112	NC_009466	T	6	6	46011	46016	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1113	NC_009466	TTC	2	6	46023	46028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245165
1114	NC_009466	TTAT	2	8	46060	46067	25 %	75 %	0 %	0 %	148245165
1115	NC_009466	TTGT	2	8	46072	46079	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
1116	NC_009466	TGTAT	2	10	46132	46141	20 %	60 %	20 %	0 %	148245165
1117	NC_009466	ATT	2	6	46161	46166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1118	NC_009466	TTA	2	6	46198	46203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
1119	NC_009466	TCA	2	6	46207	46212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1120	NC_009466	T	6	6	46227	46232	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
1121	NC_009466	TGC	3	9	46260	46268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1122	NC_009466	TCA	2	6	46291	46296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1123	NC_009466	CAT	2	6	46314	46319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245165
1124	NC_009466	GTT	2	6	46329	46334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245165
1125	NC_009466	TGC	2	6	46363	46368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245165
1126	NC_009466	TAT	2	6	46380	46385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245165
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1128	NC_009466	T	6	6	46447	46452	0 %	100 %	0 %	0 %	148245165
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1252	NC_009466	TAG	2	6	51510	51515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245174
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1254	NC_009466	TAA	2	6	51641	51646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245174
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1386	NC_009466	TA	4	8	57514	57521	50 %	50 %	0 %	0 %	148245179
1387	NC_009466	CAC	2	6	57561	57566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1419	NC_009466	ACT	2	6	59110	59115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1420	NC_009466	AGT	2	6	59147	59152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_009466	CTTT	2	8	59173	59180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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