MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 1421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009466	GAT	2	6	20681	20686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245142
502	NC_009466	ATTT	2	8	20687	20694	25 %	75 %	0 %	0 %	148245142
503	NC_009466	A	6	6	20695	20700	100 %	0 %	0 %	0 %	148245142
504	NC_009466	TAA	2	6	20725	20730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245142
505	NC_009466	GTT	2	6	20759	20764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245142
506	NC_009466	CAA	2	6	20790	20795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148245142
507	NC_009466	AAT	2	6	20834	20839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245142
508	NC_009466	TAC	2	6	20857	20862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245142
509	NC_009466	TCC	2	6	20887	20892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245142
510	NC_009466	TTC	2	6	20958	20963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245142
511	NC_009466	TAG	2	6	20997	21002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245142
512	NC_009466	AAT	2	6	21068	21073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245142
513	NC_009466	AT	3	6	21215	21220	50 %	50 %	0 %	0 %	148245142
514	NC_009466	A	7	7	21240	21246	100 %	0 %	0 %	0 %	148245142
515	NC_009466	A	6	6	21248	21253	100 %	0 %	0 %	0 %	148245142
516	NC_009466	TAAA	2	8	21291	21298	75 %	25 %	0 %	0 %	148245142
517	NC_009466	GAA	2	6	21299	21304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245142
518	NC_009466	A	7	7	21331	21337	100 %	0 %	0 %	0 %	148245142
519	NC_009466	ATA	2	6	21339	21344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245142
520	NC_009466	GTACG	2	10	21359	21368	20 %	20 %	40 %	20 %	148245142
521	NC_009466	ATT	2	6	21381	21386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245142
522	NC_009466	TAT	2	6	21440	21445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245142
523	NC_009466	AAATA	2	10	21532	21541	80 %	20 %	0 %	0 %	148245142
524	NC_009466	TTA	2	6	21549	21554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245142
525	NC_009466	AGA	2	6	21562	21567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245142
526	NC_009466	TA	3	6	21570	21575	50 %	50 %	0 %	0 %	148245142
527	NC_009466	AAC	2	6	21638	21643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148245142
528	NC_009466	ATAG	2	8	21685	21692	50 %	25 %	25 %	0 %	148245142
529	NC_009466	TG	3	6	21698	21703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009466	CT	3	6	21704	21709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_009466	CAT	2	6	21740	21745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245143
532	NC_009466	TCT	2	6	21752	21757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245143
533	NC_009466	TAA	2	6	21775	21780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245143
534	NC_009466	TCT	2	6	21783	21788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245143
535	NC_009466	TC	3	6	21809	21814	0 %	50 %	0 %	50 %	148245143
536	NC_009466	T	8	8	21869	21876	0 %	100 %	0 %	0 %	148245143
537	NC_009466	ATTTTT	2	12	21925	21936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148245143
538	NC_009466	CT	3	6	21986	21991	0 %	50 %	0 %	50 %	148245143
539	NC_009466	TAG	2	6	22062	22067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245143
540	NC_009466	T	6	6	22070	22075	0 %	100 %	0 %	0 %	148245143
541	NC_009466	TTC	2	6	22090	22095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245143
542	NC_009466	TAC	4	12	22117	22128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245143
543	NC_009466	TTA	2	6	22155	22160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245143
544	NC_009466	TTC	2	6	22201	22206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245143
545	NC_009466	ATTT	2	8	22231	22238	25 %	75 %	0 %	0 %	148245143
546	NC_009466	T	7	7	22236	22242	0 %	100 %	0 %	0 %	148245143
547	NC_009466	T	6	6	22283	22288	0 %	100 %	0 %	0 %	148245143
548	NC_009466	T	6	6	22290	22295	0 %	100 %	0 %	0 %	148245143
549	NC_009466	CTT	2	6	22308	22313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245143
550	NC_009466	GAG	2	6	22326	22331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245143
551	NC_009466	TTA	2	6	22359	22364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245143
552	NC_009466	T	7	7	22367	22373	0 %	100 %	0 %	0 %	148245143
553	NC_009466	T	6	6	22459	22464	0 %	100 %	0 %	0 %	148245143
554	NC_009466	TAT	2	6	22566	22571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245143
555	NC_009466	AAT	2	6	22581	22586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245143
556	NC_009466	T	7	7	22592	22598	0 %	100 %	0 %	0 %	148245143
557	NC_009466	TTG	2	6	22608	22613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245143
558	NC_009466	A	6	6	22620	22625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009466	T	7	7	22668	22674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009466	ATC	2	6	22713	22718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009466	ATAGA	2	10	22743	22752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009466	TA	3	6	22753	22758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009466	CTT	2	6	22769	22774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_009466	GCA	2	6	22788	22793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_009466	TGC	2	6	22818	22823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_009466	T	6	6	22830	22835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009466	TA	4	8	22841	22848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009466	TAA	2	6	22875	22880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009466	TAT	2	6	22881	22886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009466	AAT	2	6	22934	22939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009466	AT	3	6	22938	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009466	TATAA	2	10	22965	22974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009466	CA	3	6	22982	22987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_009466	GTT	2	6	23068	23073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245144
575	NC_009466	GTA	2	6	23089	23094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245144
576	NC_009466	T	7	7	23115	23121	0 %	100 %	0 %	0 %	148245144
577	NC_009466	TAT	2	6	23173	23178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245144
578	NC_009466	T	7	7	23234	23240	0 %	100 %	0 %	0 %	148245144
579	NC_009466	T	6	6	23248	23253	0 %	100 %	0 %	0 %	148245144
580	NC_009466	TGG	2	6	23255	23260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245144
581	NC_009466	TTC	2	6	23276	23281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245144
582	NC_009466	GTC	2	6	23285	23290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245144
583	NC_009466	CTT	2	6	23320	23325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245144
584	NC_009466	ACC	2	6	23402	23407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245144
585	NC_009466	AT	3	6	23439	23444	50 %	50 %	0 %	0 %	148245144
586	NC_009466	TCC	2	6	23457	23462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_009466	ATA	2	6	23469	23474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009466	TA	3	6	23478	23483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009466	GTG	2	6	23492	23497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009466	TG	3	6	23616	23621	0 %	50 %	50 %	0 %	148245145
591	NC_009466	CTT	2	6	23625	23630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245145
592	NC_009466	T	7	7	23633	23639	0 %	100 %	0 %	0 %	148245145
593	NC_009466	ATCC	2	8	23642	23649	25 %	25 %	0 %	50 %	148245145
594	NC_009466	T	7	7	23653	23659	0 %	100 %	0 %	0 %	148245145
595	NC_009466	TAAT	2	8	23667	23674	50 %	50 %	0 %	0 %	148245145
596	NC_009466	TCC	2	6	23695	23700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_009466	ATTAT	2	10	23706	23715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009466	AC	3	6	23727	23732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_009466	TAA	2	6	23769	23774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009466	T	6	6	23775	23780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009466	CAT	2	6	23829	23834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_009466	TA	3	6	23876	23881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009466	GA	3	6	23918	23923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009466	A	6	6	23946	23951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009466	TA	3	6	23968	23973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009466	TAA	2	6	23979	23984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009466	ATA	2	6	23988	23993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009466	AGA	2	6	24021	24026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245146
609	NC_009466	ACTT	2	8	24044	24051	25 %	50 %	0 %	25 %	148245146
610	NC_009466	GAA	2	6	24055	24060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245146
611	NC_009466	TAAA	2	8	24083	24090	75 %	25 %	0 %	0 %	148245146
612	NC_009466	GAA	2	6	24106	24111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245146
613	NC_009466	GTT	2	6	24187	24192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245146
614	NC_009466	ATG	2	6	24311	24316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245146
615	NC_009466	TA	3	6	24387	24392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009466	ATAC	2	8	24405	24412	50 %	25 %	0 %	25 %	148245147
617	NC_009466	TAA	2	6	24416	24421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245147
618	NC_009466	A	6	6	24420	24425	100 %	0 %	0 %	0 %	148245147
619	NC_009466	TCT	2	6	24451	24456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245147
620	NC_009466	AATT	2	8	24471	24478	50 %	50 %	0 %	0 %	148245147
621	NC_009466	GTA	2	6	24486	24491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245147
622	NC_009466	ATAAA	2	10	24507	24516	80 %	20 %	0 %	0 %	148245147
623	NC_009466	ATT	3	9	24607	24615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245147
624	NC_009466	TG	3	6	24641	24646	0 %	50 %	50 %	0 %	148245147
625	NC_009466	TAT	2	6	24672	24677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245147
626	NC_009466	TCA	2	6	24734	24739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245147
627	NC_009466	TCC	2	6	24797	24802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_009466	AT	3	6	24807	24812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009466	A	6	6	24814	24819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009466	TA	3	6	24915	24920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009466	CAT	2	6	24935	24940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245148
632	NC_009466	TA	3	6	24948	24953	50 %	50 %	0 %	0 %	148245148
633	NC_009466	CTT	2	6	24959	24964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245148
634	NC_009466	ACG	2	6	24975	24980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245148
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636	NC_009466	TA	4	8	25073	25080	50 %	50 %	0 %	0 %	148245148
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