MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 2727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	TTAAA	2	10	211	220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009437	GTCAT	2	10	3103	3112	20 %	40 %	20 %	20 %	146295087
3	NC_009437	TACAT	2	10	3238	3247	40 %	40 %	0 %	20 %	146295087
4	NC_009437	ATTTT	2	10	4733	4742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009437	AAGGC	2	10	7515	7524	40 %	0 %	40 %	20 %	146295091
6	NC_009437	AAAAG	2	10	8132	8141	80 %	0 %	20 %	0 %	146295091
7	NC_009437	TGGAA	2	10	8804	8813	40 %	20 %	40 %	0 %	146295091
8	NC_009437	AAAAC	2	10	8892	8901	80 %	0 %	0 %	20 %	146295091
9	NC_009437	AGCCA	2	10	9510	9519	40 %	0 %	20 %	40 %	146295092
10	NC_009437	GGCAG	2	10	10525	10534	20 %	0 %	60 %	20 %	146295092
11	NC_009437	GTTTT	2	10	11183	11192	0 %	80 %	20 %	0 %	146295092
12	NC_009437	TTTTA	2	10	11695	11704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009437	AAGAG	2	10	13901	13910	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009437	GTTAA	2	10	13978	13987	40 %	40 %	20 %	0 %	146295095
15	NC_009437	CAAAT	2	10	15061	15070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009437	TTTGC	2	10	15838	15847	0 %	60 %	20 %	20 %	146295096
17	NC_009437	CACAA	2	10	19060	19069	60 %	0 %	0 %	40 %	146295099
18	NC_009437	GATAA	2	10	20710	20719	60 %	20 %	20 %	0 %	146295099
19	NC_009437	TTAAA	2	10	22842	22851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009437	AAGGA	2	10	23429	23438	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009437	TTTGA	2	10	23710	23719	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009437	GACAA	2	10	25865	25874	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009437	TAAAA	2	10	29805	29814	80 %	20 %	0 %	0 %	146295102
24	NC_009437	TTTTC	2	10	30214	30223	0 %	80 %	0 %	20 %	146295103
25	NC_009437	GATAA	2	10	30594	30603	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009437	ATTTT	2	10	34190	34199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009437	TTTGA	2	10	35563	35572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009437	ATAAA	2	10	36539	36548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009437	AAGAT	2	10	36580	36589	60 %	20 %	20 %	0 %	146295109
30	NC_009437	CTTTC	2	10	37412	37421	0 %	60 %	0 %	40 %	146295109
31	NC_009437	AACAT	2	10	39322	39331	60 %	20 %	0 %	20 %	146295111
32	NC_009437	ATAAA	2	10	39542	39551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009437	CAAGC	2	10	40232	40241	40 %	0 %	20 %	40 %	146295112
34	NC_009437	CTCTT	2	10	42508	42517	0 %	60 %	0 %	40 %	146295115
35	NC_009437	TTCAT	2	10	42691	42700	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009437	GATAT	2	10	43035	43044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009437	GGATG	2	10	43136	43145	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009437	ATAAA	2	10	43164	43173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009437	TGTAG	2	10	43228	43237	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009437	TTGAT	2	10	45855	45864	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009437	AGAAA	2	10	47161	47170	80 %	0 %	20 %	0 %	146295119
42	NC_009437	TATTT	2	10	47201	47210	20 %	80 %	0 %	0 %	146295119
43	NC_009437	ATGAT	2	10	48455	48464	40 %	40 %	20 %	0 %	146295120
44	NC_009437	TATAA	2	10	48889	48898	60 %	40 %	0 %	0 %	146295120
45	NC_009437	AAACA	2	10	50344	50353	80 %	0 %	0 %	20 %	146295121
46	NC_009437	GCTTA	2	10	50366	50375	20 %	40 %	20 %	20 %	146295121
47	NC_009437	TGAAA	2	10	51502	51511	60 %	20 %	20 %	0 %	146295122
48	NC_009437	GCTTG	2	10	52251	52260	0 %	40 %	40 %	20 %	146295123
49	NC_009437	AAATT	2	10	54103	54112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009437	ATAAC	2	10	54153	54162	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009437	AAGGA	2	10	55902	55911	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009437	TGAAG	2	10	56335	56344	40 %	20 %	40 %	0 %	146295125
53	NC_009437	TAAAA	2	10	57868	57877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009437	GCTTT	2	10	59775	59784	0 %	60 %	20 %	20 %	146295129
55	NC_009437	ACAGA	2	10	62464	62473	60 %	0 %	20 %	20 %	146295130
56	NC_009437	TGCTT	2	10	62750	62759	0 %	60 %	20 %	20 %	146295130
57	NC_009437	AAAAT	2	10	63714	63723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009437	GTGAG	2	10	63743	63752	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009437	ATCTT	2	10	64634	64643	20 %	60 %	0 %	20 %	146295131
60	NC_009437	AGACT	2	10	66364	66373	40 %	20 %	20 %	20 %	146295132
61	NC_009437	GAGTA	2	10	66475	66484	40 %	20 %	40 %	0 %	146295132
62	NC_009437	CTATG	2	10	67662	67671	20 %	40 %	20 %	20 %	146295134
63	NC_009437	TAAAA	2	10	68965	68974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009437	CTACA	2	10	71716	71725	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_009437	TTTTA	2	10	71779	71788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009437	TTCTC	2	10	72058	72067	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009437	CATAA	2	10	74816	74825	60 %	20 %	0 %	20 %	146295140
68	NC_009437	CTCTT	2	10	79797	79806	0 %	60 %	0 %	40 %	146295145
69	NC_009437	CTTGC	2	10	79868	79877	0 %	40 %	20 %	40 %	146295145
70	NC_009437	GGAGT	2	10	83040	83049	20 %	20 %	60 %	0 %	146295149
71	NC_009437	TCAGA	2	10	85528	85537	40 %	20 %	20 %	20 %	146295150
72	NC_009437	AAAGC	2	10	85607	85616	60 %	0 %	20 %	20 %	146295150
73	NC_009437	AGATG	2	10	86229	86238	40 %	20 %	40 %	0 %	146295151
74	NC_009437	AAGTT	2	10	86489	86498	40 %	40 %	20 %	0 %	146295151
75	NC_009437	AAAAG	2	10	87485	87494	80 %	0 %	20 %	0 %	146295152
76	NC_009437	TCATT	2	10	88841	88850	20 %	60 %	0 %	20 %	146295154
77	NC_009437	TTTTA	2	10	90265	90274	20 %	80 %	0 %	0 %	146295156
78	NC_009437	TCTGC	2	10	91327	91336	0 %	40 %	20 %	40 %	146295157
79	NC_009437	CTCTT	2	10	91393	91402	0 %	60 %	0 %	40 %	146295157
80	NC_009437	TTATG	2	10	92154	92163	20 %	60 %	20 %	0 %	146295157
81	NC_009437	GGGAA	2	10	92227	92236	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009437	CTTTC	2	10	92591	92600	0 %	60 %	0 %	40 %	146295158
83	NC_009437	GTATT	2	10	94143	94152	20 %	60 %	20 %	0 %	146295161
84	NC_009437	AAAAC	2	10	94787	94796	80 %	0 %	0 %	20 %	146295161
85	NC_009437	GTTCT	2	10	94992	95001	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009437	AAGAA	2	10	95032	95041	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009437	TCTTT	2	10	97216	97225	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009437	GAAGG	2	10	101020	101029	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009437	GCTTC	2	10	102248	102257	0 %	40 %	20 %	40 %	146295170
90	NC_009437	CAAAC	2	10	103194	103203	60 %	0 %	0 %	40 %	146295170
91	NC_009437	TTTCT	2	10	104732	104741	0 %	80 %	0 %	20 %	146295171
92	NC_009437	AAACA	2	10	106138	106147	80 %	0 %	0 %	20 %	146295172
93	NC_009437	GCTTA	2	10	106160	106169	20 %	40 %	20 %	20 %	146295172
94	NC_009437	AGTAG	2	10	107373	107382	40 %	20 %	40 %	0 %	146295173
95	NC_009437	CAAAA	2	10	107625	107634	80 %	0 %	0 %	20 %	146295174
96	NC_009437	CAAAG	2	10	109398	109407	60 %	0 %	20 %	20 %	146295177
97	NC_009437	TTCCA	2	10	109902	109911	20 %	40 %	0 %	40 %	146295178
98	NC_009437	CAAGA	2	10	110885	110894	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009437	TTACC	2	10	111063	111072	20 %	40 %	0 %	40 %	146295179
100	NC_009437	AATTA	2	10	111937	111946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009437	AGGAG	2	10	114536	114545	40 %	0 %	60 %	0 %	346722698
102	NC_009437	AAAAG	2	10	114873	114882	80 %	0 %	20 %	0 %	146295185
103	NC_009437	ATTTT	2	10	115081	115090	20 %	80 %	0 %	0 %	146295185
104	NC_009437	AGAGG	2	10	116944	116953	40 %	0 %	60 %	0 %	146295188
105	NC_009437	AAAGA	2	10	117527	117536	80 %	0 %	20 %	0 %	146295188
106	NC_009437	AAAAG	2	10	118722	118731	80 %	0 %	20 %	0 %	146295189
107	NC_009437	ATTTT	2	10	119556	119565	20 %	80 %	0 %	0 %	146295190
108	NC_009437	GTTAA	2	10	119802	119811	40 %	40 %	20 %	0 %	146295190
109	NC_009437	ACAGG	2	10	120347	120356	40 %	0 %	40 %	20 %	146295190
110	NC_009437	CAGAA	2	10	121857	121866	60 %	0 %	20 %	20 %	346722700
111	NC_009437	AGGCA	2	10	123571	123580	40 %	0 %	40 %	20 %	146295194
112	NC_009437	TCCAA	2	10	124263	124272	40 %	20 %	0 %	40 %	146295194
113	NC_009437	ATGGC	2	10	125123	125132	20 %	20 %	40 %	20 %	146295195
114	NC_009437	GCAAA	2	10	126066	126075	60 %	0 %	20 %	20 %	146295195
115	NC_009437	CAATA	2	10	126972	126981	60 %	20 %	0 %	20 %	146295197
116	NC_009437	CCTGC	2	10	129403	129412	0 %	20 %	20 %	60 %	146295198
117	NC_009437	CATGG	2	10	130547	130556	20 %	20 %	40 %	20 %	146295199
118	NC_009437	TTGCA	2	10	132276	132285	20 %	40 %	20 %	20 %	146295200
119	NC_009437	ACTCA	2	10	133218	133227	40 %	20 %	0 %	40 %	146295201
120	NC_009437	GTTTT	2	10	133609	133618	0 %	80 %	20 %	0 %	146295202
121	NC_009437	AAAAT	2	10	136038	136047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009437	CATGG	2	10	141093	141102	20 %	20 %	40 %	20 %	146295207
123	NC_009437	TGAAT	2	10	143687	143696	40 %	40 %	20 %	0 %	146295208
124	NC_009437	GAAGA	2	10	144686	144695	60 %	0 %	40 %	0 %	146295209
125	NC_009437	TGATG	2	10	145286	145295	20 %	40 %	40 %	0 %	146295210
126	NC_009437	ATGAT	2	10	145586	145595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009437	ACAGA	2	10	145641	145650	60 %	0 %	20 %	20 %	146295211
128	NC_009437	TGCTT	2	10	145927	145936	0 %	60 %	20 %	20 %	146295211
129	NC_009437	ATGGT	2	10	147346	147355	20 %	40 %	40 %	0 %	146295213
130	NC_009437	TATTT	2	10	148096	148105	20 %	80 %	0 %	0 %	146295214
131	NC_009437	TCAGG	2	10	148974	148983	20 %	20 %	40 %	20 %	346722704
132	NC_009437	GCTTT	2	10	151303	151312	0 %	60 %	20 %	20 %	146295217
133	NC_009437	TTTAC	2	10	151482	151491	20 %	60 %	0 %	20 %	146295217
134	NC_009437	TCAGC	2	10	152724	152733	20 %	20 %	20 %	40 %	146295218
135	NC_009437	ATTTT	2	10	154018	154027	20 %	80 %	0 %	0 %	146295220
136	NC_009437	AATAA	2	10	154981	154990	80 %	20 %	0 %	0 %	146295221
137	NC_009437	ATTAA	2	10	155651	155660	60 %	40 %	0 %	0 %	146295221
138	NC_009437	TCTTT	2	10	155937	155946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009437	TATCT	2	10	156755	156764	20 %	60 %	0 %	20 %	146295223
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