MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 7599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	TTGA	2	8	82	89	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009437	TTAC	2	8	607	614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009437	TACA	2	8	617	624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009437	ATGC	2	8	1131	1138	25 %	25 %	25 %	25 %	146295086
5	NC_009437	ATGT	2	8	1182	1189	25 %	50 %	25 %	0 %	146295086
6	NC_009437	TTGA	2	8	1284	1291	25 %	50 %	25 %	0 %	146295086
7	NC_009437	AAAG	2	8	1314	1321	75 %	0 %	25 %	0 %	146295086
8	NC_009437	TTTA	2	8	2176	2183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009437	CTTC	2	8	2464	2471	0 %	50 %	0 %	50 %	146295087
10	NC_009437	ATCT	2	8	3295	3302	25 %	50 %	0 %	25 %	146295087
11	NC_009437	AATA	2	8	3657	3664	75 %	25 %	0 %	0 %	146295088
12	NC_009437	CAGC	2	8	4056	4063	25 %	0 %	25 %	50 %	146295088
13	NC_009437	TGCA	2	8	4191	4198	25 %	25 %	25 %	25 %	146295088
14	NC_009437	ATAA	2	8	4384	4391	75 %	25 %	0 %	0 %	146295088
15	NC_009437	AAGC	2	8	6159	6166	50 %	0 %	25 %	25 %	346722695
16	NC_009437	CTTT	2	8	6327	6334	0 %	75 %	0 %	25 %	346722695
17	NC_009437	CAAC	2	8	7724	7731	50 %	0 %	0 %	50 %	146295091
18	NC_009437	AGGC	2	8	8442	8449	25 %	0 %	50 %	25 %	146295091
19	NC_009437	TTGA	2	8	8649	8656	25 %	50 %	25 %	0 %	146295091
20	NC_009437	GCGA	2	8	8817	8824	25 %	0 %	50 %	25 %	146295091
21	NC_009437	CTTT	2	8	9188	9195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009437	TTTC	2	8	9374	9381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009437	AAAC	2	8	9713	9720	75 %	0 %	0 %	25 %	146295092
24	NC_009437	CAAA	2	8	9989	9996	75 %	0 %	0 %	25 %	146295092
25	NC_009437	GTTT	2	8	10036	10043	0 %	75 %	25 %	0 %	146295092
26	NC_009437	ATCT	2	8	10190	10197	25 %	50 %	0 %	25 %	146295092
27	NC_009437	CTGC	2	8	10441	10448	0 %	25 %	25 %	50 %	146295092
28	NC_009437	GATG	2	8	10584	10591	25 %	25 %	50 %	0 %	146295092
29	NC_009437	TTTG	2	8	11076	11083	0 %	75 %	25 %	0 %	146295092
30	NC_009437	CTGC	2	8	13126	13133	0 %	25 %	25 %	50 %	146295094
31	NC_009437	GGAA	2	8	13511	13518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009437	AAAG	2	8	13850	13857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009437	TAAT	2	8	14284	14291	50 %	50 %	0 %	0 %	146295095
34	NC_009437	ATAA	2	8	15426	15433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009437	GGCA	2	8	16210	16217	25 %	0 %	50 %	25 %	146295096
36	NC_009437	AATA	2	8	16358	16365	75 %	25 %	0 %	0 %	146295096
37	NC_009437	TAAA	2	8	16820	16827	75 %	25 %	0 %	0 %	146295097
38	NC_009437	AAAC	2	8	17598	17605	75 %	0 %	0 %	25 %	146295097
39	NC_009437	GTTT	2	8	18126	18133	0 %	75 %	25 %	0 %	146295098
40	NC_009437	TAAA	2	8	18795	18802	75 %	25 %	0 %	0 %	146295099
41	NC_009437	ATTG	2	8	18822	18829	25 %	50 %	25 %	0 %	146295099
42	NC_009437	GTCT	2	8	20700	20707	0 %	50 %	25 %	25 %	146295099
43	NC_009437	TCAA	2	8	21216	21223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009437	ATGT	2	8	21247	21254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009437	ATTT	2	8	21281	21288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009437	TAGT	2	8	21672	21679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009437	CTTC	2	8	21836	21843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009437	ACAA	2	8	22362	22369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009437	CAAA	2	8	22583	22590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009437	ATTA	2	8	22726	22733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009437	AATT	2	8	23052	23059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009437	AAAC	2	8	23186	23193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009437	AGCA	2	8	23866	23873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009437	TGTA	2	8	24218	24225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009437	AATT	2	8	24669	24676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009437	TATT	2	8	25924	25931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009437	AAAG	2	8	26883	26890	75 %	0 %	25 %	0 %	146295101
58	NC_009437	TACT	2	8	27373	27380	25 %	50 %	0 %	25 %	146295101
59	NC_009437	TAAA	2	8	27763	27770	75 %	25 %	0 %	0 %	146295101
60	NC_009437	CAGA	2	8	27771	27778	50 %	0 %	25 %	25 %	146295101
61	NC_009437	AAAT	2	8	28229	28236	75 %	25 %	0 %	0 %	146295101
62	NC_009437	AAAG	2	8	28466	28473	75 %	0 %	25 %	0 %	146295101
63	NC_009437	AAAG	2	8	29471	29478	75 %	0 %	25 %	0 %	146295101
64	NC_009437	AAGT	2	8	29547	29554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009437	AAAT	2	8	29795	29802	75 %	25 %	0 %	0 %	146295102
66	NC_009437	GATT	2	8	31335	31342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009437	ATTT	2	8	31900	31907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009437	GAAA	2	8	32050	32057	75 %	0 %	25 %	0 %	146295106
69	NC_009437	TTTG	2	8	32766	32773	0 %	75 %	25 %	0 %	146295106
70	NC_009437	TTTG	2	8	33666	33673	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009437	TTCT	2	8	33981	33988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009437	ACAA	2	8	34225	34232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009437	ATGA	2	8	34260	34267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009437	GTTG	2	8	34285	34292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009437	TTGG	2	8	34518	34525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009437	AAAC	2	8	35037	35044	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009437	GAAA	2	8	35172	35179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009437	AGCA	2	8	35719	35726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009437	GTAT	2	8	35966	35973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009437	TGTA	2	8	36071	36078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009437	GGTG	2	8	36268	36275	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009437	TTGA	2	8	36300	36307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009437	AAAT	2	8	36464	36471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009437	TTGA	2	8	36708	36715	25 %	50 %	25 %	0 %	146295109
85	NC_009437	GAGT	2	8	37148	37155	25 %	25 %	50 %	0 %	146295109
86	NC_009437	AGAT	2	8	37345	37352	50 %	25 %	25 %	0 %	146295109
87	NC_009437	GGAA	2	8	37443	37450	50 %	0 %	50 %	0 %	146295109
88	NC_009437	TTTG	2	8	38004	38011	0 %	75 %	25 %	0 %	146295110
89	NC_009437	GCTT	2	8	38247	38254	0 %	50 %	25 %	25 %	146295110
90	NC_009437	ATTT	2	8	38537	38544	25 %	75 %	0 %	0 %	146295111
91	NC_009437	ATTT	2	8	38684	38691	25 %	75 %	0 %	0 %	146295111
92	NC_009437	ATTT	2	8	38717	38724	25 %	75 %	0 %	0 %	146295111
93	NC_009437	AAAT	2	8	39583	39590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009437	CAGA	2	8	40055	40062	50 %	0 %	25 %	25 %	146295112
95	NC_009437	TTGA	2	8	40443	40450	25 %	50 %	25 %	0 %	146295113
96	NC_009437	TGAA	2	8	40867	40874	50 %	25 %	25 %	0 %	146295113
97	NC_009437	AGCC	2	8	42253	42260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009437	GAAG	2	8	43541	43548	50 %	0 %	50 %	0 %	146295116
99	NC_009437	CTGC	2	8	43628	43635	0 %	25 %	25 %	50 %	146295116
100	NC_009437	AAAG	2	8	44558	44565	75 %	0 %	25 %	0 %	146295116
101	NC_009437	ATGA	2	8	44773	44780	50 %	25 %	25 %	0 %	146295116
102	NC_009437	CAAA	2	8	45365	45372	75 %	0 %	0 %	25 %	146295117
103	NC_009437	TAGA	2	8	45428	45435	50 %	25 %	25 %	0 %	146295117
104	NC_009437	AGGG	2	8	45493	45500	25 %	0 %	75 %	0 %	146295117
105	NC_009437	TTTG	2	8	45871	45878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009437	TAAA	2	8	45888	45895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009437	ATTT	2	8	46075	46082	25 %	75 %	0 %	0 %	146295118
108	NC_009437	TTGC	2	8	46101	46108	0 %	50 %	25 %	25 %	146295118
109	NC_009437	AAAT	2	8	46331	46338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009437	AAAG	2	8	46412	46419	75 %	0 %	25 %	0 %	146295119
111	NC_009437	ATTC	2	8	46710	46717	25 %	50 %	0 %	25 %	146295119
112	NC_009437	TTTG	2	8	46781	46788	0 %	75 %	25 %	0 %	146295119
113	NC_009437	AAGA	2	8	47052	47059	75 %	0 %	25 %	0 %	146295119
114	NC_009437	GAAA	2	8	47177	47184	75 %	0 %	25 %	0 %	146295119
115	NC_009437	CATA	2	8	47250	47257	50 %	25 %	0 %	25 %	146295119
116	NC_009437	GTAC	2	8	48240	48247	25 %	25 %	25 %	25 %	146295120
117	NC_009437	GCAT	2	8	48357	48364	25 %	25 %	25 %	25 %	146295120
118	NC_009437	AAAT	2	8	48422	48429	75 %	25 %	0 %	0 %	146295120
119	NC_009437	GCCA	2	8	48647	48654	25 %	0 %	25 %	50 %	146295120
120	NC_009437	ACAA	2	8	48692	48699	75 %	0 %	0 %	25 %	146295120
121	NC_009437	CAGG	2	8	48768	48775	25 %	0 %	50 %	25 %	146295120
122	NC_009437	TAAA	2	8	48986	48993	75 %	25 %	0 %	0 %	146295120
123	NC_009437	TTTG	2	8	49140	49147	0 %	75 %	25 %	0 %	146295120
124	NC_009437	ATTT	2	8	49383	49390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009437	CATA	2	8	49409	49416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009437	AATA	2	8	49514	49521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009437	TATT	2	8	50578	50585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009437	ATCA	2	8	50632	50639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009437	ACTC	2	8	50868	50875	25 %	25 %	0 %	50 %	146295122
130	NC_009437	CAAA	2	8	51007	51014	75 %	0 %	0 %	25 %	146295122
131	NC_009437	ATTA	2	8	51577	51584	50 %	50 %	0 %	0 %	146295122
132	NC_009437	TATT	2	8	51849	51856	25 %	75 %	0 %	0 %	146295123
133	NC_009437	TAAA	2	8	52124	52131	75 %	25 %	0 %	0 %	146295123
134	NC_009437	TGGC	2	8	52668	52675	0 %	25 %	50 %	25 %	146295123
135	NC_009437	AAGA	2	8	52848	52855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009437	AGCC	2	8	53462	53469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009437	ATAA	2	8	54163	54170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009437	TATT	2	8	54596	54603	25 %	75 %	0 %	0 %	146295124
139	NC_009437	TTGA	2	8	54681	54688	25 %	50 %	25 %	0 %	146295124
140	NC_009437	AAAC	2	8	54793	54800	75 %	0 %	0 %	25 %	146295124
141	NC_009437	TTCA	2	8	54968	54975	25 %	50 %	0 %	25 %	146295124
142	NC_009437	CAGA	2	8	55118	55125	50 %	0 %	25 %	25 %	146295124
143	NC_009437	CAAA	2	8	55260	55267	75 %	0 %	0 %	25 %	146295124
144	NC_009437	GCAG	2	8	55516	55523	25 %	0 %	50 %	25 %	146295124
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