MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Corynebacterium glutamicum R plasmid pCGR1

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009343	GT	3	6	1717	1722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009343	CA	3	6	1955	1960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009343	TG	3	6	3415	3420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009343	TG	4	8	5449	5456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009343	AC	3	6	6211	6216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009343	GT	3	6	6263	6268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009343	TG	3	6	7588	7593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009343	AC	3	6	8256	8261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009343	AC	3	6	9871	9876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009343	CA	3	6	9928	9933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009343	TC	3	6	10054	10059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009343	CA	4	8	10303	10310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009343	CA	3	6	10314	10319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009343	GC	3	6	10598	10603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009343	AC	3	6	12542	12547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009343	AC	3	6	13050	13055	50 %	0 %	0 %	50 %	145297100
17	NC_009343	AC	3	6	14363	14368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009343	CA	3	6	15557	15562	50 %	0 %	0 %	50 %	145297103
19	NC_009343	AC	3	6	18217	18222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009343	CA	4	8	18304	18311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009343	TG	3	6	19361	19366	0 %	50 %	50 %	0 %	145297105
22	NC_009343	GT	3	6	19656	19661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009343	GT	3	6	19900	19905	0 %	50 %	50 %	0 %	145297106
24	NC_009343	TA	3	6	20775	20780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009343	GC	3	6	21056	21061	0 %	0 %	50 %	50 %	145297108
26	NC_009343	CA	4	8	21506	21513	50 %	0 %	0 %	50 %	145297108
27	NC_009343	GT	3	6	22929	22934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009343	TG	3	6	24763	24768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009343	AC	3	6	25053	25058	50 %	0 %	0 %	50 %	145297112
30	NC_009343	AC	3	6	25354	25359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009343	CA	3	6	28873	28878	50 %	0 %	0 %	50 %	145297113
32	NC_009343	AT	3	6	30342	30347	50 %	50 %	0 %	0 %	145297113
33	NC_009343	GT	3	6	31274	31279	0 %	50 %	50 %	0 %	145297113
34	NC_009343	GT	3	6	32029	32034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009343	GT	3	6	32928	32933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009343	GT	3	6	33291	33296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009343	CA	3	6	35305	35310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009343	CA	3	6	35410	35415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009343	CA	3	6	35836	35841	50 %	0 %	0 %	50 %	145297115
40	NC_009343	CA	3	6	36582	36587	50 %	0 %	0 %	50 %	145297117
41	NC_009343	CA	3	6	38410	38415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009343	CA	3	6	38449	38454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009343	TG	3	6	38730	38735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009343	GA	3	6	39067	39072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009343	TG	3	6	40188	40193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009343	CA	3	6	40500	40505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009343	CA	3	6	40527	40532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009343	AC	3	6	40704	40709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009343	AC	3	6	41080	41085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009343	AC	3	6	41203	41208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009343	CT	3	6	41423	41428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009343	CA	3	6	42073	42078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009343	AC	3	6	42970	42975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009343	AC	3	6	43557	43562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009343	GC	3	6	45144	45149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009343	CA	3	6	46202	46207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009343	GC	3	6	47252	47257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009343	AC	3	6	47638	47643	50 %	0 %	0 %	50 %	145297122
59	NC_009343	GT	3	6	48486	48491	0 %	50 %	50 %	0 %	145297123
60	NC_009343	GT	3	6	48654	48659	0 %	50 %	50 %	0 %	145297123

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.