MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Corynebacterium glutamicum R plasmid pCGR1

Total Repeats: 926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009343	TGA	2	6	25654	25659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009343	CCA	2	6	25686	25691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_009343	TCC	2	6	25751	25756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_009343	AAGC	2	8	25767	25774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_009343	GCA	2	6	25844	25849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_009343	GAA	2	6	26075	26080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009343	GCA	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_009343	TCT	2	6	26170	26175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297113
509	NC_009343	TTGG	2	8	26335	26342	0 %	50 %	50 %	0 %	145297113
510	NC_009343	TGG	3	9	26340	26348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
511	NC_009343	GCA	2	6	26398	26403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
512	NC_009343	GTG	3	9	26411	26419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
513	NC_009343	GCA	2	6	26467	26472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
514	NC_009343	GAT	2	6	26485	26490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297113
515	NC_009343	CGC	2	6	26583	26588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297113
516	NC_009343	TGG	2	6	26685	26690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
517	NC_009343	TCAGGC	2	12	26740	26751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145297113
518	NC_009343	TTG	2	6	26789	26794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297113
519	NC_009343	CAT	2	6	26847	26852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297113
520	NC_009343	ACC	2	6	26861	26866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
521	NC_009343	GCA	4	12	26872	26883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
522	NC_009343	CCA	2	6	26969	26974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
523	NC_009343	GGGC	2	8	26984	26991	0 %	0 %	75 %	25 %	145297113
524	NC_009343	GTG	2	6	27008	27013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
525	NC_009343	GCA	2	6	27181	27186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
526	NC_009343	CAG	2	6	27187	27192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
527	NC_009343	CCA	2	6	27215	27220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
528	NC_009343	GCA	2	6	27244	27249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
529	NC_009343	AGC	2	6	27330	27335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
530	NC_009343	TGG	2	6	27415	27420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
531	NC_009343	ACA	2	6	27476	27481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297113
532	NC_009343	GCAG	2	8	27488	27495	25 %	0 %	50 %	25 %	145297113
533	NC_009343	CGAC	2	8	27518	27525	25 %	0 %	25 %	50 %	145297113
534	NC_009343	ACG	2	6	27605	27610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
535	NC_009343	TGT	2	6	27642	27647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297113
536	NC_009343	CCA	2	6	27650	27655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
537	NC_009343	GCT	2	6	27747	27752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297113
538	NC_009343	CCG	2	6	27857	27862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297113
539	NC_009343	TCG	2	6	27905	27910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297113
540	NC_009343	CTC	2	6	27919	27924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297113
541	NC_009343	ACC	2	6	27979	27984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
542	NC_009343	GAA	2	6	27991	27996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297113
543	NC_009343	ATT	2	6	28162	28167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145297113
544	NC_009343	ACA	2	6	28241	28246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297113
545	NC_009343	TGA	2	6	28248	28253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297113
546	NC_009343	CCG	2	6	28260	28265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297113
547	NC_009343	TCA	2	6	28364	28369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297113
548	NC_009343	AGA	2	6	28374	28379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297113
549	NC_009343	GGA	2	6	28457	28462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145297113
550	NC_009343	GAA	2	6	28543	28548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297113
551	NC_009343	CAT	2	6	28572	28577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297113
552	NC_009343	GGT	2	6	28669	28674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
553	NC_009343	TGAC	2	8	28688	28695	25 %	25 %	25 %	25 %	145297113
554	NC_009343	TTG	3	9	28832	28840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297113
555	NC_009343	TGG	2	6	28843	28848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
556	NC_009343	GGT	2	6	28855	28860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
557	NC_009343	CA	3	6	28873	28878	50 %	0 %	0 %	50 %	145297113
558	NC_009343	TGG	2	6	28944	28949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
559	NC_009343	GGT	2	6	29008	29013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
560	NC_009343	GAT	2	6	29035	29040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297113
561	NC_009343	TGGCGG	2	12	29064	29075	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145297113
562	NC_009343	GTC	2	6	29100	29105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297113
563	NC_009343	TGG	2	6	29106	29111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
564	NC_009343	TGCAGG	2	12	29147	29158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145297113
565	NC_009343	AGC	2	6	29234	29239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
566	NC_009343	AGC	2	6	29286	29291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
567	NC_009343	CAA	2	6	29292	29297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297113
568	NC_009343	AAG	2	6	29435	29440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297113
569	NC_009343	GAA	2	6	29464	29469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297113
570	NC_009343	TGCCCG	2	12	29550	29561	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145297113
571	NC_009343	A	6	6	29576	29581	100 %	0 %	0 %	0 %	145297113
572	NC_009343	A	6	6	29639	29644	100 %	0 %	0 %	0 %	145297113
573	NC_009343	AGC	2	6	29649	29654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
574	NC_009343	CAA	2	6	29721	29726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297113
575	NC_009343	CTT	2	6	29728	29733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297113
576	NC_009343	CGA	2	6	29811	29816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
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578	NC_009343	TCC	2	6	29959	29964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297113
579	NC_009343	GATG	2	8	30033	30040	25 %	25 %	50 %	0 %	145297113
580	NC_009343	CAT	2	6	30105	30110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297113
581	NC_009343	AAACGC	2	12	30186	30197	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145297113
582	NC_009343	GCG	2	6	30247	30252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297113
583	NC_009343	GCA	2	6	30258	30263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
584	NC_009343	AT	3	6	30342	30347	50 %	50 %	0 %	0 %	145297113
585	NC_009343	CCG	2	6	30374	30379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297113
586	NC_009343	GCA	3	9	30388	30396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
587	NC_009343	CAC	2	6	30426	30431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
588	NC_009343	GCA	2	6	30553	30558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
589	NC_009343	GCA	3	9	30580	30588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
590	NC_009343	ATG	2	6	30617	30622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297113
591	NC_009343	TGG	2	6	30723	30728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
592	NC_009343	GTG	2	6	30740	30745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
593	NC_009343	TGA	2	6	30783	30788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297113
594	NC_009343	CAG	2	6	30802	30807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
595	NC_009343	A	6	6	30925	30930	100 %	0 %	0 %	0 %	145297113
596	NC_009343	GCA	2	6	31041	31046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
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598	NC_009343	GTGG	2	8	31138	31145	0 %	25 %	75 %	0 %	145297113
599	NC_009343	TGG	2	6	31194	31199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
600	NC_009343	ATC	2	6	31239	31244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297113
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602	NC_009343	GT	3	6	31274	31279	0 %	50 %	50 %	0 %	145297113
603	NC_009343	GTG	2	6	31283	31288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
604	NC_009343	GGT	3	9	31311	31319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
605	NC_009343	ACC	2	6	31339	31344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
606	NC_009343	TCG	2	6	31390	31395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297113
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608	NC_009343	A	8	8	31634	31641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009343	GCA	2	6	31679	31684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_009343	ACT	2	6	31845	31850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009343	CGT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009343	CCCG	2	8	31963	31970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
613	NC_009343	CAT	2	6	31987	31992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_009343	GT	3	6	32029	32034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009343	ATC	2	6	32160	32165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_009343	ATCA	2	8	32183	32190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_009343	CAC	2	6	32191	32196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_009343	TTG	2	6	32221	32226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009343	ACC	2	6	32249	32254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_009343	CGCAA	2	10	32595	32604	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
621	NC_009343	TGG	2	6	32745	32750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009343	TCC	2	6	32873	32878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_009343	GT	3	6	32928	32933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009343	C	6	6	33064	33069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
625	NC_009343	TTG	2	6	33161	33166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009343	GGA	2	6	33169	33174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009343	TTA	2	6	33187	33192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_009343	ACA	2	6	33253	33258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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