MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlorobium phaeovibrioides DSM 265 chromosome

Total Repeats: 1202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009337	GAAAA	2	10	776	785	80 %	0 %	20 %	0 %	145218823
2	NC_009337	CGAAG	2	10	1915	1924	40 %	0 %	40 %	20 %	145218824
3	NC_009337	GAACT	2	10	4267	4276	40 %	20 %	20 %	20 %	145218826
4	NC_009337	TTTTA	2	10	5456	5465	20 %	80 %	0 %	0 %	145218827
5	NC_009337	TCTCC	2	10	7133	7142	0 %	40 %	0 %	60 %	145218828
6	NC_009337	ATCTT	2	10	9313	9322	20 %	60 %	0 %	20 %	145218829
7	NC_009337	TCAGC	2	10	12151	12160	20 %	20 %	20 %	40 %	145218831
8	NC_009337	ATGCC	2	10	15688	15697	20 %	20 %	20 %	40 %	145218834
9	NC_009337	GGGAA	2	10	16125	16134	40 %	0 %	60 %	0 %	145218834
10	NC_009337	CTTTC	2	10	17058	17067	0 %	60 %	0 %	40 %	145218835
11	NC_009337	CCTTC	2	10	18857	18866	0 %	40 %	0 %	60 %	145218836
12	NC_009337	GCGGA	2	10	20158	20167	20 %	0 %	60 %	20 %	145218838
13	NC_009337	AGCTC	2	10	25484	25493	20 %	20 %	20 %	40 %	145218842
14	NC_009337	CGTAT	2	10	25938	25947	20 %	40 %	20 %	20 %	145218842
15	NC_009337	TCAAA	2	10	26474	26483	60 %	20 %	0 %	20 %	145218843
16	NC_009337	TTCTG	2	10	27574	27583	0 %	60 %	20 %	20 %	145218844
17	NC_009337	TCCTG	2	10	29778	29787	0 %	40 %	20 %	40 %	145218847
18	NC_009337	CGGAG	2	10	30283	30292	20 %	0 %	60 %	20 %	145218847
19	NC_009337	GCTCT	2	10	30980	30989	0 %	40 %	20 %	40 %	145218848
20	NC_009337	CAACA	2	10	33478	33487	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009337	TGTTT	2	10	33644	33653	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009337	ATATA	2	10	33676	33685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009337	TACGG	2	10	34466	34475	20 %	20 %	40 %	20 %	145218850
24	NC_009337	GTTAT	2	10	35568	35577	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009337	GGGGC	2	10	36747	36756	0 %	0 %	80 %	20 %	145218852
26	NC_009337	GTTCG	2	10	36796	36805	0 %	40 %	40 %	20 %	145218852
27	NC_009337	GGGCC	2	10	39297	39306	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009337	CGATC	2	10	39888	39897	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009337	GCACC	2	10	40723	40732	20 %	0 %	20 %	60 %	145218853
30	NC_009337	AATCC	2	10	47279	47288	40 %	20 %	0 %	40 %	145218862
31	NC_009337	TTCCC	2	10	51161	51170	0 %	40 %	0 %	60 %	145218868
32	NC_009337	GGAGA	2	10	56707	56716	40 %	0 %	60 %	0 %	145218874
33	NC_009337	TGTAT	2	10	57998	58007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009337	TCCGC	2	10	59413	59422	0 %	20 %	20 %	60 %	145218876
35	NC_009337	GGCTC	2	10	59641	59650	0 %	20 %	40 %	40 %	145218876
36	NC_009337	TTCTC	2	10	59725	59734	0 %	60 %	0 %	40 %	145218876
37	NC_009337	TGGCC	2	10	60481	60490	0 %	20 %	40 %	40 %	145218877
38	NC_009337	GCCCC	2	10	61326	61335	0 %	0 %	20 %	80 %	145218877
39	NC_009337	CAGGG	2	10	62780	62789	20 %	0 %	60 %	20 %	145218879
40	NC_009337	CCTCA	2	10	67407	67416	20 %	20 %	0 %	60 %	145218882
41	NC_009337	GACAA	2	10	67570	67579	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009337	TTTCG	2	10	68884	68893	0 %	60 %	20 %	20 %	145218883
43	NC_009337	GAGCC	2	10	70176	70185	20 %	0 %	40 %	40 %	145218885
44	NC_009337	GGGAA	2	10	70502	70511	40 %	0 %	60 %	0 %	145218885
45	NC_009337	ACTCC	2	10	70579	70588	20 %	20 %	0 %	60 %	145218885
46	NC_009337	AGGCA	2	10	71434	71443	40 %	0 %	40 %	20 %	145218885
47	NC_009337	CTTTT	2	10	72131	72140	0 %	80 %	0 %	20 %	145218885
48	NC_009337	GCCCG	2	10	74612	74621	0 %	0 %	40 %	60 %	145218886
49	NC_009337	TTTCT	2	10	75585	75594	0 %	80 %	0 %	20 %	145218886
50	NC_009337	CAGTC	2	10	79844	79853	20 %	20 %	20 %	40 %	145218890
51	NC_009337	CTGAA	2	10	83732	83741	40 %	20 %	20 %	20 %	145218892
52	NC_009337	TGCTT	2	10	83969	83978	0 %	60 %	20 %	20 %	145218893
53	NC_009337	GATAT	2	10	84774	84783	40 %	40 %	20 %	0 %	145218893
54	NC_009337	TGCAT	2	10	85565	85574	20 %	40 %	20 %	20 %	145218893
55	NC_009337	CGTTC	2	10	86548	86557	0 %	40 %	20 %	40 %	145218893
56	NC_009337	TGCAA	2	10	87833	87842	40 %	20 %	20 %	20 %	145218893
57	NC_009337	ATCCG	2	10	88239	88248	20 %	20 %	20 %	40 %	145218893
58	NC_009337	CCGTG	2	10	94030	94039	0 %	20 %	40 %	40 %	145218896
59	NC_009337	AATAG	2	10	96951	96960	60 %	20 %	20 %	0 %	145218899
60	NC_009337	TCTCT	2	10	97215	97224	0 %	60 %	0 %	40 %	145218899
61	NC_009337	ATATA	2	10	98000	98009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009337	TTTTC	2	10	99092	99101	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009337	TCCTC	2	10	99225	99234	0 %	40 %	0 %	60 %	145218901
64	NC_009337	TCGTC	2	10	102477	102486	0 %	40 %	20 %	40 %	145218902
65	NC_009337	ATCCC	2	10	102898	102907	20 %	20 %	0 %	60 %	145218903
66	NC_009337	GAATC	2	10	109097	109106	40 %	20 %	20 %	20 %	145218909
67	NC_009337	CAGCG	2	10	113474	113483	20 %	0 %	40 %	40 %	145218912
68	NC_009337	CGCTC	2	10	113695	113704	0 %	20 %	20 %	60 %	145218912
69	NC_009337	ACTCC	2	10	114370	114379	20 %	20 %	0 %	60 %	145218912
70	NC_009337	TTCGC	2	10	114899	114908	0 %	40 %	20 %	40 %	145218912
71	NC_009337	CATGG	2	10	115051	115060	20 %	20 %	40 %	20 %	145218912
72	NC_009337	CAATG	2	10	117844	117853	40 %	20 %	20 %	20 %	145218912
73	NC_009337	AGAAA	2	10	118095	118104	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009337	AAACG	2	10	123142	123151	60 %	0 %	20 %	20 %	145218917
75	NC_009337	GTATG	2	10	123345	123354	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009337	TTTCA	2	10	128988	128997	20 %	60 %	0 %	20 %	145218924
77	NC_009337	ATGCA	2	10	130639	130648	40 %	20 %	20 %	20 %	145218926
78	NC_009337	TATGT	2	10	135438	135447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009337	GGTGA	2	10	136991	137000	20 %	20 %	60 %	0 %	145218934
80	NC_009337	CCTGT	2	10	141688	141697	0 %	40 %	20 %	40 %	145218941
81	NC_009337	CTTGC	2	10	142291	142300	0 %	40 %	20 %	40 %	145218941
82	NC_009337	CGGTG	2	10	145940	145949	0 %	20 %	60 %	20 %	145218946
83	NC_009337	TTCAA	2	10	147280	147289	40 %	40 %	0 %	20 %	145218947
84	NC_009337	GCATT	2	10	150280	150289	20 %	40 %	20 %	20 %	145218949
85	NC_009337	CTGCG	2	10	153534	153543	0 %	20 %	40 %	40 %	145218954
86	NC_009337	CGCTC	2	10	154968	154977	0 %	20 %	20 %	60 %	145218955
87	NC_009337	CTTCT	2	10	156161	156170	0 %	60 %	0 %	40 %	145218956
88	NC_009337	TTTCA	2	10	156851	156860	20 %	60 %	0 %	20 %	145218956
89	NC_009337	CATAT	2	10	158260	158269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009337	CGGCT	2	10	161199	161208	0 %	20 %	40 %	40 %	145218959
91	NC_009337	AGCCG	2	10	163423	163432	20 %	0 %	40 %	40 %	145218960
92	NC_009337	GCCGG	2	10	164832	164841	0 %	0 %	60 %	40 %	145218962
93	NC_009337	CTTTT	2	10	165150	165159	0 %	80 %	0 %	20 %	145218963
94	NC_009337	GACGT	2	10	165202	165211	20 %	20 %	40 %	20 %	145218963
95	NC_009337	CAGCA	2	10	165672	165681	40 %	0 %	20 %	40 %	145218964
96	NC_009337	GAGGT	2	10	166435	166444	20 %	20 %	60 %	0 %	145218966
97	NC_009337	GGAAT	2	10	167194	167203	40 %	20 %	40 %	0 %	145218966
98	NC_009337	GCGCA	2	10	167340	167349	20 %	0 %	40 %	40 %	145218966
99	NC_009337	AAGGC	2	10	169983	169992	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009337	TCAGA	2	10	170088	170097	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009337	TGGCG	2	10	171519	171528	0 %	20 %	60 %	20 %	145218970
102	NC_009337	CGCTT	2	10	172503	172512	0 %	40 %	20 %	40 %	145218971
103	NC_009337	CGCGC	2	10	173207	173216	0 %	0 %	40 %	60 %	145218972
104	NC_009337	GGTTC	2	10	173239	173248	0 %	40 %	40 %	20 %	145218972
105	NC_009337	GGCCC	2	10	174054	174063	0 %	0 %	40 %	60 %	145218972
106	NC_009337	CCCTG	2	10	175765	175774	0 %	20 %	20 %	60 %	145218976
107	NC_009337	TTTCA	2	10	177821	177830	20 %	60 %	0 %	20 %	145218977
108	NC_009337	TGCCC	2	10	181030	181039	0 %	20 %	20 %	60 %	145218981
109	NC_009337	GCCAT	2	10	181060	181069	20 %	20 %	20 %	40 %	145218981
110	NC_009337	GGTGA	2	10	184036	184045	20 %	20 %	60 %	0 %	145218984
111	NC_009337	CTTCC	2	10	184857	184866	0 %	40 %	0 %	60 %	145218986
112	NC_009337	AATGG	2	10	188335	188344	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009337	ATGGT	2	10	189842	189851	20 %	40 %	40 %	0 %	145218989
114	NC_009337	TCGTG	2	10	192823	192832	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009337	ACCGT	2	10	195417	195426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009337	TCCTT	2	10	197256	197265	0 %	60 %	0 %	40 %	145218991
117	NC_009337	GCTTC	2	10	198862	198871	0 %	40 %	20 %	40 %	145218993
118	NC_009337	GGCGG	2	10	200402	200411	0 %	0 %	80 %	20 %	145218994
119	NC_009337	AGGGC	2	10	203169	203178	20 %	0 %	60 %	20 %	145218999
120	NC_009337	AGAAA	2	10	203595	203604	80 %	0 %	20 %	0 %	145219000
121	NC_009337	TTCTG	2	10	204249	204258	0 %	60 %	20 %	20 %	145219001
122	NC_009337	CCGTT	2	10	205033	205042	0 %	40 %	20 %	40 %	145219002
123	NC_009337	TCCGG	2	10	205129	205138	0 %	20 %	40 %	40 %	145219002
124	NC_009337	GGTCA	2	10	205239	205248	20 %	20 %	40 %	20 %	145219002
125	NC_009337	TTGGT	2	10	206785	206794	0 %	60 %	40 %	0 %	145219006
126	NC_009337	GGCCG	2	10	208454	208463	0 %	0 %	60 %	40 %	145219006
127	NC_009337	CCTTC	2	10	208540	208549	0 %	40 %	0 %	60 %	145219006
128	NC_009337	CCGCT	2	10	209296	209305	0 %	20 %	20 %	60 %	145219007
129	NC_009337	GCGTG	2	10	210818	210827	0 %	20 %	60 %	20 %	145219008
130	NC_009337	GGAAA	2	10	212243	212252	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009337	TCATG	2	10	212330	212339	20 %	40 %	20 %	20 %	145219009
132	NC_009337	CATTC	2	10	212840	212849	20 %	40 %	0 %	40 %	145219009
133	NC_009337	TTGAG	2	10	214375	214384	20 %	40 %	40 %	0 %	145219010
134	NC_009337	GGGTG	2	10	215775	215784	0 %	20 %	80 %	0 %	145219012
135	NC_009337	CGGCC	2	10	219829	219838	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_009337	TTTTG	2	10	220618	220627	0 %	80 %	20 %	0 %	145219017
137	NC_009337	GTGGC	2	10	224091	224100	0 %	20 %	60 %	20 %	145219021
138	NC_009337	CGGAA	2	10	225171	225180	40 %	0 %	40 %	20 %	145219022
139	NC_009337	GCCTG	2	10	228069	228078	0 %	20 %	40 %	40 %	145219026
140	NC_009337	TGGTT	2	10	229040	229049	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009337	TCTGC	2	10	230329	230338	0 %	40 %	20 %	40 %	145219029
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150	NC_009337	TTTCT	2	10	234092	234101	0 %	80 %	0 %	20 %	145219032
151	NC_009337	GCAGC	2	10	235195	235204	20 %	0 %	40 %	40 %	145219035
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155	NC_009337	GGAGC	2	10	239818	239827	20 %	0 %	60 %	20 %	145219041
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162	NC_009337	CCGGT	2	10	250460	250469	0 %	20 %	40 %	40 %	145219053
163	NC_009337	GTTTT	2	10	254862	254871	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009337	TGGAT	2	10	256044	256053	20 %	40 %	40 %	0 %	145219058
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175	NC_009337	AACTG	2	10	293433	293442	40 %	20 %	20 %	20 %	145219105
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180	NC_009337	ATCGT	2	10	298812	298821	20 %	40 %	20 %	20 %	145219112
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201	NC_009337	ACCCT	2	10	339128	339137	20 %	20 %	0 %	60 %	145219142
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204	NC_009337	TGCGT	2	10	342202	342211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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239	NC_009337	CTGCC	2	10	392891	392900	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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246	NC_009337	CTCTT	2	10	398783	398792	0 %	60 %	0 %	40 %	145219203
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253	NC_009337	AGCAC	2	10	411910	411919	40 %	0 %	20 %	40 %	145219216
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259	NC_009337	AGCAC	2	10	420119	420128	40 %	0 %	20 %	40 %	145219225
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262	NC_009337	GAGAG	2	10	423496	423505	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009337	GTTTC	2	10	426352	426361	0 %	60 %	20 %	20 %	145219229
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265	NC_009337	ATTGC	2	10	427470	427479	20 %	40 %	20 %	20 %	145219231
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