MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 10029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009012	AAGG	2	8	93	100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009012	AATG	2	8	932	939	50 %	25 %	25 %	0 %	125972526
3	NC_009012	TGGA	2	8	2014	2021	25 %	25 %	50 %	0 %	125972527
4	NC_009012	TTTA	2	8	2475	2482	25 %	75 %	0 %	0 %	125972527
5	NC_009012	GATG	2	8	2551	2558	25 %	25 %	50 %	0 %	125972527
6	NC_009012	TGGT	2	8	3301	3308	0 %	50 %	50 %	0 %	125972528
7	NC_009012	AAAT	2	8	3528	3535	75 %	25 %	0 %	0 %	125972528
8	NC_009012	ATTG	2	8	3985	3992	25 %	50 %	25 %	0 %	125972529
9	NC_009012	GGGA	2	8	4509	4516	25 %	0 %	75 %	0 %	125972529
10	NC_009012	GGGA	2	8	4712	4719	25 %	0 %	75 %	0 %	125972529
11	NC_009012	GAAG	2	8	4808	4815	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
12	NC_009012	CGGG	2	8	5315	5322	0 %	0 %	75 %	25 %	125972529
13	NC_009012	AAAC	2	8	5496	5503	75 %	0 %	0 %	25 %	125972529
14	NC_009012	ACCA	2	8	5914	5921	50 %	0 %	0 %	50 %	125972529
15	NC_009012	CGGA	2	8	5945	5952	25 %	0 %	50 %	25 %	125972529
16	NC_009012	GAAA	2	8	6147	6154	75 %	0 %	25 %	0 %	125972529
17	NC_009012	TACA	2	8	7458	7465	50 %	25 %	0 %	25 %	125972529
18	NC_009012	GGAA	2	8	7504	7511	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
19	NC_009012	GACA	2	8	7528	7535	50 %	0 %	25 %	25 %	125972529
20	NC_009012	GACG	2	8	7564	7571	25 %	0 %	50 %	25 %	125972529
21	NC_009012	GAAA	2	8	8013	8020	75 %	0 %	25 %	0 %	125972529
22	NC_009012	CGGA	2	8	8381	8388	25 %	0 %	50 %	25 %	125972529
23	NC_009012	GGTA	2	8	8446	8453	25 %	25 %	50 %	0 %	125972529
24	NC_009012	GATA	2	8	9322	9329	50 %	25 %	25 %	0 %	125972529
25	NC_009012	CAAG	2	8	9639	9646	50 %	0 %	25 %	25 %	125972529
26	NC_009012	TAAG	2	8	9696	9703	50 %	25 %	25 %	0 %	125972529
27	NC_009012	TAAT	2	8	9709	9716	50 %	50 %	0 %	0 %	125972530
28	NC_009012	AAAT	2	8	9870	9877	75 %	25 %	0 %	0 %	125972530
29	NC_009012	GGAA	2	8	10838	10845	50 %	0 %	50 %	0 %	125972531
30	NC_009012	GAAA	2	8	11613	11620	75 %	0 %	25 %	0 %	125972532
31	NC_009012	AGGC	2	8	11720	11727	25 %	0 %	50 %	25 %	125972532
32	NC_009012	GAAG	2	8	12166	12173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009012	ATTG	2	8	12666	12673	25 %	50 %	25 %	0 %	125972534
34	NC_009012	GCAA	2	8	12719	12726	50 %	0 %	25 %	25 %	125972534
35	NC_009012	GGAA	2	8	13175	13182	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
36	NC_009012	TACA	2	8	13268	13275	50 %	25 %	0 %	25 %	125972534
37	NC_009012	TACA	2	8	13298	13305	50 %	25 %	0 %	25 %	125972534
38	NC_009012	CAGG	2	8	13314	13321	25 %	0 %	50 %	25 %	125972534
39	NC_009012	GAAG	2	8	13474	13481	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
40	NC_009012	GAAT	2	8	13664	13671	50 %	25 %	25 %	0 %	125972534
41	NC_009012	GGAA	2	8	14312	14319	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
42	NC_009012	ACCA	2	8	14580	14587	50 %	0 %	0 %	50 %	125972534
43	NC_009012	CGGA	2	8	14611	14618	25 %	0 %	50 %	25 %	125972534
44	NC_009012	GGCT	2	8	14895	14902	0 %	25 %	50 %	25 %	125972534
45	NC_009012	TGGA	2	8	15244	15251	25 %	25 %	50 %	0 %	125972534
46	NC_009012	TACA	2	8	16124	16131	50 %	25 %	0 %	25 %	125972534
47	NC_009012	GGAA	2	8	16170	16177	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
48	NC_009012	GACA	2	8	16194	16201	50 %	0 %	25 %	25 %	125972534
49	NC_009012	CAAC	2	8	16408	16415	50 %	0 %	0 %	50 %	125972534
50	NC_009012	GAAG	2	8	16733	16740	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
51	NC_009012	GATT	2	8	16906	16913	25 %	50 %	25 %	0 %	125972534
52	NC_009012	AAAG	2	8	17696	17703	75 %	0 %	25 %	0 %	125972534
53	NC_009012	TGGC	2	8	17953	17960	0 %	25 %	50 %	25 %	125972534
54	NC_009012	AGGA	2	8	18092	18099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009012	TAGA	2	8	18203	18210	50 %	25 %	25 %	0 %	125972535
56	NC_009012	TTTA	2	8	18227	18234	25 %	75 %	0 %	0 %	125972535
57	NC_009012	AGCA	2	8	18507	18514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009012	ATTG	2	8	18731	18738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009012	AGGA	2	8	18752	18759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009012	TACA	2	8	19325	19332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009012	TACA	2	8	19355	19362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009012	AAGA	2	8	19532	19539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009012	TTTG	2	8	19808	19815	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009012	ATTT	2	8	19840	19847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009012	ATAA	2	8	20022	20029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009012	ATTT	2	8	20294	20301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009012	GACA	2	8	20998	21005	50 %	0 %	25 %	25 %	125972540
68	NC_009012	GAAA	2	8	21881	21888	75 %	0 %	25 %	0 %	125972540
69	NC_009012	TCTT	2	8	22093	22100	0 %	75 %	0 %	25 %	125972540
70	NC_009012	TTAT	2	8	22733	22740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009012	GGCA	2	8	22768	22775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009012	ACAA	2	8	22990	22997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009012	TGAA	2	8	23042	23049	50 %	25 %	25 %	0 %	125972541
74	NC_009012	CATA	2	8	23075	23082	50 %	25 %	0 %	25 %	125972541
75	NC_009012	CAAG	2	8	23332	23339	50 %	0 %	25 %	25 %	125972541
76	NC_009012	TCTT	2	8	23892	23899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009012	TAAT	2	8	24028	24035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009012	TTGG	2	8	24287	24294	0 %	50 %	50 %	0 %	125972542
79	NC_009012	GGCA	2	8	25000	25007	25 %	0 %	50 %	25 %	125972542
80	NC_009012	ATTT	2	8	25501	25508	25 %	75 %	0 %	0 %	125972542
81	NC_009012	ATTG	2	8	25519	25526	25 %	50 %	25 %	0 %	125972542
82	NC_009012	ATGA	2	8	25598	25605	50 %	25 %	25 %	0 %	125972542
83	NC_009012	TAAT	2	8	26379	26386	50 %	50 %	0 %	0 %	125972544
84	NC_009012	ACTG	2	8	26455	26462	25 %	25 %	25 %	25 %	125972544
85	NC_009012	AATT	2	8	26723	26730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009012	AAAT	2	8	26820	26827	75 %	25 %	0 %	0 %	125972545
87	NC_009012	AAGG	2	8	27097	27104	50 %	0 %	50 %	0 %	125972545
88	NC_009012	GCGG	2	8	27243	27250	0 %	0 %	75 %	25 %	125972545
89	NC_009012	CATA	2	8	27334	27341	50 %	25 %	0 %	25 %	125972545
90	NC_009012	CAAT	2	8	27485	27492	50 %	25 %	0 %	25 %	125972545
91	NC_009012	GGAG	2	8	27613	27620	25 %	0 %	75 %	0 %	125972545
92	NC_009012	TATT	2	8	27834	27841	25 %	75 %	0 %	0 %	125972546
93	NC_009012	AATA	2	8	28457	28464	75 %	25 %	0 %	0 %	125972546
94	NC_009012	TTTA	2	8	29263	29270	25 %	75 %	0 %	0 %	125972547
95	NC_009012	GGAA	2	8	29623	29630	50 %	0 %	50 %	0 %	125972547
96	NC_009012	TTGC	2	8	29883	29890	0 %	50 %	25 %	25 %	125972548
97	NC_009012	TCAT	2	8	30238	30245	25 %	50 %	0 %	25 %	125972548
98	NC_009012	GATT	2	8	30379	30386	25 %	50 %	25 %	0 %	125972548
99	NC_009012	GATA	2	8	30417	30424	50 %	25 %	25 %	0 %	125972548
100	NC_009012	TGCC	2	8	30693	30700	0 %	25 %	25 %	50 %	125972549
101	NC_009012	AACA	2	8	31099	31106	75 %	0 %	0 %	25 %	125972549
102	NC_009012	GAAA	2	8	31131	31138	75 %	0 %	25 %	0 %	125972549
103	NC_009012	AAGA	2	8	31215	31222	75 %	0 %	25 %	0 %	125972549
104	NC_009012	GTTG	2	8	32395	32402	0 %	50 %	50 %	0 %	125972550
105	NC_009012	CCCG	2	8	33393	33400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_009012	GTTT	2	8	34012	34019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009012	TAAT	2	8	34085	34092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009012	TTTA	2	8	34570	34577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009012	GATT	2	8	34607	34614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009012	AATA	2	8	35017	35024	75 %	25 %	0 %	0 %	125972552
111	NC_009012	TGAT	2	8	35050	35057	25 %	50 %	25 %	0 %	125972552
112	NC_009012	TCCT	2	8	35284	35291	0 %	50 %	0 %	50 %	125972552
113	NC_009012	TAAA	2	8	35691	35698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009012	AAGA	2	8	36077	36084	75 %	0 %	25 %	0 %	125972553
115	NC_009012	GCCT	2	8	36381	36388	0 %	25 %	25 %	50 %	125972553
116	NC_009012	GATG	2	8	36550	36557	25 %	25 %	50 %	0 %	125972553
117	NC_009012	AACG	2	8	36596	36603	50 %	0 %	25 %	25 %	125972553
118	NC_009012	AAAG	2	8	36682	36689	75 %	0 %	25 %	0 %	125972553
119	NC_009012	GGAT	2	8	37020	37027	25 %	25 %	50 %	0 %	125972554
120	NC_009012	TGTT	2	8	37183	37190	0 %	75 %	25 %	0 %	125972554
121	NC_009012	TGTT	2	8	37375	37382	0 %	75 %	25 %	0 %	125972554
122	NC_009012	AGAA	2	8	37768	37775	75 %	0 %	25 %	0 %	125972555
123	NC_009012	TGTC	2	8	37843	37850	0 %	50 %	25 %	25 %	125972555
124	NC_009012	AACA	2	8	37944	37951	75 %	0 %	0 %	25 %	125972555
125	NC_009012	ATTG	2	8	38385	38392	25 %	50 %	25 %	0 %	125972556
126	NC_009012	CATT	2	8	38429	38436	25 %	50 %	0 %	25 %	125972556
127	NC_009012	ACGG	2	8	39056	39063	25 %	0 %	50 %	25 %	125972556
128	NC_009012	TGTA	2	8	39197	39204	25 %	50 %	25 %	0 %	125972556
129	NC_009012	AATC	2	8	39692	39699	50 %	25 %	0 %	25 %	125972556
130	NC_009012	TTTG	2	8	39708	39715	0 %	75 %	25 %	0 %	125972556
131	NC_009012	CATA	2	8	39815	39822	50 %	25 %	0 %	25 %	125972556
132	NC_009012	TATT	2	8	40162	40169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009012	TTGT	2	8	40249	40256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009012	ACAA	2	8	40856	40863	75 %	0 %	0 %	25 %	125972557
135	NC_009012	TAAT	2	8	40872	40879	50 %	50 %	0 %	0 %	125972557
136	NC_009012	TTGG	2	8	42116	42123	0 %	50 %	50 %	0 %	125972557
137	NC_009012	CATG	2	8	42355	42362	25 %	25 %	25 %	25 %	125972557
138	NC_009012	GGAA	2	8	42494	42501	50 %	0 %	50 %	0 %	125972557
139	NC_009012	ATAA	2	8	43113	43120	75 %	25 %	0 %	0 %	125972557
140	NC_009012	ATTA	2	8	43217	43224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009012	GCAG	2	8	43528	43535	25 %	0 %	50 %	25 %	125972558
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143	NC_009012	AGAT	2	8	44030	44037	50 %	25 %	25 %	0 %	125972559
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