MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009012	GATG	2	8	159914	159921	25 %	25 %	50 %	0 %	125972654
3502	NC_009012	AT	3	6	159953	159958	50 %	50 %	0 %	0 %	125972654
3503	NC_009012	TTTG	2	8	160022	160029	0 %	75 %	25 %	0 %	125972654
3504	NC_009012	GAA	2	6	160065	160070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972654
3505	NC_009012	AT	3	6	160075	160080	50 %	50 %	0 %	0 %	125972654
3506	NC_009012	TAT	2	6	160110	160115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972654
3507	NC_009012	CGG	2	6	160177	160182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972654
3508	NC_009012	TCT	2	6	160262	160267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972654
3509	NC_009012	AG	3	6	160271	160276	50 %	0 %	50 %	0 %	125972654
3510	NC_009012	TTTGGT	2	12	160301	160312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972654
3511	NC_009012	ACA	2	6	160321	160326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972654
3512	NC_009012	CTT	2	6	160428	160433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972654
3513	NC_009012	ATG	2	6	160482	160487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972654
3514	NC_009012	GCG	2	6	160510	160515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972654
3515	NC_009012	TGT	2	6	160548	160553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009012	A	6	6	160564	160569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_009012	TTTA	2	8	160595	160602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009012	T	6	6	160611	160616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_009012	GAT	2	6	160686	160691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972655
3520	NC_009012	TGA	2	6	160710	160715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972655
3521	NC_009012	TGG	2	6	160775	160780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972655
3522	NC_009012	ATG	2	6	160819	160824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972655
3523	NC_009012	TAT	2	6	160845	160850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972655
3524	NC_009012	ATA	2	6	160853	160858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972655
3525	NC_009012	ATAA	2	8	160889	160896	75 %	25 %	0 %	0 %	125972655
3526	NC_009012	TTA	2	6	160904	160909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_009012	TAG	2	6	160915	160920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_009012	TA	4	8	160925	160932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_009012	TGT	2	6	160936	160941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_009012	AAT	2	6	161041	161046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972656
3531	NC_009012	AG	3	6	161082	161087	50 %	0 %	50 %	0 %	125972656
3532	NC_009012	TGA	2	6	161154	161159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972656
3533	NC_009012	AGA	2	6	161215	161220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972656
3534	NC_009012	TA	3	6	161316	161321	50 %	50 %	0 %	0 %	125972656
3535	NC_009012	ATGC	2	8	161437	161444	25 %	25 %	25 %	25 %	125972656
3536	NC_009012	TGA	2	6	161478	161483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972656
3537	NC_009012	GGA	2	6	161500	161505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972656
3538	NC_009012	TTTG	2	8	161562	161569	0 %	75 %	25 %	0 %	125972656
3539	NC_009012	AGT	2	6	161577	161582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972656
3540	NC_009012	CTT	2	6	161624	161629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972656
3541	NC_009012	CCT	2	6	161646	161651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125972656
3542	NC_009012	TAA	2	6	161738	161743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972656
3543	NC_009012	GAT	2	6	161827	161832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972656
3544	NC_009012	T	7	7	161838	161844	0 %	100 %	0 %	0 %	125972656
3545	NC_009012	ATCA	2	8	161855	161862	50 %	25 %	0 %	25 %	125972656
3546	NC_009012	TTC	2	6	161969	161974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972656
3547	NC_009012	TTA	2	6	161981	161986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972656
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3549	NC_009012	ATG	2	6	162019	162024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972656
3550	NC_009012	AGC	2	6	162046	162051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972656
3551	NC_009012	G	6	6	162100	162105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_009012	ATT	2	6	162118	162123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972657
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3554	NC_009012	ATC	2	6	162168	162173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972657
3555	NC_009012	CA	3	6	162284	162289	50 %	0 %	0 %	50 %	125972657
3556	NC_009012	AGC	2	6	162308	162313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972657
3557	NC_009012	T	6	6	162320	162325	0 %	100 %	0 %	0 %	125972657
3558	NC_009012	GCC	2	6	162327	162332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125972657
3559	NC_009012	AT	3	6	162335	162340	50 %	50 %	0 %	0 %	125972657
3560	NC_009012	TGT	2	6	162347	162352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972657
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3562	NC_009012	CGA	2	6	162518	162523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972657
3563	NC_009012	AT	3	6	162543	162548	50 %	50 %	0 %	0 %	125972657
3564	NC_009012	GAA	2	6	162555	162560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972657
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3566	NC_009012	TTCCAC	2	12	162593	162604	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	125972657
3567	NC_009012	TGT	2	6	162633	162638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972657
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3569	NC_009012	TCA	2	6	162659	162664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972657
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3571	NC_009012	A	6	6	162973	162978	100 %	0 %	0 %	0 %	125972657
3572	NC_009012	AT	3	6	162984	162989	50 %	50 %	0 %	0 %	125972657
3573	NC_009012	TTA	2	6	163027	163032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972657
3574	NC_009012	CTTC	2	8	163050	163057	0 %	50 %	0 %	50 %	125972657
3575	NC_009012	C	6	6	163079	163084	0 %	0 %	0 %	100 %	125972657
3576	NC_009012	TTG	2	6	163108	163113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972657
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3581	NC_009012	TGT	2	6	163526	163531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972657
3582	NC_009012	TGA	2	6	163538	163543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972657
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3584	NC_009012	ATGA	2	8	163619	163626	50 %	25 %	25 %	0 %	125972658
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3590	NC_009012	TAT	2	6	163871	163876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972658
3591	NC_009012	ATG	2	6	163926	163931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972658
3592	NC_009012	ATA	2	6	163932	163937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972658
3593	NC_009012	CGG	2	6	164028	164033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972658
3594	NC_009012	T	6	6	164038	164043	0 %	100 %	0 %	0 %	125972658
3595	NC_009012	GCT	2	6	164287	164292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972658
3596	NC_009012	GGTTAA	2	12	164293	164304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972658
3597	NC_009012	AT	3	6	164426	164431	50 %	50 %	0 %	0 %	125972658
3598	NC_009012	TTG	2	6	164466	164471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972658
3599	NC_009012	GAA	2	6	164494	164499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972658
3600	NC_009012	T	6	6	164570	164575	0 %	100 %	0 %	0 %	125972658
3601	NC_009012	ATTT	2	8	164615	164622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_009012	GAA	2	6	164641	164646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972659
3603	NC_009012	GAA	2	6	164660	164665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972659
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3605	NC_009012	TGC	2	6	164694	164699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972659
3606	NC_009012	A	6	6	164744	164749	100 %	0 %	0 %	0 %	125972659
3607	NC_009012	AT	4	8	164790	164797	50 %	50 %	0 %	0 %	125972659
3608	NC_009012	CAA	2	6	164824	164829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972659
3609	NC_009012	GAT	2	6	164873	164878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972659
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3611	NC_009012	TG	3	6	164960	164965	0 %	50 %	50 %	0 %	125972659
3612	NC_009012	ACA	2	6	165054	165059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972659
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3614	NC_009012	TAT	2	6	165077	165082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972659
3615	NC_009012	AAC	2	6	165107	165112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972659
3616	NC_009012	TGAA	2	8	165120	165127	50 %	25 %	25 %	0 %	125972659
3617	NC_009012	A	6	6	165134	165139	100 %	0 %	0 %	0 %	125972659
3618	NC_009012	TGC	2	6	165295	165300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972659
3619	NC_009012	CGG	2	6	165376	165381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972659
3620	NC_009012	AT	3	6	165554	165559	50 %	50 %	0 %	0 %	125972659
3621	NC_009012	AT	3	6	165604	165609	50 %	50 %	0 %	0 %	125972659
3622	NC_009012	GAT	2	6	165661	165666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972659
3623	NC_009012	AT	3	6	165691	165696	50 %	50 %	0 %	0 %	125972659
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