MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009012	ATA	2	6	135257	135262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_009012	TGAT	2	8	135333	135340	25 %	50 %	25 %	0 %	125972627
3004	NC_009012	ATAA	2	8	135482	135489	75 %	25 %	0 %	0 %	125972627
3005	NC_009012	CCG	2	6	135534	135539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125972627
3006	NC_009012	CAG	2	6	135572	135577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972627
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3010	NC_009012	AT	3	6	135725	135730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_009012	TTTA	2	8	135731	135738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3013	NC_009012	TTA	2	6	135893	135898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009012	ATT	2	6	135931	135936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_009012	T	7	7	135935	135941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_009012	TA	3	6	135988	135993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3019	NC_009012	AAT	2	6	136140	136145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972628
3020	NC_009012	AAC	2	6	136201	136206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972628
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3022	NC_009012	CGG	2	6	136224	136229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972628
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3042	NC_009012	ATTGG	2	10	137230	137239	20 %	40 %	40 %	0 %	125972629
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3054	NC_009012	AGA	2	6	137876	137881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3102	NC_009012	ATTT	2	8	140364	140371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_009012	TAA	2	6	140426	140431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009012	AT	4	8	140560	140567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_009012	T	8	8	140572	140579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_009012	T	6	6	140582	140587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_009012	AT	3	6	140588	140593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_009012	AG	3	6	140607	140612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_009012	AAT	2	6	140645	140650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_009012	A	6	6	140653	140658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_009012	A	6	6	140663	140668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_009012	AT	3	6	140805	140810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_009012	A	6	6	140818	140823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_009012	TAA	2	6	140838	140843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_009012	ATA	2	6	140974	140979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_009012	AAG	2	6	141033	141038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_009012	T	7	7	141154	141160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_009012	ATT	2	6	141180	141185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3121	NC_009012	AATT	2	8	141342	141349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_009012	TCT	2	6	141383	141388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_009012	CT	3	6	141402	141407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_009012	ATTA	2	8	141474	141481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_009012	AAG	2	6	141507	141512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972633
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3127	NC_009012	CCAA	2	8	141627	141634	50 %	0 %	0 %	50 %	125972633
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3129	NC_009012	AT	3	6	141864	141869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_009012	AAT	2	6	141883	141888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_009012	TTTAT	2	10	141922	141931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_009012	ATATA	2	10	141939	141948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3143	NC_009012	GAT	2	6	142582	142587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972634
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3168	NC_009012	AAT	2	6	143815	143820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3236	NC_009012	AT	5	10	147334	147343	50 %	50 %	0 %	0 %	125972639
3237	NC_009012	GTT	2	6	147401	147406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972639
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3241	NC_009012	GAAA	2	8	147515	147522	75 %	0 %	25 %	0 %	125972639
3242	NC_009012	GACATT	2	12	147563	147574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	125972639
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3250	NC_009012	GAAAAA	2	12	147794	147805	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	125972639
3251	NC_009012	A	7	7	147801	147807	100 %	0 %	0 %	0 %	125972639
3252	NC_009012	A	6	6	147815	147820	100 %	0 %	0 %	0 %	125972639
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3254	NC_009012	GGC	2	6	147871	147876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972639
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