MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009012	T	7	7	112762	112768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_009012	CAAA	2	8	112779	112786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_009012	A	7	7	112784	112790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_009012	AG	3	6	112813	112818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_009012	AGT	2	6	112824	112829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_009012	C	6	6	112844	112849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2507	NC_009012	AACTTC	2	12	112851	112862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_009012	GAT	3	9	112877	112885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_009012	AAT	2	6	112914	112919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_009012	TAA	2	6	112944	112949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_009012	CAC	2	6	112958	112963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_009012	A	6	6	113028	113033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_009012	CAGCA	2	10	113163	113172	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2514	NC_009012	ATA	2	6	113249	113254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_009012	AAAG	2	8	113282	113289	75 %	0 %	25 %	0 %	125972606
2516	NC_009012	A	7	7	113294	113300	100 %	0 %	0 %	0 %	125972606
2517	NC_009012	TGC	2	6	113314	113319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972606
2518	NC_009012	GAA	2	6	113371	113376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972606
2519	NC_009012	GAA	2	6	113397	113402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972606
2520	NC_009012	GAT	2	6	113405	113410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972606
2521	NC_009012	AAC	2	6	113412	113417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972606
2522	NC_009012	CCGGA	2	10	113464	113473	20 %	0 %	40 %	40 %	125972606
2523	NC_009012	TGG	2	6	113548	113553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972606
2524	NC_009012	CAGA	2	8	113589	113596	50 %	0 %	25 %	25 %	125972606
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2526	NC_009012	A	6	6	113623	113628	100 %	0 %	0 %	0 %	125972606
2527	NC_009012	GAA	2	6	113637	113642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972606
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2529	NC_009012	GAG	2	6	113700	113705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972606
2530	NC_009012	CAT	2	6	113750	113755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972606
2531	NC_009012	TGA	2	6	113762	113767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972606
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2533	NC_009012	AG	3	6	113916	113921	50 %	0 %	50 %	0 %	125972606
2534	NC_009012	AGAA	2	8	113959	113966	75 %	0 %	25 %	0 %	125972606
2535	NC_009012	AGA	2	6	114038	114043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972606
2536	NC_009012	ATTTG	2	10	114179	114188	20 %	60 %	20 %	0 %	125972606
2537	NC_009012	CAG	2	6	114234	114239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972606
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2539	NC_009012	A	6	6	114315	114320	100 %	0 %	0 %	0 %	125972606
2540	NC_009012	CCG	2	6	114354	114359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125972606
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2542	NC_009012	TGA	2	6	114551	114556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972606
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2544	NC_009012	TGT	2	6	114682	114687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972606
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2546	NC_009012	GA	3	6	114872	114877	50 %	0 %	50 %	0 %	125972606
2547	NC_009012	AAT	2	6	114878	114883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972606
2548	NC_009012	AGA	2	6	114979	114984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972606
2549	NC_009012	A	6	6	115029	115034	100 %	0 %	0 %	0 %	125972606
2550	NC_009012	GGAA	2	8	115139	115146	50 %	0 %	50 %	0 %	125972606
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2552	NC_009012	GGAG	2	8	115292	115299	25 %	0 %	75 %	0 %	125972606
2553	NC_009012	A	6	6	115379	115384	100 %	0 %	0 %	0 %	125972606
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2556	NC_009012	AAGA	2	8	115506	115513	75 %	0 %	25 %	0 %	125972606
2557	NC_009012	AAGA	2	8	115538	115545	75 %	0 %	25 %	0 %	125972606
2558	NC_009012	AAACC	2	10	115603	115612	60 %	0 %	0 %	40 %	125972606
2559	NC_009012	GGCA	2	8	115617	115624	25 %	0 %	50 %	25 %	125972606
2560	NC_009012	GAA	2	6	115641	115646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972606
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2566	NC_009012	AT	3	6	115731	115736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_009012	TAA	2	6	115755	115760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_009012	TA	3	6	115784	115789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_009012	T	7	7	115874	115880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2573	NC_009012	AAT	2	6	116084	116089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972607
2574	NC_009012	TGC	2	6	116096	116101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972607
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2597	NC_009012	AG	3	6	116925	116930	50 %	0 %	50 %	0 %	125972607
2598	NC_009012	TTC	2	6	117050	117055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972607
2599	NC_009012	CGG	2	6	117148	117153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972607
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2601	NC_009012	TCAAC	2	10	117265	117274	40 %	20 %	0 %	40 %	125972607
2602	NC_009012	CGA	2	6	117281	117286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972607
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2604	NC_009012	ACA	2	6	117319	117324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972607
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2606	NC_009012	CTTA	2	8	117339	117346	25 %	50 %	0 %	25 %	125972607
2607	NC_009012	GAAATA	2	12	117405	117416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	125972607
2608	NC_009012	TAA	2	6	117485	117490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972607
2609	NC_009012	T	6	6	117552	117557	0 %	100 %	0 %	0 %	125972607
2610	NC_009012	GAAA	2	8	117572	117579	75 %	0 %	25 %	0 %	125972607
2611	NC_009012	TAA	2	6	117596	117601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972607
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2621	NC_009012	CTTTAC	2	12	117894	117905	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	125972608
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