MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_009012	AAAAG	2	10	65660	65669	80 %	0 %	20 %	0 %	125972574
1503	NC_009012	AAAG	2	8	65673	65680	75 %	0 %	25 %	0 %	125972574
1504	NC_009012	GGA	2	6	65685	65690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972574
1505	NC_009012	TGA	2	6	65699	65704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972574
1506	NC_009012	TCAG	2	8	65723	65730	25 %	25 %	25 %	25 %	125972574
1507	NC_009012	AAC	2	6	65784	65789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972574
1508	NC_009012	ATT	2	6	65802	65807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972574
1509	NC_009012	AT	3	6	65912	65917	50 %	50 %	0 %	0 %	125972574
1510	NC_009012	ATT	2	6	66006	66011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972574
1511	NC_009012	ATA	2	6	66147	66152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_009012	AAG	2	6	66179	66184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_009012	TTG	2	6	66201	66206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_009012	CTT	2	6	66208	66213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_009012	T	6	6	66212	66217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_009012	ATA	2	6	66268	66273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_009012	ATT	2	6	66284	66289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_009012	ATGGG	2	10	66293	66302	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_009012	AACA	2	8	66321	66328	75 %	0 %	0 %	25 %	125972575
1520	NC_009012	GTT	2	6	66329	66334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972575
1521	NC_009012	T	7	7	66349	66355	0 %	100 %	0 %	0 %	125972575
1522	NC_009012	TAAA	2	8	66403	66410	75 %	25 %	0 %	0 %	125972575
1523	NC_009012	AAT	2	6	66411	66416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972575
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1525	NC_009012	ATA	2	6	66499	66504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972575
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1532	NC_009012	AT	4	8	66775	66782	50 %	50 %	0 %	0 %	125972575
1533	NC_009012	GAA	2	6	66790	66795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972575
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1535	NC_009012	AAG	2	6	66946	66951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972575
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1539	NC_009012	AAG	2	6	67075	67080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972575
1540	NC_009012	AAAT	2	8	67090	67097	75 %	25 %	0 %	0 %	125972575
1541	NC_009012	AT	3	6	67123	67128	50 %	50 %	0 %	0 %	125972575
1542	NC_009012	TTGT	2	8	67135	67142	0 %	75 %	25 %	0 %	125972575
1543	NC_009012	TA	3	6	67206	67211	50 %	50 %	0 %	0 %	125972575
1544	NC_009012	GAT	2	6	67217	67222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972575
1545	NC_009012	AT	3	6	67221	67226	50 %	50 %	0 %	0 %	125972575
1546	NC_009012	GAT	2	6	67256	67261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972575
1547	NC_009012	TA	3	6	67333	67338	50 %	50 %	0 %	0 %	125972575
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1552	NC_009012	ATAA	2	8	67579	67586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_009012	T	6	6	67601	67606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009012	ATA	2	6	67614	67619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_009012	TTA	2	6	67620	67625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009012	AT	3	6	67627	67632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009012	ATA	2	6	67640	67645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009012	TATT	2	8	67669	67676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_009012	AT	3	6	67692	67697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_009012	TAA	2	6	67712	67717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_009012	CAAAAA	2	12	67742	67753	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1562	NC_009012	G	6	6	67761	67766	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009012	CAA	2	6	67804	67809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972576
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1574	NC_009012	AGTA	2	8	68222	68229	50 %	25 %	25 %	0 %	125972576
1575	NC_009012	TTGA	2	8	68423	68430	25 %	50 %	25 %	0 %	125972576
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1592	NC_009012	T	7	7	69118	69124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_009012	TCT	2	6	69126	69131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1595	NC_009012	AAT	2	6	69138	69143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009012	ATT	2	6	69175	69180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_009012	ATG	2	6	69201	69206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_009012	T	7	7	69208	69214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_009012	GAG	2	6	69294	69299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009012	A	7	7	69342	69348	100 %	0 %	0 %	0 %	125972577
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1602	NC_009012	AGA	2	6	69405	69410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972577
1603	NC_009012	CTG	2	6	69430	69435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972577
1604	NC_009012	TATGA	2	10	69486	69495	40 %	40 %	20 %	0 %	125972577
1605	NC_009012	T	6	6	69509	69514	0 %	100 %	0 %	0 %	125972577
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1611	NC_009012	G	6	6	69793	69798	0 %	0 %	100 %	0 %	125972577
1612	NC_009012	AAG	2	6	69855	69860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972577
1613	NC_009012	AAC	2	6	69861	69866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972577
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1615	NC_009012	TTG	2	6	69949	69954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972577
1616	NC_009012	GCAA	2	8	69979	69986	50 %	0 %	25 %	25 %	125972577
1617	NC_009012	GA	3	6	69992	69997	50 %	0 %	50 %	0 %	125972577
1618	NC_009012	TTG	2	6	70012	70017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972577
1619	NC_009012	AAC	2	6	70029	70034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972577
1620	NC_009012	AAT	2	6	70046	70051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972577
1621	NC_009012	GCG	2	6	70120	70125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972577
1622	NC_009012	TGC	2	6	70135	70140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972577
1623	NC_009012	TCAA	2	8	70164	70171	50 %	25 %	0 %	25 %	125972577
1624	NC_009012	ATGGG	2	10	70347	70356	20 %	20 %	60 %	0 %	125972577
1625	NC_009012	A	6	6	70417	70422	100 %	0 %	0 %	0 %	125972577
1626	NC_009012	GCTG	2	8	70466	70473	0 %	25 %	50 %	25 %	125972577
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1629	NC_009012	ACT	2	6	70545	70550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972577
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