MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009012	ATT	2	6	42777	42782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972557
1003	NC_009012	ATA	2	6	42783	42788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972557
1004	NC_009012	GA	3	6	42805	42810	50 %	0 %	50 %	0 %	125972557
1005	NC_009012	GCA	2	6	42898	42903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972557
1006	NC_009012	CTG	2	6	42932	42937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972557
1007	NC_009012	ATT	2	6	43023	43028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972557
1008	NC_009012	GAA	3	9	43079	43087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972557
1009	NC_009012	A	6	6	43106	43111	100 %	0 %	0 %	0 %	125972557
1010	NC_009012	ATAA	2	8	43113	43120	75 %	25 %	0 %	0 %	125972557
1011	NC_009012	ATG	2	6	43151	43156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009012	ATTA	2	8	43217	43224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009012	AAT	2	6	43241	43246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972558
1014	NC_009012	CTT	2	6	43278	43283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972558
1015	NC_009012	CCG	2	6	43302	43307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125972558
1016	NC_009012	TGC	2	6	43377	43382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972558
1017	NC_009012	T	6	6	43455	43460	0 %	100 %	0 %	0 %	125972558
1018	NC_009012	AT	3	6	43470	43475	50 %	50 %	0 %	0 %	125972558
1019	NC_009012	GCA	2	6	43494	43499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972558
1020	NC_009012	GCAG	2	8	43528	43535	25 %	0 %	50 %	25 %	125972558
1021	NC_009012	AGA	2	6	43574	43579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972558
1022	NC_009012	GGT	2	6	43588	43593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972558
1023	NC_009012	TAA	2	6	43694	43699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972558
1024	NC_009012	T	8	8	43781	43788	0 %	100 %	0 %	0 %	125972558
1025	NC_009012	GCTT	2	8	43800	43807	0 %	50 %	25 %	25 %	125972558
1026	NC_009012	T	7	7	43867	43873	0 %	100 %	0 %	0 %	125972558
1027	NC_009012	T	6	6	43888	43893	0 %	100 %	0 %	0 %	125972558
1028	NC_009012	TGT	2	6	43910	43915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009012	A	6	6	43990	43995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009012	AGG	2	6	43997	44002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009012	TAA	2	6	44024	44029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972559
1032	NC_009012	AGAT	2	8	44030	44037	50 %	25 %	25 %	0 %	125972559
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1034	NC_009012	TGCC	2	8	44073	44080	0 %	25 %	25 %	50 %	125972559
1035	NC_009012	GAT	2	6	44128	44133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972559
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1038	NC_009012	TCAAA	2	10	44376	44385	60 %	20 %	0 %	20 %	125972559
1039	NC_009012	ATA	2	6	44471	44476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972559
1040	NC_009012	ACA	2	6	44564	44569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972559
1041	NC_009012	TGC	2	6	44608	44613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972559
1042	NC_009012	GGA	2	6	44614	44619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972559
1043	NC_009012	CAAC	2	8	44690	44697	50 %	0 %	0 %	50 %	125972559
1044	NC_009012	TTAT	2	8	44731	44738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009012	TAAA	2	8	44744	44751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009012	A	6	6	44749	44754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009012	AGG	2	6	44762	44767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009012	AGG	2	6	44810	44815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972560
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1053	NC_009012	A	7	7	45134	45140	100 %	0 %	0 %	0 %	125972560
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1055	NC_009012	TA	3	6	45284	45289	50 %	50 %	0 %	0 %	125972560
1056	NC_009012	GGC	2	6	45299	45304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972560
1057	NC_009012	GAC	2	6	45312	45317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972560
1058	NC_009012	GAC	2	6	45330	45335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972560
1059	NC_009012	A	6	6	45455	45460	100 %	0 %	0 %	0 %	125972560
1060	NC_009012	ACT	2	6	45571	45576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972560
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1062	NC_009012	GAA	2	6	45642	45647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972560
1063	NC_009012	TAC	2	6	45677	45682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972560
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1079	NC_009012	TAAT	2	8	46496	46503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_009012	TA	3	6	46668	46673	50 %	50 %	0 %	0 %	125972561
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1092	NC_009012	ATA	2	6	46972	46977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009012	T	6	6	46991	46996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009012	AAT	2	6	47025	47030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_009012	GT	3	6	47146	47151	0 %	50 %	50 %	0 %	125972562
1100	NC_009012	TTG	2	6	47180	47185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972562
1101	NC_009012	A	6	6	47322	47327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009012	AGG	2	6	47331	47336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009012	TAT	2	6	47357	47362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972563
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1105	NC_009012	GTT	2	6	47432	47437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972563
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1107	NC_009012	A	7	7	47487	47493	100 %	0 %	0 %	0 %	125972563
1108	NC_009012	TGC	2	6	47512	47517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972563
1109	NC_009012	ATA	2	6	47550	47555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972563
1110	NC_009012	ATG	2	6	47574	47579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972563
1111	NC_009012	GTAA	2	8	47588	47595	50 %	25 %	25 %	0 %	125972563
1112	NC_009012	A	6	6	47604	47609	100 %	0 %	0 %	0 %	125972563
1113	NC_009012	ACCG	2	8	47675	47682	25 %	0 %	25 %	50 %	125972563
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1115	NC_009012	GAA	2	6	47771	47776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972563
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1119	NC_009012	ATA	2	6	47853	47858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972563
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1129	NC_009012	GGA	2	6	48505	48510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972563
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1249	NC_009012	TA	3	6	54338	54343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_009012	T	6	6	54551	54556	0 %	100 %	0 %	0 %	125972567
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1262	NC_009012	GGA	2	6	54658	54663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972567
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1266	NC_009012	TGTAT	2	10	54843	54852	20 %	60 %	20 %	0 %	125972567
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1272	NC_009012	TGC	2	6	55275	55280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972567
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1342	NC_009012	TA	3	6	58452	58457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1343	NC_009012	AT	4	8	58464	58471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1344	NC_009012	A	6	6	58478	58483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1366	NC_009012	G	6	6	59523	59528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1379	NC_009012	A	8	8	60011	60018	100 %	0 %	0 %	0 %	125972570
1380	NC_009012	TA	3	6	60042	60047	50 %	50 %	0 %	0 %	125972570
1381	NC_009012	A	6	6	60047	60052	100 %	0 %	0 %	0 %	125972570
1382	NC_009012	ATA	2	6	60180	60185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972570
1383	NC_009012	CATG	2	8	60201	60208	25 %	25 %	25 %	25 %	125972570
1384	NC_009012	TAC	2	6	60228	60233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972570
1385	NC_009012	AAC	2	6	60246	60251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972570
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