MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009012	A	6	6	20455	20460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009012	TAT	3	9	20474	20482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009012	AACAC	2	10	20483	20492	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
504	NC_009012	TAA	2	6	20498	20503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009012	TAC	2	6	20571	20576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972540
506	NC_009012	GT	3	6	20596	20601	0 %	50 %	50 %	0 %	125972540
507	NC_009012	ACG	2	6	20840	20845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972540
508	NC_009012	AT	3	6	20907	20912	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
509	NC_009012	AT	3	6	20943	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
510	NC_009012	TTA	2	6	20965	20970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972540
511	NC_009012	GACA	2	8	20998	21005	50 %	0 %	25 %	25 %	125972540
512	NC_009012	AAT	2	6	21021	21026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972540
513	NC_009012	ACC	2	6	21042	21047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125972540
514	NC_009012	ATT	2	6	21108	21113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972540
515	NC_009012	AAG	2	6	21129	21134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972540
516	NC_009012	AGA	2	6	21147	21152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972540
517	NC_009012	A	6	6	21217	21222	100 %	0 %	0 %	0 %	125972540
518	NC_009012	CGACTC	2	12	21272	21283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	125972540
519	NC_009012	CAA	2	6	21284	21289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972540
520	NC_009012	GCA	2	6	21447	21452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972540
521	NC_009012	TGA	2	6	21501	21506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972540
522	NC_009012	AAG	2	6	21512	21517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972540
523	NC_009012	CTT	2	6	21768	21773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972540
524	NC_009012	GAAA	2	8	21881	21888	75 %	0 %	25 %	0 %	125972540
525	NC_009012	CAG	2	6	21906	21911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972540
526	NC_009012	TA	3	6	21925	21930	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
527	NC_009012	TTA	3	9	21951	21959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972540
528	NC_009012	CTG	2	6	21986	21991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972540
529	NC_009012	CGG	2	6	21993	21998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972540
530	NC_009012	TTA	2	6	22041	22046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972540
531	NC_009012	AAT	2	6	22060	22065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972540
532	NC_009012	TCTT	2	8	22093	22100	0 %	75 %	0 %	25 %	125972540
533	NC_009012	GAC	2	6	22102	22107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972540
534	NC_009012	TTG	2	6	22154	22159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972540
535	NC_009012	ATG	2	6	22205	22210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972540
536	NC_009012	TAT	2	6	22230	22235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972540
537	NC_009012	GA	3	6	22262	22267	50 %	0 %	50 %	0 %	125972540
538	NC_009012	TTA	2	6	22295	22300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972540
539	NC_009012	GGA	2	6	22368	22373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972540
540	NC_009012	TA	3	6	22393	22398	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
541	NC_009012	AT	3	6	22412	22417	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
542	NC_009012	A	6	6	22428	22433	100 %	0 %	0 %	0 %	125972540
543	NC_009012	GCA	2	6	22563	22568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972540
544	NC_009012	GAT	2	6	22573	22578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972540
545	NC_009012	TGA	2	6	22595	22600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972540
546	NC_009012	ATT	2	6	22671	22676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009012	ATA	2	6	22695	22700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009012	CTT	2	6	22719	22724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_009012	TTAT	2	8	22733	22740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009012	T	6	6	22740	22745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009012	TA	3	6	22750	22755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009012	GGCA	2	8	22768	22775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_009012	A	6	6	22780	22785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009012	GGC	2	6	22786	22791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_009012	AT	4	8	22827	22834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009012	TA	4	8	22839	22846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009012	TA	3	6	22924	22929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009012	TAA	2	6	22947	22952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009012	AT	3	6	22954	22959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009012	AAT	2	6	22970	22975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009012	ACAA	2	8	22990	22997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_009012	A	6	6	23015	23020	100 %	0 %	0 %	0 %	125972541
563	NC_009012	TGAA	2	8	23042	23049	50 %	25 %	25 %	0 %	125972541
564	NC_009012	CATA	2	8	23075	23082	50 %	25 %	0 %	25 %	125972541
565	NC_009012	T	6	6	23136	23141	0 %	100 %	0 %	0 %	125972541
566	NC_009012	AGA	2	6	23157	23162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972541
567	NC_009012	A	6	6	23185	23190	100 %	0 %	0 %	0 %	125972541
568	NC_009012	A	6	6	23275	23280	100 %	0 %	0 %	0 %	125972541
569	NC_009012	A	6	6	23294	23299	100 %	0 %	0 %	0 %	125972541
570	NC_009012	CAAG	2	8	23332	23339	50 %	0 %	25 %	25 %	125972541
571	NC_009012	AGA	2	6	23340	23345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972541
572	NC_009012	GAA	2	6	23401	23406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972541
573	NC_009012	ATAAA	2	10	23496	23505	80 %	20 %	0 %	0 %	125972541
574	NC_009012	ATATA	2	10	23610	23619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009012	GAA	2	6	23633	23638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009012	A	6	6	23673	23678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009012	ATT	2	6	23740	23745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009012	TAT	2	6	23752	23757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009012	AAG	2	6	23766	23771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009012	A	7	7	23842	23848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009012	CG	3	6	23856	23861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_009012	TCTT	2	8	23892	23899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_009012	CAA	2	6	23903	23908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_009012	GATTTT	2	12	23928	23939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009012	GAAAAA	2	12	23955	23966	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009012	A	7	7	23975	23981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009012	TA	3	6	24019	24024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009012	TAAT	2	8	24028	24035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009012	T	6	6	24035	24040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009012	GAA	2	6	24058	24063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972542
591	NC_009012	AAG	2	6	24108	24113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972542
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593	NC_009012	ATT	2	6	24202	24207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972542
594	NC_009012	GTT	2	6	24224	24229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972542
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597	NC_009012	TAA	2	6	24303	24308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972542
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599	NC_009012	TTC	2	6	24335	24340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972542
600	NC_009012	CTT	2	6	24344	24349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972542
601	NC_009012	TGA	2	6	24574	24579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972542
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603	NC_009012	GAC	2	6	24695	24700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972542
604	NC_009012	ATT	2	6	24710	24715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972542
605	NC_009012	ATT	2	6	24737	24742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972542
606	NC_009012	TCC	2	6	24793	24798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125972542
607	NC_009012	AAT	2	6	24851	24856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972542
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611	NC_009012	ATTTGC	2	12	25018	25029	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125972542
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620	NC_009012	CGG	2	6	25459	25464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972542
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622	NC_009012	ATTT	2	8	25501	25508	25 %	75 %	0 %	0 %	125972542
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629	NC_009012	GAA	2	6	25748	25753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972542
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634	NC_009012	AGG	2	6	25929	25934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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