MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009012	AGGT	2	8	274414	274421	25 %	25 %	50 %	0 %	125972748
6002	NC_009012	CTT	2	6	274456	274461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972748
6003	NC_009012	GAA	2	6	274545	274550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972748
6004	NC_009012	GTT	2	6	274566	274571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972748
6005	NC_009012	TGA	2	6	274574	274579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972748
6006	NC_009012	AAT	2	6	274592	274597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972748
6007	NC_009012	AAGT	2	8	274621	274628	50 %	25 %	25 %	0 %	125972748
6008	NC_009012	TGC	2	6	274670	274675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972748
6009	NC_009012	TTA	2	6	274755	274760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_009012	CA	3	6	274776	274781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_009012	ATC	2	6	274786	274791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_009012	GTA	2	6	274865	274870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_009012	GAT	2	6	274873	274878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_009012	AT	3	6	274877	274882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_009012	TGA	2	6	274891	274896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_009012	TGT	2	6	274921	274926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_009012	CTT	2	6	274979	274984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_009012	TGCC	2	8	274987	274994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_009012	A	6	6	275068	275073	100 %	0 %	0 %	0 %	125972749
6020	NC_009012	T	6	6	275115	275120	0 %	100 %	0 %	0 %	125972749
6021	NC_009012	TA	3	6	275155	275160	50 %	50 %	0 %	0 %	125972749
6022	NC_009012	TGA	2	6	275193	275198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972749
6023	NC_009012	ATG	2	6	275222	275227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972749
6024	NC_009012	GGATGA	2	12	275283	275294	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	125972749
6025	NC_009012	GTTT	2	8	275302	275309	0 %	75 %	25 %	0 %	125972749
6026	NC_009012	AAAAGG	2	12	275410	275421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_009012	TAT	2	6	275443	275448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_009012	A	6	6	275473	275478	100 %	0 %	0 %	0 %	125972750
6029	NC_009012	TGTT	2	8	275513	275520	0 %	75 %	25 %	0 %	125972750
6030	NC_009012	T	6	6	275547	275552	0 %	100 %	0 %	0 %	125972750
6031	NC_009012	AAC	2	6	275570	275575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972750
6032	NC_009012	ATG	2	6	275603	275608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972750
6033	NC_009012	TCAT	2	8	275618	275625	25 %	50 %	0 %	25 %	125972750
6034	NC_009012	ATA	2	6	275642	275647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972750
6035	NC_009012	TAT	2	6	275662	275667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972750
6036	NC_009012	ATA	2	6	275717	275722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972750
6037	NC_009012	TAT	2	6	275730	275735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972750
6038	NC_009012	T	6	6	275807	275812	0 %	100 %	0 %	0 %	125972750
6039	NC_009012	AT	3	6	275821	275826	50 %	50 %	0 %	0 %	125972750
6040	NC_009012	TGA	2	6	275905	275910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972750
6041	NC_009012	GATT	2	8	275927	275934	25 %	50 %	25 %	0 %	125972750
6042	NC_009012	ATA	2	6	275947	275952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_009012	TAA	2	6	275967	275972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_009012	CAG	2	6	275989	275994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_009012	CGT	2	6	276123	276128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972751
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6047	NC_009012	A	6	6	276231	276236	100 %	0 %	0 %	0 %	125972751
6048	NC_009012	AATC	2	8	276285	276292	50 %	25 %	0 %	25 %	125972751
6049	NC_009012	TCA	2	6	276421	276426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972751
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6051	NC_009012	A	7	7	276510	276516	100 %	0 %	0 %	0 %	125972751
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6053	NC_009012	TGA	2	6	276708	276713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972751
6054	NC_009012	TGG	2	6	276716	276721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972751
6055	NC_009012	AATT	2	8	276734	276741	50 %	50 %	0 %	0 %	125972751
6056	NC_009012	CAA	3	9	276831	276839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972751
6057	NC_009012	A	7	7	276897	276903	100 %	0 %	0 %	0 %	125972751
6058	NC_009012	TAT	2	6	277039	277044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972751
6059	NC_009012	ATTTTT	2	12	277116	277127	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_009012	T	7	7	277123	277129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_009012	A	6	6	277149	277154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_009012	ATA	2	6	277177	277182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_009012	ATGC	2	8	277186	277193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_009012	T	7	7	277228	277234	0 %	100 %	0 %	0 %	125972752
6065	NC_009012	GT	3	6	277263	277268	0 %	50 %	50 %	0 %	125972752
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6071	NC_009012	GAG	2	6	277675	277680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972752
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6081	NC_009012	TGA	2	6	278132	278137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972752
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6083	NC_009012	AGGA	2	8	278215	278222	50 %	0 %	50 %	0 %	125972752
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6090	NC_009012	GAT	2	6	278620	278625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972752
6091	NC_009012	TAT	2	6	278650	278655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972752
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6093	NC_009012	GA	3	6	278685	278690	50 %	0 %	50 %	0 %	125972752
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6096	NC_009012	GTAT	2	8	278969	278976	25 %	50 %	25 %	0 %	125972753
6097	NC_009012	ACC	2	6	279036	279041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125972753
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6101	NC_009012	CTG	2	6	279196	279201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972753
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6104	NC_009012	AAGG	2	8	279342	279349	50 %	0 %	50 %	0 %	125972753
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6109	NC_009012	TTA	2	6	279775	279780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972753
6110	NC_009012	GCGGG	2	10	279786	279795	0 %	0 %	80 %	20 %	125972753
6111	NC_009012	GGA	2	6	279845	279850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972753
6112	NC_009012	A	6	6	279857	279862	100 %	0 %	0 %	0 %	125972753
6113	NC_009012	AAGGA	2	10	280227	280236	60 %	0 %	40 %	0 %	125972753
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6117	NC_009012	TA	3	6	280385	280390	50 %	50 %	0 %	0 %	125972754
6118	NC_009012	T	6	6	280414	280419	0 %	100 %	0 %	0 %	125972754
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6122	NC_009012	TG	3	6	280726	280731	0 %	50 %	50 %	0 %	125972754
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6126	NC_009012	TGC	2	6	280854	280859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972754
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6145	NC_009012	GTTG	2	8	281963	281970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6147	NC_009012	AAG	2	6	282149	282154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6151	NC_009012	TAT	2	6	282246	282251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6245	NC_009012	GGA	2	6	286587	286592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972758
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6250	NC_009012	AT	3	6	286862	286867	50 %	50 %	0 %	0 %	125972759
6251	NC_009012	T	6	6	286939	286944	0 %	100 %	0 %	0 %	125972759
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