MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009012	A	6	6	252840	252845	100 %	0 %	0 %	0 %	125972732
5502	NC_009012	TG	3	6	252848	252853	0 %	50 %	50 %	0 %	125972732
5503	NC_009012	ATG	2	6	252864	252869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972732
5504	NC_009012	TTG	2	6	252897	252902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972732
5505	NC_009012	T	7	7	252913	252919	0 %	100 %	0 %	0 %	125972732
5506	NC_009012	GGT	2	6	252928	252933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972732
5507	NC_009012	ATGA	2	8	252971	252978	50 %	25 %	25 %	0 %	125972732
5508	NC_009012	TAA	2	6	253017	253022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972732
5509	NC_009012	GATG	2	8	253081	253088	25 %	25 %	50 %	0 %	125972732
5510	NC_009012	CAT	2	6	253103	253108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972732
5511	NC_009012	CGA	2	6	253117	253122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972732
5512	NC_009012	TCC	2	6	253126	253131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125972732
5513	NC_009012	T	6	6	253210	253215	0 %	100 %	0 %	0 %	125972732
5514	NC_009012	TGCCT	2	10	253217	253226	0 %	40 %	20 %	40 %	125972732
5515	NC_009012	TGT	2	6	253300	253305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972732
5516	NC_009012	GA	3	6	253317	253322	50 %	0 %	50 %	0 %	125972732
5517	NC_009012	CTT	2	6	253331	253336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972732
5518	NC_009012	AGA	2	6	253367	253372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972732
5519	NC_009012	CTT	2	6	253388	253393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972732
5520	NC_009012	GAAA	2	8	253403	253410	75 %	0 %	25 %	0 %	125972732
5521	NC_009012	GCG	2	6	253466	253471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972732
5522	NC_009012	ACGGC	2	10	253484	253493	20 %	0 %	40 %	40 %	125972732
5523	NC_009012	T	7	7	253506	253512	0 %	100 %	0 %	0 %	125972732
5524	NC_009012	AGAA	2	8	253570	253577	75 %	0 %	25 %	0 %	125972732
5525	NC_009012	GCA	2	6	253585	253590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972732
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5527	NC_009012	TGC	2	6	253693	253698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972732
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5529	NC_009012	GAG	2	6	253790	253795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972732
5530	NC_009012	GGA	2	6	253847	253852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972732
5531	NC_009012	GAT	2	6	253886	253891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972732
5532	NC_009012	GAG	2	6	253895	253900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972732
5533	NC_009012	AGA	2	6	253987	253992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972732
5534	NC_009012	CGG	2	6	254025	254030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972732
5535	NC_009012	A	6	6	254108	254113	100 %	0 %	0 %	0 %	125972732
5536	NC_009012	CAT	2	6	254114	254119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972732
5537	NC_009012	AT	3	6	254272	254277	50 %	50 %	0 %	0 %	125972732
5538	NC_009012	ATA	2	6	254321	254326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972732
5539	NC_009012	GA	3	6	254330	254335	50 %	0 %	50 %	0 %	125972732
5540	NC_009012	AAC	2	6	254338	254343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972732
5541	NC_009012	T	7	7	254463	254469	0 %	100 %	0 %	0 %	125972732
5542	NC_009012	ATA	2	6	254534	254539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972732
5543	NC_009012	ATA	2	6	254609	254614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972732
5544	NC_009012	GACGG	2	10	254619	254628	20 %	0 %	60 %	20 %	125972732
5545	NC_009012	TGA	2	6	254641	254646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972732
5546	NC_009012	CTTT	2	8	254648	254655	0 %	75 %	0 %	25 %	125972732
5547	NC_009012	GAG	2	6	254669	254674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972732
5548	NC_009012	A	8	8	254804	254811	100 %	0 %	0 %	0 %	125972732
5549	NC_009012	CAG	2	6	254846	254851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972732
5550	NC_009012	GATA	2	8	254869	254876	50 %	25 %	25 %	0 %	125972732
5551	NC_009012	TTC	2	6	254926	254931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_009012	CTT	2	6	254944	254949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_009012	TTA	2	6	254950	254955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_009012	ACA	2	6	254961	254966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_009012	GTTA	2	8	255010	255017	25 %	50 %	25 %	0 %	125972733
5556	NC_009012	TTG	2	6	255104	255109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972733
5557	NC_009012	TGA	2	6	255130	255135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972733
5558	NC_009012	A	7	7	255139	255145	100 %	0 %	0 %	0 %	125972733
5559	NC_009012	A	7	7	255163	255169	100 %	0 %	0 %	0 %	125972733
5560	NC_009012	ATA	2	6	255171	255176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972733
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5562	NC_009012	TGC	2	6	255217	255222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972733
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5574	NC_009012	T	7	7	255787	255793	0 %	100 %	0 %	0 %	125972734
5575	NC_009012	ATCTT	2	10	255895	255904	20 %	60 %	0 %	20 %	125972734
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5582	NC_009012	TA	3	6	256194	256199	50 %	50 %	0 %	0 %	125972734
5583	NC_009012	TTTG	2	8	256226	256233	0 %	75 %	25 %	0 %	125972734
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5593	NC_009012	AAT	2	6	256643	256648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_009012	T	6	6	256654	256659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_009012	T	6	6	256687	256692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_009012	TA	4	8	256789	256796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_009012	CCG	2	6	256842	256847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5598	NC_009012	AT	3	6	256861	256866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_009012	TTTA	2	8	256867	256874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_009012	TAT	2	6	256875	256880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_009012	T	6	6	256894	256899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5608	NC_009012	ACA	2	6	257288	257293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972735
5609	NC_009012	AGTTC	2	10	257343	257352	20 %	40 %	20 %	20 %	125972735
5610	NC_009012	CATA	2	8	257425	257432	50 %	25 %	0 %	25 %	125972735
5611	NC_009012	TA	3	6	257455	257460	50 %	50 %	0 %	0 %	125972735
5612	NC_009012	A	6	6	257479	257484	100 %	0 %	0 %	0 %	125972735
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5616	NC_009012	TCCTAC	3	18	257652	257669	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	125972735
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5619	NC_009012	TTC	2	6	257911	257916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_009012	ATAA	2	8	257927	257934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_009012	AAAT	2	8	257970	257977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_009012	TA	3	6	257989	257994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_009012	TTA	2	6	257998	258003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_009012	TTTA	2	8	258009	258016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_009012	AT	4	8	258066	258073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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