MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009012	A	6	6	228988	228993	100 %	0 %	0 %	0 %	125972714
5003	NC_009012	ATG	2	6	229048	229053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972714
5004	NC_009012	TCT	2	6	229161	229166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972714
5005	NC_009012	GAA	2	6	229198	229203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972714
5006	NC_009012	A	7	7	229202	229208	100 %	0 %	0 %	0 %	125972714
5007	NC_009012	TTA	2	6	229229	229234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972714
5008	NC_009012	TAA	2	6	229275	229280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972714
5009	NC_009012	GAA	2	6	229372	229377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972714
5010	NC_009012	TATT	2	8	229438	229445	25 %	75 %	0 %	0 %	125972714
5011	NC_009012	AGC	2	6	229486	229491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972714
5012	NC_009012	AGA	2	6	229533	229538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972714
5013	NC_009012	GATATG	2	12	229678	229689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972714
5014	NC_009012	TATAT	2	10	229696	229705	40 %	60 %	0 %	0 %	125972714
5015	NC_009012	CGG	2	6	229785	229790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972714
5016	NC_009012	ATG	3	9	229804	229812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972714
5017	NC_009012	ATGGTG	2	12	229877	229888	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	125972714
5018	NC_009012	TGTAT	2	10	229898	229907	20 %	60 %	20 %	0 %	125972714
5019	NC_009012	ATTT	2	8	230011	230018	25 %	75 %	0 %	0 %	125972714
5020	NC_009012	TTA	2	6	230147	230152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972714
5021	NC_009012	AGT	2	6	230172	230177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972714
5022	NC_009012	CGA	2	6	230234	230239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972714
5023	NC_009012	CGG	2	6	230340	230345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972714
5024	NC_009012	ATTA	2	8	230350	230357	50 %	50 %	0 %	0 %	125972714
5025	NC_009012	TTG	3	9	230421	230429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_009012	T	6	6	230465	230470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_009012	TAA	2	6	230556	230561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_009012	AATT	2	8	230595	230602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_009012	T	6	6	230695	230700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_009012	TA	3	6	230724	230729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_009012	ATT	2	6	230738	230743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_009012	G	6	6	230758	230763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_009012	A	7	7	230777	230783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_009012	TCT	2	6	230813	230818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972715
5035	NC_009012	T	6	6	230818	230823	0 %	100 %	0 %	0 %	125972715
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5038	NC_009012	TA	3	6	230945	230950	50 %	50 %	0 %	0 %	125972715
5039	NC_009012	AT	3	6	230962	230967	50 %	50 %	0 %	0 %	125972715
5040	NC_009012	TGA	2	6	230992	230997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972715
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5042	NC_009012	A	6	6	231167	231172	100 %	0 %	0 %	0 %	125972715
5043	NC_009012	ATG	2	6	231218	231223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972715
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5045	NC_009012	AT	3	6	231334	231339	50 %	50 %	0 %	0 %	125972715
5046	NC_009012	ATG	2	6	231372	231377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972715
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5055	NC_009012	ATAAA	2	10	231825	231834	80 %	20 %	0 %	0 %	125972715
5056	NC_009012	AAAG	2	8	231868	231875	75 %	0 %	25 %	0 %	125972715
5057	NC_009012	ATT	2	6	231901	231906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972715
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5070	NC_009012	TAA	2	6	232610	232615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_009012	A	7	7	232685	232691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_009012	A	6	6	232733	232738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_009012	TATC	2	8	233940	233947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_009012	TAG	2	6	233983	233988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_009012	GAT	2	6	234005	234010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5103	NC_009012	A	7	7	234086	234092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_009012	A	6	6	234126	234131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_009012	GTT	2	6	234132	234137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_009012	AATG	2	8	234143	234150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_009012	TCT	2	6	234266	234271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_009012	GTCG	2	8	234318	234325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5109	NC_009012	T	6	6	234383	234388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_009012	TGA	2	6	234467	234472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_009012	AAT	3	9	234483	234491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009012	T	6	6	234508	234513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_009012	AGT	2	6	234529	234534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5120	NC_009012	TTATT	2	10	234727	234736	20 %	80 %	0 %	0 %	125972717
5121	NC_009012	ATT	2	6	234815	234820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972717
5122	NC_009012	TTTA	2	8	234827	234834	25 %	75 %	0 %	0 %	125972717
5123	NC_009012	GGA	2	6	234879	234884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972717
5124	NC_009012	TAT	2	6	234896	234901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972717
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