MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008790	TTAAT	3	15	1863	1877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008790	TATCT	2	10	2419	2428	20 %	60 %	0 %	20 %	121999256
3	NC_008790	CGCTA	2	10	5286	5295	20 %	20 %	20 %	40 %	121999261
4	NC_008790	AAAGC	2	10	7020	7029	60 %	0 %	20 %	20 %	121999261
5	NC_008790	CAATT	2	10	8333	8342	40 %	40 %	0 %	20 %	121999261
6	NC_008790	AAAGC	2	10	9454	9463	60 %	0 %	20 %	20 %	121999261
7	NC_008790	ACTCA	2	10	10140	10149	40 %	20 %	0 %	40 %	121999261
8	NC_008790	CAAAA	2	10	10464	10473	80 %	0 %	0 %	20 %	121999262
9	NC_008790	ATTTA	2	10	11830	11839	40 %	60 %	0 %	0 %	121999263
10	NC_008790	ATGTT	2	10	13290	13299	20 %	60 %	20 %	0 %	121999265
11	NC_008790	AATTT	2	10	13455	13464	40 %	60 %	0 %	0 %	121999265
12	NC_008790	ATAAA	2	10	13509	13518	80 %	20 %	0 %	0 %	121999265
13	NC_008790	AAAAC	2	10	17732	17741	80 %	0 %	0 %	20 %	121999272
14	NC_008790	TTAAA	2	10	19539	19548	60 %	40 %	0 %	0 %	121999274
15	NC_008790	TTTTA	2	10	19849	19858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008790	TTTTC	2	10	20356	20365	0 %	80 %	0 %	20 %	121999275
17	NC_008790	GCCAA	2	10	20661	20670	40 %	0 %	20 %	40 %	121999276
18	NC_008790	TTAAT	2	10	21275	21284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008790	ATTTA	2	10	21296	21305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008790	TTGGC	2	10	25989	25998	0 %	40 %	40 %	20 %	121999282
21	NC_008790	TTTAT	2	10	28378	28387	20 %	80 %	0 %	0 %	121999286
22	NC_008790	TTGTA	2	10	30743	30752	20 %	60 %	20 %	0 %	121999289
23	NC_008790	TTTGT	2	10	32444	32453	0 %	80 %	20 %	0 %	121999291
24	NC_008790	TCTTA	2	10	33128	33137	20 %	60 %	0 %	20 %	121999291
25	NC_008790	TTATT	2	10	33398	33407	20 %	80 %	0 %	0 %	121999291
26	NC_008790	GTAAA	2	10	33998	34007	60 %	20 %	20 %	0 %	121999291
27	NC_008790	ATTTT	2	10	34439	34448	20 %	80 %	0 %	0 %	121999292
28	NC_008790	TGAAA	2	10	36642	36651	60 %	20 %	20 %	0 %	121999295
29	NC_008790	ATAAG	2	10	36972	36981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008790	AAAAT	2	10	38128	38137	80 %	20 %	0 %	0 %	121999296
31	NC_008790	TGACA	2	10	38717	38726	40 %	20 %	20 %	20 %	121999296
32	NC_008790	GCAAT	2	10	38891	38900	40 %	20 %	20 %	20 %	121999296
33	NC_008790	AAACA	2	10	39013	39022	80 %	0 %	0 %	20 %	121999296
34	NC_008790	GCAAT	2	10	39053	39062	40 %	20 %	20 %	20 %	121999296
35	NC_008790	TAAAA	2	10	40160	40169	80 %	20 %	0 %	0 %	121999297
36	NC_008790	ATTAA	2	10	40293	40302	60 %	40 %	0 %	0 %	121999297
37	NC_008790	TAATT	2	10	40316	40325	40 %	60 %	0 %	0 %	121999297
38	NC_008790	ATTTT	2	10	40864	40873	20 %	80 %	0 %	0 %	121999298
39	NC_008790	AAAGC	2	10	41707	41716	60 %	0 %	20 %	20 %	121999299
40	NC_008790	GAAAG	2	10	43631	43640	60 %	0 %	40 %	0 %	121999300
41	NC_008790	AGCAG	2	10	44000	44009	40 %	0 %	40 %	20 %	121999301
42	NC_008790	GCAGA	2	10	44146	44155	40 %	0 %	40 %	20 %	121999301
43	NC_008790	GCAGA	2	10	44170	44179	40 %	0 %	40 %	20 %	121999301
44	NC_008790	GTATT	2	10	44898	44907	20 %	60 %	20 %	0 %	121999303
45	NC_008790	TTTAC	2	10	44962	44971	20 %	60 %	0 %	20 %	121999303

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.