MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 1149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008770	GAT	2	6	17251	17256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582682
502	NC_008770	A	7	7	17295	17301	100 %	0 %	0 %	0 %	121582682
503	NC_008770	A	6	6	17329	17334	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
504	NC_008770	AAT	2	6	17380	17385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582683
505	NC_008770	A	7	7	17408	17414	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
506	NC_008770	A	7	7	17417	17423	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
507	NC_008770	CAA	2	6	17426	17431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582683
508	NC_008770	AAAG	2	8	17432	17439	75 %	0 %	25 %	0 %	121582683
509	NC_008770	A	6	6	17440	17445	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
510	NC_008770	GAA	2	6	17446	17451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582683
511	NC_008770	AT	3	6	17479	17484	50 %	50 %	0 %	0 %	121582683
512	NC_008770	AGA	2	6	17487	17492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582683
513	NC_008770	A	6	6	17499	17504	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
514	NC_008770	ATT	2	6	17563	17568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582683
515	NC_008770	AGA	2	6	17571	17576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582683
516	NC_008770	AAG	2	6	17633	17638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582683
517	NC_008770	A	7	7	17664	17670	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
518	NC_008770	A	8	8	17710	17717	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
519	NC_008770	A	6	6	17722	17727	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
520	NC_008770	GTT	2	6	17728	17733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582683
521	NC_008770	A	6	6	17762	17767	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
522	NC_008770	GCTTAT	2	12	17806	17817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121582683
523	NC_008770	T	6	6	17828	17833	0 %	100 %	0 %	0 %	121582683
524	NC_008770	A	6	6	17844	17849	100 %	0 %	0 %	0 %	121582683
525	NC_008770	TTTA	2	8	17850	17857	25 %	75 %	0 %	0 %	121582683
526	NC_008770	TAA	2	6	17892	17897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582683
527	NC_008770	AT	3	6	17952	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008770	AGTT	2	8	17966	17973	25 %	50 %	25 %	0 %	121582684
529	NC_008770	AACT	2	8	17978	17985	50 %	25 %	0 %	25 %	121582684
530	NC_008770	G	11	11	18007	18017	0 %	0 %	100 %	0 %	121582684
531	NC_008770	TCT	3	9	18036	18044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582684
532	NC_008770	T	6	6	18051	18056	0 %	100 %	0 %	0 %	121582684
533	NC_008770	TCTTT	2	10	18076	18085	0 %	80 %	0 %	20 %	121582684
534	NC_008770	GTAAAA	2	12	18103	18114	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121582684
535	NC_008770	CCTTGT	2	12	18130	18141	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	121582684
536	NC_008770	TCTTTT	2	12	18151	18162	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	121582684
537	NC_008770	ATT	2	6	18186	18191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582684
538	NC_008770	AAT	2	6	18219	18224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582684
539	NC_008770	T	6	6	18343	18348	0 %	100 %	0 %	0 %	121582684
540	NC_008770	TATT	2	8	18352	18359	25 %	75 %	0 %	0 %	121582684
541	NC_008770	T	6	6	18455	18460	0 %	100 %	0 %	0 %	121582684
542	NC_008770	A	6	6	18490	18495	100 %	0 %	0 %	0 %	121582684
543	NC_008770	ATT	2	6	18555	18560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582684
544	NC_008770	CTA	2	6	18578	18583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582684
545	NC_008770	T	7	7	18599	18605	0 %	100 %	0 %	0 %	121582684
546	NC_008770	T	7	7	18607	18613	0 %	100 %	0 %	0 %	121582684
547	NC_008770	A	6	6	18622	18627	100 %	0 %	0 %	0 %	121582684
548	NC_008770	GAAA	2	8	18642	18649	75 %	0 %	25 %	0 %	121582684
549	NC_008770	ATA	2	6	18696	18701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582684
550	NC_008770	TTAT	2	8	18787	18794	25 %	75 %	0 %	0 %	121582684
551	NC_008770	CTTTGT	2	12	18817	18828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
552	NC_008770	ACTT	2	8	18853	18860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_008770	AAAAT	2	10	18896	18905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008770	TA	3	6	18930	18935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008770	T	7	7	18974	18980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008770	A	8	8	18983	18990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008770	TAA	2	6	18994	18999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008770	TTTATA	2	12	19012	19023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008770	TTTATT	2	12	19106	19117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008770	T	6	6	19225	19230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008770	ATTA	2	8	19415	19422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008770	TAT	2	6	19425	19430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008770	ATTTT	2	10	19435	19444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008770	TTA	2	6	19455	19460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008770	T	8	8	19467	19474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008770	TAA	2	6	19530	19535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008770	A	21	21	19544	19564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008770	T	6	6	19575	19580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008770	T	6	6	19588	19593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008770	T	6	6	19595	19600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008770	T	6	6	19611	19616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008770	T	6	6	19643	19648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008770	T	6	6	19673	19678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008770	T	6	6	19683	19688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008770	T	8	8	19729	19736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008770	A	6	6	19737	19742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008770	T	6	6	19748	19753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008770	ATT	2	6	19767	19772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008770	T	7	7	19771	19777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008770	TTTGT	2	10	19797	19806	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008770	TATTTT	2	12	19824	19835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008770	TATT	2	8	19897	19904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008770	ATT	2	6	19908	19913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008770	GAA	2	6	19933	19938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
585	NC_008770	AGA	2	6	19944	19949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
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591	NC_008770	TAA	2	6	20070	20075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582685
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593	NC_008770	AAG	2	6	20105	20110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
594	NC_008770	AGA	2	6	20145	20150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
595	NC_008770	AAG	2	6	20159	20164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
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598	NC_008770	ACA	2	6	20236	20241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582685
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600	NC_008770	AAG	2	6	20291	20296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
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603	NC_008770	AGA	2	6	20394	20399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
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605	NC_008770	AAG	2	6	20456	20461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
606	NC_008770	ATG	2	6	20465	20470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582685
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608	NC_008770	GAA	2	6	20521	20526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
609	NC_008770	A	6	6	20525	20530	100 %	0 %	0 %	0 %	121582685
610	NC_008770	TCT	2	6	20571	20576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582685
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614	NC_008770	TGA	2	6	20667	20672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582685
615	NC_008770	AGA	2	6	20688	20693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582685
616	NC_008770	AAATT	2	10	20695	20704	60 %	40 %	0 %	0 %	121582685
617	NC_008770	A	6	6	20720	20725	100 %	0 %	0 %	0 %	121582685
618	NC_008770	TTA	2	6	20747	20752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582685
619	NC_008770	TCA	2	6	20760	20765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582685
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621	NC_008770	TAT	2	6	20821	20826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582685
622	NC_008770	A	6	6	20844	20849	100 %	0 %	0 %	0 %	121582685
623	NC_008770	A	6	6	20855	20860	100 %	0 %	0 %	0 %	121582685
624	NC_008770	AT	3	6	20892	20897	50 %	50 %	0 %	0 %	121582685
625	NC_008770	A	6	6	20944	20949	100 %	0 %	0 %	0 %	121582685
626	NC_008770	AAAC	2	8	20953	20960	75 %	0 %	0 %	25 %	121582685
627	NC_008770	A	7	7	20962	20968	100 %	0 %	0 %	0 %	121582685
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631	NC_008770	A	8	8	21051	21058	100 %	0 %	0 %	0 %	121582685
632	NC_008770	T	6	6	21066	21071	0 %	100 %	0 %	0 %	121582686
633	NC_008770	CTTTT	2	10	21072	21081	0 %	80 %	0 %	20 %	121582686
634	NC_008770	T	6	6	21078	21083	0 %	100 %	0 %	0 %	121582686
635	NC_008770	ATT	2	6	21092	21097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582686
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