MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	TCAAA	2	10	206	215	60 %	20 %	0 %	20 %	118602061
2	NC_008610	CACAA	2	10	226	235	60 %	0 %	0 %	40 %	118602061
3	NC_008610	AGGAA	2	10	632	641	60 %	0 %	40 %	0 %	118602061
4	NC_008610	ATTAT	2	10	2763	2772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008610	ATTTA	2	10	2819	2828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008610	GGCAT	2	10	4683	4692	20 %	20 %	40 %	20 %	118602063
7	NC_008610	GAAAA	2	10	5061	5070	80 %	0 %	20 %	0 %	118602063
8	NC_008610	AGAAA	2	10	5472	5481	80 %	0 %	20 %	0 %	118602064
9	NC_008610	TTTCT	2	10	5579	5588	0 %	80 %	0 %	20 %	118602064
10	NC_008610	AAACA	2	10	6116	6125	80 %	0 %	0 %	20 %	118602064
11	NC_008610	CCGTA	2	10	8361	8370	20 %	20 %	20 %	40 %	118602065
12	NC_008610	AATCG	2	10	8629	8638	40 %	20 %	20 %	20 %	118602065
13	NC_008610	CCAAT	2	10	8681	8690	40 %	20 %	0 %	40 %	118602065
14	NC_008610	CAATT	2	10	11496	11505	40 %	40 %	0 %	20 %	118602068
15	NC_008610	TTTGT	2	10	12195	12204	0 %	80 %	20 %	0 %	118602069
16	NC_008610	TTGAT	2	10	15010	15019	20 %	60 %	20 %	0 %	118602072
17	NC_008610	AGGCG	2	10	16986	16995	20 %	0 %	60 %	20 %	118602073
18	NC_008610	AATGG	2	10	17894	17903	40 %	20 %	40 %	0 %	118602074
19	NC_008610	GGATT	2	10	18410	18419	20 %	40 %	40 %	0 %	118602074
20	NC_008610	TCTGC	2	10	19056	19065	0 %	40 %	20 %	40 %	118602075
21	NC_008610	TTTTG	2	10	19418	19427	0 %	80 %	20 %	0 %	118602075
22	NC_008610	CCAAT	2	10	22257	22266	40 %	20 %	0 %	40 %	118602077
23	NC_008610	TTGTC	2	10	23858	23867	0 %	60 %	20 %	20 %	118602078
24	NC_008610	AGGTT	2	10	24510	24519	20 %	40 %	40 %	0 %	118602079
25	NC_008610	TTGGA	2	10	24744	24753	20 %	40 %	40 %	0 %	118602079
26	NC_008610	ATATG	2	10	25666	25675	40 %	40 %	20 %	0 %	118602081
27	NC_008610	GCAGT	2	10	26030	26039	20 %	20 %	40 %	20 %	118602081
28	NC_008610	CCAAA	2	10	26698	26707	60 %	0 %	0 %	40 %	118602082
29	NC_008610	TGTAA	2	10	27958	27967	40 %	40 %	20 %	0 %	118602083
30	NC_008610	ATGCT	2	10	28909	28918	20 %	40 %	20 %	20 %	118602083
31	NC_008610	TTGAT	2	10	29095	29104	20 %	60 %	20 %	0 %	118602084
32	NC_008610	AGTCA	2	10	29250	29259	40 %	20 %	20 %	20 %	118602084
33	NC_008610	AAGTC	2	10	30111	30120	40 %	20 %	20 %	20 %	118602085
34	NC_008610	ACAGT	2	10	31912	31921	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008610	AAATC	2	10	32193	32202	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008610	TAAAT	2	10	33640	33649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008610	GCTAT	2	10	36057	36066	20 %	40 %	20 %	20 %	118602089
38	NC_008610	GAAAA	2	10	38429	38438	80 %	0 %	20 %	0 %	118602092
39	NC_008610	TATTC	2	10	41815	41824	20 %	60 %	0 %	20 %	118602094
40	NC_008610	TCGTT	2	10	42859	42868	0 %	60 %	20 %	20 %	118602096
41	NC_008610	AAATG	2	10	46697	46706	60 %	20 %	20 %	0 %	118602099
42	NC_008610	TTGGT	2	10	47115	47124	0 %	60 %	40 %	0 %	118602100
43	NC_008610	TGAGT	2	10	49262	49271	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008610	TGGCT	2	10	50953	50962	0 %	40 %	40 %	20 %	118602102
45	NC_008610	CTTTC	2	10	51542	51551	0 %	60 %	0 %	40 %	118602102
46	NC_008610	AAATA	2	10	51766	51775	80 %	20 %	0 %	0 %	118602102
47	NC_008610	AATGC	2	10	53089	53098	40 %	20 %	20 %	20 %	118602103
48	NC_008610	TATAA	2	10	53492	53501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008610	TTGGG	2	10	54681	54690	0 %	40 %	60 %	0 %	118602104
50	NC_008610	TAAAA	2	10	57709	57718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008610	GATGC	2	10	58500	58509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008610	ACACT	2	10	59035	59044	40 %	20 %	0 %	40 %	118602108
53	NC_008610	ATATC	2	10	59787	59796	40 %	40 %	0 %	20 %	118602109
54	NC_008610	GTACT	2	10	64023	64032	20 %	40 %	20 %	20 %	118602112
55	NC_008610	ACATT	2	10	64518	64527	40 %	40 %	0 %	20 %	118602112
56	NC_008610	CAACA	2	10	67785	67794	60 %	0 %	0 %	40 %	118602115
57	NC_008610	TTCGC	2	10	68722	68731	0 %	40 %	20 %	40 %	118602116
58	NC_008610	TGGAT	2	10	68788	68797	20 %	40 %	40 %	0 %	118602116
59	NC_008610	GAACG	2	10	69600	69609	40 %	0 %	40 %	20 %	118602117
60	NC_008610	TTTGC	2	10	70145	70154	0 %	60 %	20 %	20 %	118602117
61	NC_008610	CTAAC	2	10	72804	72813	40 %	20 %	0 %	40 %	118602119
62	NC_008610	ATGGT	2	10	72909	72918	20 %	40 %	40 %	0 %	118602119
63	NC_008610	GATGC	2	10	73131	73140	20 %	20 %	40 %	20 %	118602119
64	NC_008610	TTGGT	2	10	75038	75047	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008610	ATAAA	2	10	75139	75148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008610	TTCAA	2	10	78131	78140	40 %	40 %	0 %	20 %	118602123
67	NC_008610	AAGTA	2	10	78907	78916	60 %	20 %	20 %	0 %	118602123
68	NC_008610	TTTTA	2	10	78966	78975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008610	TGATT	2	10	80231	80240	20 %	60 %	20 %	0 %	118602124
70	NC_008610	GTTTT	2	10	81773	81782	0 %	80 %	20 %	0 %	118602126
71	NC_008610	ATTTA	2	10	82164	82173	40 %	60 %	0 %	0 %	118602126
72	NC_008610	ACAAA	2	10	82218	82227	80 %	0 %	0 %	20 %	118602126
73	NC_008610	ATAGA	2	10	82298	82307	60 %	20 %	20 %	0 %	118602127
74	NC_008610	TTTTG	2	10	84097	84106	0 %	80 %	20 %	0 %	118602129
75	NC_008610	TATTT	2	10	84556	84565	20 %	80 %	0 %	0 %	118602129
76	NC_008610	TTATT	2	10	85290	85299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008610	TTAAC	2	10	85416	85425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008610	AAGAA	2	10	85450	85459	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008610	TGATA	2	10	86404	86413	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008610	TACTT	2	10	86611	86620	20 %	60 %	0 %	20 %	118602131
81	NC_008610	TGAAA	2	10	87393	87402	60 %	20 %	20 %	0 %	118602131
82	NC_008610	ATTAT	2	10	88376	88385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008610	TAGAA	2	10	88442	88451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008610	AAGCA	2	10	88943	88952	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008610	AGCAC	2	10	90365	90374	40 %	0 %	20 %	40 %	118602133
86	NC_008610	AGCCT	2	10	90678	90687	20 %	20 %	20 %	40 %	118602133
87	NC_008610	CTTAT	2	10	90951	90960	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008610	AAAAC	2	10	91064	91073	80 %	0 %	0 %	20 %	118602134
89	NC_008610	TTGCC	2	10	91735	91744	0 %	40 %	20 %	40 %	118602134
90	NC_008610	ACAAA	2	10	93261	93270	80 %	0 %	0 %	20 %	118602134
91	NC_008610	TGGGT	2	10	97678	97687	0 %	40 %	60 %	0 %	118602136
92	NC_008610	AAAGG	2	10	100063	100072	60 %	0 %	40 %	0 %	118602138
93	NC_008610	GTTTA	2	10	103439	103448	20 %	60 %	20 %	0 %	118602141
94	NC_008610	GTATG	2	10	104928	104937	20 %	40 %	40 %	0 %	118602143
95	NC_008610	TGTAT	2	10	106473	106482	20 %	60 %	20 %	0 %	118602144
96	NC_008610	AAGTT	2	10	106978	106987	40 %	40 %	20 %	0 %	118602145
97	NC_008610	TAGAA	2	10	107864	107873	60 %	20 %	20 %	0 %	118602147
98	NC_008610	ATAGC	2	10	108355	108364	40 %	20 %	20 %	20 %	118602147
99	NC_008610	ATAAA	2	10	108645	108654	80 %	20 %	0 %	0 %	118602147
100	NC_008610	TTCTT	2	10	110012	110021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008610	TGGTT	2	10	110305	110314	0 %	60 %	40 %	0 %	118602148
102	NC_008610	GAATT	2	10	111532	111541	40 %	40 %	20 %	0 %	118602149
103	NC_008610	AATTA	2	10	113283	113292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008610	ACTAG	2	10	113652	113661	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008610	TGGTG	2	10	114443	114452	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008610	AATTA	2	10	118600	118609	60 %	40 %	0 %	0 %	118602152
107	NC_008610	ATAAA	2	10	120938	120947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008610	ATTTA	2	10	121146	121155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008610	TTAAT	2	10	121448	121457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008610	ATTAA	2	10	124754	124763	60 %	40 %	0 %	0 %	118602155
111	NC_008610	GTGTT	2	10	125469	125478	0 %	60 %	40 %	0 %	118602157
112	NC_008610	AAACA	2	10	126222	126231	80 %	0 %	0 %	20 %	118602158
113	NC_008610	ATTTT	2	10	127608	127617	20 %	80 %	0 %	0 %	118602159
114	NC_008610	ACAAA	2	10	129648	129657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008610	ATTGC	2	10	129900	129909	20 %	40 %	20 %	20 %	118602161
116	NC_008610	TCTTG	2	10	130380	130389	0 %	60 %	20 %	20 %	118602161
117	NC_008610	GGCTG	2	10	130755	130764	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008610	TGATT	2	10	134170	134179	20 %	60 %	20 %	0 %	118602165
119	NC_008610	CTTTT	2	10	134850	134859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008610	ATTTA	2	10	135690	135699	40 %	60 %	0 %	0 %	118602167
121	NC_008610	TGATT	2	10	136712	136721	20 %	60 %	20 %	0 %	118602168
122	NC_008610	TAATA	2	10	136827	136836	60 %	40 %	0 %	0 %	118602168
123	NC_008610	TATTG	2	10	136956	136965	20 %	60 %	20 %	0 %	118602169
124	NC_008610	CAATT	2	10	138158	138167	40 %	40 %	0 %	20 %	118602170
125	NC_008610	TAAAG	2	10	138965	138974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008610	TTAAA	2	10	139899	139908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008610	TTAAA	2	10	140109	140118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008610	AGTTT	2	10	143349	143358	20 %	60 %	20 %	0 %	118602173
129	NC_008610	ATCTA	2	10	144476	144485	40 %	40 %	0 %	20 %	118602174
130	NC_008610	ATGTT	2	10	145858	145867	20 %	60 %	20 %	0 %	118602175
131	NC_008610	CATTG	2	10	146550	146559	20 %	40 %	20 %	20 %	118602176
132	NC_008610	TTTGG	2	10	146929	146938	0 %	60 %	40 %	0 %	118602176
133	NC_008610	TATTT	2	10	147204	147213	20 %	80 %	0 %	0 %	118602176
134	NC_008610	AGAAA	2	10	148709	148718	80 %	0 %	20 %	0 %	118602178
135	NC_008610	AATTA	2	10	149227	149236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008610	CTTAC	2	10	149732	149741	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_008610	AAGCC	2	10	151614	151623	40 %	0 %	20 %	40 %	118602180
138	NC_008610	TTCAT	2	10	152507	152516	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008610	AAAAG	2	10	153229	153238	80 %	0 %	20 %	0 %	118602181
140	NC_008610	TGCCT	2	10	156727	156736	0 %	40 %	20 %	40 %	118602183
141	NC_008610	CAATC	2	10	157788	157797	40 %	20 %	0 %	40 %	118602184
142	NC_008610	ATAAA	2	10	158174	158183	80 %	20 %	0 %	0 %	118602184
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145	NC_008610	ATTTT	2	10	160752	160761	20 %	80 %	0 %	0 %	118602186
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148	NC_008610	GATTT	2	10	164670	164679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008610	ATCAT	2	10	166242	166251	40 %	40 %	0 %	20 %	118602191
150	NC_008610	TTTGG	2	10	169286	169295	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008610	TGAAT	2	10	169307	169316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008610	TAAAT	2	10	170163	170172	60 %	40 %	0 %	0 %	118602194
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158	NC_008610	TTGTT	2	10	180547	180556	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008610	CACTT	2	10	182714	182723	20 %	40 %	0 %	40 %	118602204
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162	NC_008610	TGGCA	2	10	185186	185195	20 %	20 %	40 %	20 %	118602205
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180	NC_008610	TAAAA	2	10	205942	205951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_008610	TTTAT	2	10	206545	206554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008610	TAAAA	2	10	207413	207422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008610	TTAAC	2	10	209310	209319	40 %	40 %	0 %	20 %	118602241
184	NC_008610	TATTG	2	10	210982	210991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_008610	TATCT	2	10	211178	211187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_008610	AATTA	2	10	211199	211208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008610	ATTTA	2	10	211486	211495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_008610	TTTAG	2	10	212045	212054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_008610	AAATC	2	10	218054	218063	60 %	20 %	0 %	20 %	118602249
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198	NC_008610	ATTGT	2	10	223704	223713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
199	NC_008610	ATTTG	2	10	224924	224933	20 %	60 %	20 %	0 %	118602253
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204	NC_008610	ATTTG	2	10	229942	229951	20 %	60 %	20 %	0 %	118602256
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212	NC_008610	ATGAT	2	10	243629	243638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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215	NC_008610	TTATC	2	10	248618	248627	20 %	60 %	0 %	20 %	118602273
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251	NC_008610	TGCAA	2	10	293679	293688	40 %	20 %	20 %	20 %	118602307
252	NC_008610	TTTTA	2	10	293821	293830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_008610	AATTG	2	10	295222	295231	40 %	40 %	20 %	0 %	118602308
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259	NC_008610	CTTAT	2	10	303109	303118	20 %	60 %	0 %	20 %	118602315
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261	NC_008610	TAAAA	2	10	309114	309123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_008610	AATGA	2	10	309763	309772	60 %	20 %	20 %	0 %	118602321
263	NC_008610	TTCTT	2	10	310303	310312	0 %	80 %	0 %	20 %	118602322
264	NC_008610	TAAAA	2	10	310476	310485	80 %	20 %	0 %	0 %	118602322
265	NC_008610	TAAAA	2	10	310729	310738	80 %	20 %	0 %	0 %	118602322
266	NC_008610	GTTTT	2	10	313229	313238	0 %	80 %	20 %	0 %	118602327
267	NC_008610	TCTGC	2	10	313346	313355	0 %	40 %	20 %	40 %	118602327
268	NC_008610	TAATT	2	10	314582	314591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_008610	GCGTT	2	10	315558	315567	0 %	40 %	40 %	20 %	118602328
270	NC_008610	TTTTG	2	10	318699	318708	0 %	80 %	20 %	0 %	118602331
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272	NC_008610	TTAAT	2	10	319579	319588	40 %	60 %	0 %	0 %	118602332
273	NC_008610	TGGTT	2	10	322246	322255	0 %	60 %	40 %	0 %	118602334
274	NC_008610	TTGTG	2	10	324207	324216	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_008610	TTTCA	2	10	324363	324372	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
276	NC_008610	TCATT	2	10	325439	325448	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
277	NC_008610	TGATT	2	10	329576	329585	20 %	60 %	20 %	0 %	118602339
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282	NC_008610	ATTTT	2	10	333039	333048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_008610	TTTTA	2	10	333886	333895	20 %	80 %	0 %	0 %	118602341
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286	NC_008610	TCTTT	2	10	338288	338297	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_008610	TTTTC	2	10	339106	339115	0 %	80 %	0 %	20 %	118602346
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291	NC_008610	TAAAA	2	10	343347	343356	80 %	20 %	0 %	0 %	118602349
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297	NC_008610	TCTAG	2	10	353271	353280	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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303	NC_008610	TATTT	2	10	357167	357176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_008610	TGGCA	2	10	459141	459150	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_008610	TTAAT	2	10	462182	462191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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