MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 27349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_008610	TAA	2	6	1146991	1146996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118603026
27003	NC_008610	A	6	6	1147010	1147015	100 %	0 %	0 %	0 %	118603026
27004	NC_008610	A	6	6	1147098	1147103	100 %	0 %	0 %	0 %	118603026
27005	NC_008610	ACT	2	6	1147181	1147186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118603026
27006	NC_008610	AAC	2	6	1147221	1147226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118603026
27007	NC_008610	ATT	2	6	1147274	1147279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118603026
27008	NC_008610	T	8	8	1147278	1147285	0 %	100 %	0 %	0 %	118603026
27009	NC_008610	T	6	6	1147306	1147311	0 %	100 %	0 %	0 %	118603026
27010	NC_008610	AT	3	6	1147360	1147365	50 %	50 %	0 %	0 %	118603026
27011	NC_008610	T	7	7	1147438	1147444	0 %	100 %	0 %	0 %	118603026
27012	NC_008610	A	6	6	1147457	1147462	100 %	0 %	0 %	0 %	118603026
27013	NC_008610	CAA	3	9	1147500	1147508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118603026
27014	NC_008610	GCT	2	6	1147526	1147531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118603026
27015	NC_008610	GTT	2	6	1147594	1147599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118603026
27016	NC_008610	AAG	2	6	1147611	1147616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118603026
27017	NC_008610	TAT	3	9	1147650	1147658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118603026
27018	NC_008610	TTA	2	6	1147670	1147675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118603026
27019	NC_008610	AGA	2	6	1147744	1147749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118603026
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27021	NC_008610	A	6	6	1147788	1147793	100 %	0 %	0 %	0 %	118603026
27022	NC_008610	CTGC	2	8	1147835	1147842	0 %	25 %	25 %	50 %	118603026
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27024	NC_008610	AT	3	6	1148154	1148159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27025	NC_008610	AT	3	6	1148171	1148176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27026	NC_008610	TA	3	6	1148181	1148186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27027	NC_008610	T	6	6	1148206	1148211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27028	NC_008610	T	7	7	1148213	1148219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27038	NC_008610	TAAAC	2	10	1148902	1148911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27039	NC_008610	TTG	2	6	1148932	1148937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118603028
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27042	NC_008610	AT	3	6	1149073	1149078	50 %	50 %	0 %	0 %	118603028
27043	NC_008610	ATTG	2	8	1149182	1149189	25 %	50 %	25 %	0 %	118603028
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27056	NC_008610	TGA	4	12	1149835	1149846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118603029
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27059	NC_008610	TGA	2	6	1149880	1149885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118603029
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27069	NC_008610	ATTT	2	8	1150607	1150614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27070	NC_008610	ATT	3	9	1150628	1150636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27073	NC_008610	ATT	3	9	1150661	1150669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118603030
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.