MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 27349

< Previous12345678910111213...5455Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008610	A	6	6	42464	42469	100 %	0 %	0 %	0 %	118602095
1002	NC_008610	TAA	2	6	42487	42492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602095
1003	NC_008610	T	7	7	42592	42598	0 %	100 %	0 %	0 %	118602095
1004	NC_008610	A	6	6	42612	42617	100 %	0 %	0 %	0 %	118602095
1005	NC_008610	A	6	6	42624	42629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008610	GAAC	2	8	42633	42640	50 %	0 %	25 %	25 %	118602096
1007	NC_008610	ATT	2	6	42644	42649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602096
1008	NC_008610	ATT	2	6	42676	42681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602096
1009	NC_008610	TGT	2	6	42788	42793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602096
1010	NC_008610	GAAA	2	8	42816	42823	75 %	0 %	25 %	0 %	118602096
1011	NC_008610	ACA	2	6	42839	42844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602096
1012	NC_008610	TCGTT	2	10	42859	42868	0 %	60 %	20 %	20 %	118602096
1013	NC_008610	T	6	6	42887	42892	0 %	100 %	0 %	0 %	118602096
1014	NC_008610	T	6	6	42904	42909	0 %	100 %	0 %	0 %	118602096
1015	NC_008610	T	6	6	42916	42921	0 %	100 %	0 %	0 %	118602096
1016	NC_008610	GGT	2	6	42964	42969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602096
1017	NC_008610	ATA	3	9	42974	42982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602096
1018	NC_008610	GGC	2	6	43022	43027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118602096
1019	NC_008610	ATT	4	12	43131	43142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602096
1020	NC_008610	ATC	2	6	43187	43192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602096
1021	NC_008610	TAA	2	6	43194	43199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602096
1022	NC_008610	ATT	2	6	43201	43206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602096
1023	NC_008610	GGCT	2	8	43207	43214	0 %	25 %	50 %	25 %	118602096
1024	NC_008610	CCA	2	6	43220	43225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602096
1025	NC_008610	ATG	2	6	43283	43288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602096
1026	NC_008610	GTTT	2	8	43487	43494	0 %	75 %	25 %	0 %	118602096
1027	NC_008610	ATT	3	9	43588	43596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008610	ATT	2	6	43603	43608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008610	TAGGTT	2	12	43628	43639	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008610	ATG	2	6	43780	43785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602097
1031	NC_008610	TGA	2	6	43892	43897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602097
1032	NC_008610	CAA	2	6	43932	43937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602097
1033	NC_008610	TAAA	2	8	43975	43982	75 %	25 %	0 %	0 %	118602097
1034	NC_008610	TTTA	2	8	44031	44038	25 %	75 %	0 %	0 %	118602097
1035	NC_008610	TTA	2	6	44069	44074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602097
1036	NC_008610	A	6	6	44238	44243	100 %	0 %	0 %	0 %	118602097
1037	NC_008610	ATT	2	6	44322	44327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602097
1038	NC_008610	T	6	6	44366	44371	0 %	100 %	0 %	0 %	118602097
1039	NC_008610	TAT	2	6	44456	44461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602097
1040	NC_008610	TTG	2	6	44472	44477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602097
1041	NC_008610	A	8	8	44480	44487	100 %	0 %	0 %	0 %	118602097
1042	NC_008610	A	8	8	44489	44496	100 %	0 %	0 %	0 %	118602097
1043	NC_008610	TTGA	2	8	44497	44504	25 %	50 %	25 %	0 %	118602097
1044	NC_008610	TGA	2	6	44616	44621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602098
1045	NC_008610	GTT	2	6	44648	44653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602098
1046	NC_008610	TAT	2	6	44665	44670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602098
1047	NC_008610	TTTA	2	8	44679	44686	25 %	75 %	0 %	0 %	118602098
1048	NC_008610	GTA	2	6	44687	44692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602098
1049	NC_008610	ACT	2	6	44698	44703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602098
1050	NC_008610	TGG	2	6	44824	44829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602098
1051	NC_008610	TTAT	2	8	45040	45047	25 %	75 %	0 %	0 %	118602098
1052	NC_008610	TAT	2	6	45055	45060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602098
1053	NC_008610	T	6	6	45116	45121	0 %	100 %	0 %	0 %	118602098
1054	NC_008610	ATG	2	6	45128	45133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602098
1055	NC_008610	TAA	2	6	45160	45165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602098
1056	NC_008610	T	6	6	45204	45209	0 %	100 %	0 %	0 %	118602098
1057	NC_008610	GTG	3	9	45235	45243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602098
1058	NC_008610	CAG	2	6	45273	45278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602098
1059	NC_008610	TAT	2	6	45289	45294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602098
1060	NC_008610	TAT	2	6	45296	45301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602098
1061	NC_008610	TA	3	6	45328	45333	50 %	50 %	0 %	0 %	118602098
1062	NC_008610	CAA	2	6	45447	45452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602098
1063	NC_008610	ATT	2	6	45467	45472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602098
1064	NC_008610	CAT	2	6	45474	45479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602098
1065	NC_008610	GCG	2	6	45483	45488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118602098
1066	NC_008610	T	6	6	45553	45558	0 %	100 %	0 %	0 %	118602098
1067	NC_008610	GGC	2	6	45610	45615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118602098
1068	NC_008610	TGG	2	6	45696	45701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602098
1069	NC_008610	CAG	2	6	45702	45707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602098
1070	NC_008610	A	6	6	45729	45734	100 %	0 %	0 %	0 %	118602098
1071	NC_008610	GGT	2	6	45799	45804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602098
1072	NC_008610	CAT	2	6	45832	45837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602098
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1074	NC_008610	TTA	2	6	45919	45924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602098
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1076	NC_008610	ATTAGT	2	12	45949	45960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602098
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1078	NC_008610	TAAA	2	8	46054	46061	75 %	25 %	0 %	0 %	118602099
1079	NC_008610	AAAG	2	8	46068	46075	75 %	0 %	25 %	0 %	118602099
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1081	NC_008610	CT	3	6	46260	46265	0 %	50 %	0 %	50 %	118602099
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1085	NC_008610	CA	4	8	46613	46620	50 %	0 %	0 %	50 %	118602099
1086	NC_008610	AAATG	2	10	46697	46706	60 %	20 %	20 %	0 %	118602099
1087	NC_008610	TGG	2	6	46714	46719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602099
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1089	NC_008610	AG	3	6	46773	46778	50 %	0 %	50 %	0 %	118602099
1090	NC_008610	CCCTAG	2	12	46785	46796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_008610	ATT	2	6	46823	46828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008610	TAT	2	6	46836	46841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008610	A	6	6	46873	46878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008610	A	6	6	46883	46888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008610	AAT	2	6	46941	46946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602100
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1098	NC_008610	AG	3	6	47017	47022	50 %	0 %	50 %	0 %	118602100
1099	NC_008610	AAT	2	6	47026	47031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602100
1100	NC_008610	CCA	2	6	47035	47040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602100
1101	NC_008610	TA	3	6	47060	47065	50 %	50 %	0 %	0 %	118602100
1102	NC_008610	CTA	2	6	47097	47102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602100
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1104	NC_008610	ATA	2	6	47129	47134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602100
1105	NC_008610	ATGA	2	8	47167	47174	50 %	25 %	25 %	0 %	118602100
1106	NC_008610	A	6	6	47204	47209	100 %	0 %	0 %	0 %	118602100
1107	NC_008610	AGA	2	6	47250	47255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602100
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1110	NC_008610	TGA	3	9	47379	47387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602100
1111	NC_008610	T	6	6	47505	47510	0 %	100 %	0 %	0 %	118602100
1112	NC_008610	ATCCAG	2	12	47540	47551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602100
1113	NC_008610	TA	3	6	47564	47569	50 %	50 %	0 %	0 %	118602100
1114	NC_008610	ATT	2	6	47619	47624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602100
1115	NC_008610	AAGT	2	8	47717	47724	50 %	25 %	25 %	0 %	118602100
1116	NC_008610	A	6	6	47794	47799	100 %	0 %	0 %	0 %	118602100
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1119	NC_008610	TAT	2	6	47863	47868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008610	TTA	2	6	47875	47880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008610	TTA	2	6	47887	47892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008610	T	6	6	47999	48004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008610	A	7	7	48091	48097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008610	CTAC	2	8	48121	48128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_008610	TAA	2	6	48143	48148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008610	ATT	2	6	48149	48154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008610	T	6	6	48159	48164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008610	ATG	3	9	48171	48179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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